More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3108 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3108  preprotein translocase subunit SecD  100 
 
 		 532 aa  1053    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.2173 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3036  preprotein translocase subunit SecD  48.31 
 
 		 535 aa  496  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4309  preprotein translocase subunit SecD  47.58 
 
 		 535 aa  485  1e-136  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4406  preprotein translocase subunit SecD  45.9 
 
 		 533 aa  474  1e-132  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.638067  normal  0.207578 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1799  preprotein translocase subunit SecD  44.78 
 
 		 533 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.127943  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1796  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  45.71 
 
 		 856 aa  466  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2776  preprotein translocase subunit SecD  45.62 
 
 		 534 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.336703  normal  0.245371 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3172  preprotein translocase subunit SecD  45.71 
 
 		 533 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.881845  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1769  preprotein translocase subunit SecD  44.11 
 
 		 532 aa  457  1e-127  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.462584  normal  0.0130342 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2658  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  44.57 
 
 		 856 aa  457  1e-127  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2777  preprotein translocase subunit SecD  45.9 
 
 		 533 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.626907  normal  0.768312 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2732  preprotein translocase subunit SecD  45.71 
 
 		 533 aa  452  1e-125  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.282861 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0996  preprotein translocase subunit SecD  44.09 
 
 		 554 aa  434  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1714  preprotein translocase subunit SecD  44.81 
 
 		 537 aa  433  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1453  preprotein translocase subunit SecD  42.7 
 
 		 531 aa  430  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3671  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  44.11 
 
 		 853 aa  425  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0862684  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2073  preprotein translocase subunit SecD  43.31 
 
 		 535 aa  422  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1859  preprotein translocase subunit SecD  41.96 
 
 		 554 aa  417  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.182959  normal  0.940484 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2855  protein-export membrane protein SecD  40.74 
 
 		 532 aa  410  1e-113  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.20247 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1798  preprotein translocase subunit SecD  45.89 
 
 		 554 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1001  protein-export membrane protein SecD  41.1 
 
 		 531 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.541747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0444  preprotein translocase subunit SecD  45.89 
 
 		 554 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0562014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1899  protein-export membrane protein SecD  41.3 
 
 		 551 aa  402  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.680962  normal  0.478196 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1084  preprotein translocase subunit SecD  41.74 
 
 		 556 aa  399  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.111435 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2491  protein-export membrane protein SecD  41.45 
 
 		 534 aa  397  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.743414  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0456  preprotein translocase subunit SecD  43.71 
 
 		 554 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.171448  normal  0.0964807 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1416  preprotein translocase subunit SecD  41.94 
 
 		 554 aa  394  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.457453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0321  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.83 
 
 		 848 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.898839 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4747  protein-export membrane protein SecD  40.55 
 
 		 533 aa  391  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122054  normal  0.0344397 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2276  protein-export membrane protein SecD  40.55 
 
 		 534 aa  389  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.394363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2188  protein-export membrane protein SecD  40.36 
 
 		 534 aa  390  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.521622  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1860  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  42.37 
 
 		 844 aa  388  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0290  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  41.06 
 
 		 849 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.870898 
 
 
-
 
NC_004310  BR1324  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.57 
 
 		 845 aa  377  1e-103  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0375911  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4598  protein-export membrane protein SecD  39.89 
 
 		 532 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.278601  normal  0.122779 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1284  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.38 
 
 		 844 aa  375  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4228  protein-export membrane protein SecD  39.89 
 
 		 532 aa  377  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.250212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6059  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  43.29 
 
 		 839 aa  372  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3212  protein-export membrane protein SecD  38.69 
 
 		 525 aa  369  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1341  preprotein translocase subunit SecD  38.21 
 
 		 532 aa  350  4e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.087277  normal  0.613358 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1818  preprotein translocase subunit SecD  38.36 
 
 		 530 aa  349  7e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00022831  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1496  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.82 
 
 		 846 aa  343  5e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.823548 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1694  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  35.7 
 
 		 846 aa  342  9e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1798  preprotein translocase subunit SecD  37.43 
 
 		 530 aa  340  4e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1718  preprotein translocase subunit SecD  35.98 
 
 		 533 aa  340  5e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2617  preprotein translocase subunit SecD  36.62 
 
 		 533 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1784  preprotein translocase subunit SecD  36.21 
 
 		 532 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162006 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0878  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  37.62 
 
 		 834 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.335263  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0541  preprotein translocase subunit SecD  38.4 
 
 		 532 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0137043 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2009  preprotein translocase subunit SecD  37.41 
 
 		 530 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0181  bifunctional preprotein translocase subunit SecD/SecF  40.04 
 
 		 844 aa  335  1e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2433  preprotein translocase subunit SecD  34.93 
 
