67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3218 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3218  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  568  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368988  normal  0.343443 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1594  hypothetical protein  37.5 
 
 
327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.473332 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0985  hypothetical protein  33.62 
 
 
347 aa  137  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4028  cell division protein  35.05 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1153  hypothetical protein  36.76 
 
 
317 aa  133  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.377262  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1996  hypothetical protein  33.47 
 
 
333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1922  hypothetical protein  33.47 
 
 
333 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2984  protein of unknown function DUF214  38.14 
 
 
323 aa  130  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.620769  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5217  protein of unknown function DUF214  38.68 
 
 
328 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.339696  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3866  cell division protein  32.74 
 
 
337 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546597  normal  0.0832044 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2981  hypothetical protein  37.83 
 
 
322 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.645053  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3573  cell division protein  31.7 
 
 
337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2194  hypothetical protein  37.26 
 
 
316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.265729  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2864  hypothetical protein  37.67 
 
 
326 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3090  hypothetical protein  37.67 
 
 
326 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.426328  normal  0.613654 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3090  hypothetical protein  33.02 
 
 
329 aa  123  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2544  hypothetical protein  34.23 
 
 
339 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2517  protein of unknown function DUF214  35.32 
 
 
349 aa  122  6e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1177  cell division ABC transporter (membrane component)  35.78 
 
 
319 aa  122  6e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.54345 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0021  hypothetical protein  36.7 
 
 
333 aa  122  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.873886  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3255  hypothetical protein  32.54 
 
 
298 aa  121  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.97977  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0835  hypothetical protein  36.76 
 
 
327 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.618544  normal  0.382992 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0944  hypothetical protein  36.27 
 
 
326 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0363  hypothetical protein  33.49 
 
 
343 aa  118  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.920625  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4866  hypothetical protein  35.29 
 
 
323 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  normal  0.378133 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0668  hypothetical protein  31.51 
 
 
323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.113157  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0577  hypothetical protein  31.06 
 
 
314 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2375  hypothetical protein  41.92 
 
 
301 aa  107  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.202349 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0099  FtsX family protein  26.99 
 
 
324 aa  107  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0477  hypothetical protein  32.12 
 
 
300 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3499  hypothetical protein  36.24 
 
 
297 aa  95.9  7e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.770772 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3012  hypothetical protein  32.87 
 
 
303 aa  91.3  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.752793  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2016  hypothetical protein  34.04 
 
 
309 aa  87.8  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938763  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0700  hypothetical protein  28.38 
 
 
311 aa  87.8  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0734  cell division protein FtsX  34.3 
 
 
300 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2388  hypothetical protein  34.3 
 
 
300 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2891  hypothetical protein  33.33 
 
 
301 aa  83.6  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.650198  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2452  hypothetical protein  33.06 
 
 
300 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123322  normal  0.165854 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3055  protein of unknown function DUF214  33.18 
 
 
297 aa  79  0.00000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3071  protein of unknown function DUF214  31.53 
 
 
345 aa  63.9  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0933054  normal  0.0269654 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3083  hypothetical protein  32.27 
 
 
308 aa  63.5  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00150828  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1705  protein of unknown function DUF214  25.66 
 
 
290 aa  58.2  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.702845  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3977  cell division protein FtsX  26.96 
 
 
317 aa  53.5  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.199267  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0579  cell division protein FtsX  26.96 
 
 
317 aa  53.5  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00250347  normal  0.512774 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0241  cell division protein FtsX  26.96 
 
 
317 aa  53.5  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.159478  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2283  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 
293 aa  50.8  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00235564  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0223  cell division protein FtsX  27.21 
 
 
317 aa  49.3  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0710231 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3838  cell division protein FtsX  31.61 
 
 
351 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3881  cell division protein FtsX  31.61 
 
 
351 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.276809  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3771  cell division protein FtsX  31.61 
 
 
351 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3940  cell division protein FtsX  31.61 
 
 
351 aa  48.9  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3761  cell division protein FtsX  30.68 
 
 
351 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0527  cell division protein, putative  26.53 
 
 
295 aa  48.1  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000882994  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3866  cell division protein FtsX  28.98 
 
 
351 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.108975 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0427  cell division protein, putative  25.93 
 
 
295 aa  46.6  0.0005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000233953  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0101  cell division protein FtsX  26.09 
 
 
322 aa  44.3  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.270699  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0634  protein of unknown function DUF214  25.6 
 
 
293 aa  43.9  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1759  protein of unknown function DUF214  25.31 
 
 
294 aa  43.1  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.899046  normal  0.32093 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3860  cell division protein FtsX  27.59 
 
 
352 aa  43.1  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0254  cell division protein FtsX  27.59 
 
 
352 aa  43.1  0.006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3944  cell division protein FtsX  27.59 
 
 
352 aa  42.7  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03264  hypothetical protein  27.59 
 
 
352 aa  42.7  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4782  cell division protein FtsX  27.59 
 
 
352 aa  42.7  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3745  cell division protein FtsX  27.59 
 
 
352 aa  42.7  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03311  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  27.59 
 
 
352 aa  42.7  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3661  cell division protein FtsX  27.59 
 
 
352 aa  42.7  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0253  protein insertion ABC transporter, inner membrane subunit FtsX  27.59 
 
 
352 aa  42.7  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>