 		 532 aa  333  5e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932422  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0846  preprotein translocase subunit SecD  36.57 
 
 		 533 aa  330  4e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000476642  normal  0.132271 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1929  preprotein translocase subunit SecD  39.03 
 
 		 526 aa  330  4e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.991559  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1892  preprotein translocase subunit SecD  37.83 
 
 		 533 aa  329  9e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000256259  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0681  preprotein translocase subunit SecD  36.13 
 
 		 531 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.565803  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0883  preprotein translocase subunit SecD  35.47 
 
 		 508 aa  326  8.000000000000001e-88  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0086  preprotein translocase subunit SecD  35.31 
 
 		 501 aa  325  2e-87  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.509625  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1106  preprotein translocase subunit SecD  35.4 
 
 		 505 aa  322  8e-87  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0503  preprotein translocase subunit SecD  34.94 
 
 		 534 aa  319  1e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.153104  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2057  protein-export membrane protein SecD  38.02 
 
 		 594 aa  318  1e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1715  protein-export membrane protein SecD  38.02 
 
 		 594 aa  318  1e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0854  preprotein translocase subunit SecD  35.13 
 
 		 533 aa  317  4e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03171  Acriflavin resistance protein  35.61 
 
 		 843 aa  317  4e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4005  preprotein translocase subunit SecD  37.97 
 
 		 632 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3355  preprotein translocase subunit SecD  37.97 
 
 		 632 aa  314  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1239  protein-export membrane protein SecD  37.84 
 
 		 533 aa  314  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1230  preprotein translocase subunit SecD  36.36 
 
 		 614 aa  310  4e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.181896  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4644  preprotein translocase subunit SecD  36.58 
 
 		 632 aa  306  6e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2715  preprotein translocase subunit SecD  38.16 
 
 		 626 aa  306  7e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.177706 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2442  protein-export membrane protein SecD  35.51 
 
 		 524 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000311445  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4087  preprotein translocase subunit SecD  37.3 
 
 		 636 aa  298  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.15751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3280  preprotein translocase subunit SecD  36.74 
 
 		 625 aa  298  2e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.527735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2350  preprotein translocase subunit SecD  37.98 
 
 		 618 aa  296  5e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.951904  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2810  preprotein translocase subunit SecD  35.91 
 
 		 621 aa  296  7e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0344  preprotein translocase subunit SecD  36.58 
 
 		 633 aa  296  7e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0728  preprotein translocase subunit SecD  37.2 
 
 		 529 aa  293  6e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.347162  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2079  preprotein translocase protein SecD  39.11 
 
 		 604 aa  292  9e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01347  preprotein translocase subunit SecD  37.87 
 
 		 599 aa  292  1e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.151962  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2959  preprotein translocase subunit SecD  36.13 
 
 		 629 aa  291  3e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2549  preprotein translocase subunit SecD  36.13 
 
 		 629 aa  290  7e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.370381  normal  0.188242 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0838  preprotein translocase subunit SecD  36.63 
 
 		 640 aa  288  1e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1218  preprotein translocase subunit SecD  38.3 
 
 		 621 aa  286  5e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.518755 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2066  preprotein translocase subunit SecD  38.12 
 
 		 623 aa  286  8e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.666611  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2184  protein-export membrane protein SecD  37.82 
 
 		 620 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1575  preprotein translocase subunit SecD  35.84 
 
 		 521 aa  283  8.000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1048  preprotein translocase subunit SecD  35.98 
 
 		 526 aa  282  1e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3121  preprotein translocase subunit SecD  34.81 
 
 		 615 aa  282  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000987582  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3262  preprotein translocase subunit SecD  34.81 
 
 		 604 aa  281  1e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.103027  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3382  preprotein translocase subunit SecD  34.81 
 
 		 615 aa  282  1e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00120261  normal  0.627671 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0512  protein-export membrane protein SecD  35.85 
 
 		 609 aa  281  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0277  preprotein translocase subunit SecD  36.98 
 
 		 626 aa  280  4e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.130868  normal  0.176148 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1063  preprotein translocase subunit SecD  35.7 
 
 		 615 aa  280  6e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256647 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5119  preprotein translocase subunit SecD  35.01 
 
 		 627 aa  278  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2427  preprotein translocase subunit SecD  38.76 
 
 		 614 aa  278  2e-73  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00522  preprotein translocase subunit SecD  35.91 
 
 		 614 aa  278  2e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2527  preprotein translocase subunit SecD  35.48 
 
 		 681 aa  277  3e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3866  preprotein translocase subunit SecD  35.1 
 
 		 626 aa  277  3e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0476  preprotein translocase subunit SecD  32.62 
 
 		 526 aa  277  3e-73  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0941  preprotein translocase subunit SecD  37.33 
 
 		 625 aa  276  5e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>