More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3088 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_3088  ABC transporter related  100 
 
 		 251 aa  462  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0257  ABC transporter related  46.15 
 
 		 266 aa  174  9.999999999999999e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.80562  normal  0.0615172 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3049  ABC transporter, ATPase subunit  49.78 
 
 		 260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2405  ABC cobalamin/Fe3+-siderophore transporter, ATPase subunit  45.71 
 
 		 250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1068  ABC transporter related  45.71 
 
 		 250 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.437472 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1829  ABC transporter related  39.68 
 
 		 257 aa  172  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.336355  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0631  ABC transporter related  49.33 
 
 		 260 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.17434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0793  ABC transporter related  48.88 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4385  ABC transporter related  45.45 
 
 		 251 aa  169  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.426909  normal  0.116393 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0733  ABC transporter related  50 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1344  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4255  ABC transporter related  47.72 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.350498 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1302  iron compound ABC transporter, ATP-binding protein  42.13 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0086  ABC transporter related  48.88 
 
 		 260 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.363839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3729  ABC transporter related  47.83 
 
 		 260 aa  166  4e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0511  ABC transporter related  44.68 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.470088 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2066  ABC transporter related  43.04 
 
 		 258 aa  162  7e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2923  ABC transporter related  44.54 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0729345  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1385  ABC transporter related  44.31 
 
 		 250 aa  156  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.193672 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6080  ABC transporter related  44.59 
 
 		 271 aa  154  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.701967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1832  ABC transporter related protein  38.37 
 
 		 490 aa  154  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8245  ABC transporter related  47.96 
 
 		 271 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475817  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4685  hemin importer ATP-binding subunit  42.44 
 
 		 255 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000508332  hitchhiker  0.00000000000000885497 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4551  hemin importer ATP-binding subunit  42.02 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00000433574  decreased coverage  0.0000000113958 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1076  putative iron transporter, ATP-binding protein  35.19 
 
 		 259 aa  152  5.9999999999999996e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.665903  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3607  ABC transporter related protein  39.41 
 
 		 536 aa  150  1e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1001  ABC transporter related  46.02 
 
 		 260 aa  150  1e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.796453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1342  ABC transporter related  40.77 
 
 		 252 aa  150  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.868132  normal  0.307367 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0491  ABC transporter component  45.68 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2740  ABC transporter related  45.69 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.090181 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2511  ABC transporter related  42.28 
 
 		 253 aa  148  9e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1932  ABC transporter related  31.44 
 
 		 266 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5679  ABC transporter related  43.89 
 
 		 270 aa  145  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4687  hemin importer ATP-binding subunit  41.18 
 
 		 255 aa  144  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.687839  hitchhiker  0.000215024 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0298  ABC transporter related  30.93 
 
 		 266 aa  144  9e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0373  ABC transporter related protein  41.63 
 
 		 293 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1943  ABC transporter related  40.56 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.82055  normal  0.0334831 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1894  ABC transporter related  32.16 
 
 		 416 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04360  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.49 
 
 		 285 aa  143  2e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  31.71 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3202  ABC transporter related  32.92 
 
 		 405 aa  142  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2394  iron ABC transporter, ATP-binding protein  31.87 
 
 		 290 aa  142  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0995  hemin importer ATP-binding subunit  42.56 
 
 		 255 aa  142  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000453335  hitchhiker  0.0000000000000146988 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0971  iron-dicitrate transporter ATP-binding subunit  35.25 
 
 		 255 aa  140  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.51617  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2926  ABC transporter related  44.89 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.214011 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1189  ABC transporter related  45.37 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0418  protein of unknown function DUF105  40.17 
 
 		 490 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2584  ABC transporter related  44.21 
 
 		 273 aa  140  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0747  hemin importer ATP-binding subunit  41.53 
 
 		 255 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000209221  decreased coverage  0.000000000000929505 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3804  ABC transporter related  43.24 
 
 		 271 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0153  ABC transporter-like  33.88 
 
 		 260 aa  139  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2262  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  30.34 
 
 		 269 aa  137  1e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.644524 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4783  ABC transporter related  39.27 
 
 		 263 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4798  hemin importer ATP-binding subunit  40.83 
 
 		 255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000262531  hitchhiker  0.00143182 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0784  hemin importer ATP-binding subunit  36.63 
 
 		 254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0882  corrinoid ABC transporter ATPase  40.43 
 
 		 424 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2166  ABC transporter related protein  43.04 
 
 		 253 aa  135  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.13025  normal  0.348663 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42590  hemin importer ATP-binding subunit  43.15 
 
 		 255 aa  136  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00288273  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3151  ABC transporter related  43.89 
 
 		 271 aa  135  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1424  iron(III) ABC transporter, ATP-binding protein  28.27 
 
 		 251 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000297439  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4277  ABC transporter related protein  39.67 
 
 		 262 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1391  ABC transporter related protein  38.66 
 
 		 272 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1942  ABC transporter related  40.43 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  40.51 
 
 		 255 aa  134  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1472  ABC transporter related  32.91 
 
 		 280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.140058  normal  0.304695 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0593  ABC transporter-like  38.96 
 
 		 262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.835078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1591  ABC transporter related protein  40.74 
 
 		 262 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1451  ABC transporter related protein  40.91 
 
 		 258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.776567  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1301  ABC transporter-related protein  37.1 
 
 		 261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5422  hemin importer ATP-binding subunit  41.7 
 
 		 255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0457387  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2736  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (hemin)  37.14 
 
 		 262 aa  132  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2210  protein of unknown function DUF105  35.74 
 
 		 494 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28070  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  42.28 
 
 		 258 aa  132  6.999999999999999e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62280  hemin importer ATP-binding subunit  41.28 
 
 		 255 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000951345  normal  0.390973 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7625  ABC transporter  36.14 
 
 		 261 aa  132  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2440  ABC transporter-like protein  39.57 
 
 		 270 aa  131  9e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0118809  normal  0.497052 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1378  hypothetical protein  32.37 
 
 		 409 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00009791  normal  0.0246408 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0258  ABC transporter related  33.03 
 
 		 424 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1545  ABC transporter, ATPase subunit  28.15 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4566  ABC transporter related  39.26 
 
 		 280 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2492  ABC transporter related  38.91 
 
 		 419 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0622  ABC transporter related  33.64 
 
 		 275 aa  129  3e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.258343  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5561  iron-compound ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.05 
 
 		 259 aa  129  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  36.51 
 
 		 304 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1324  ABC transporter related  41.78 
 
 		 250 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.434402  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  32.61 
 
 		 249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00190  ABC transporter related  30 
 
 		 418 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00177587  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3693  ABC transporter related  42.79 
 
 		 237 aa  129  4.0000000000000003e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.647625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_590  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, ATPase component  33.18 
 
 		 275 aa  129  6e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.139681  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3725  ABC transporter related protein  37.19 
 
 		 249 aa  129  7.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5102  ABC transporter  36.91 
 
 		 259 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0038  manganese ABC transporter, ATP-binding protein  31.2 
 
 		 249 aa  128  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000473887  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1214  ABC transporter related  37.9 
 
 		 274 aa  128  7.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.719028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4438  ABC transporter related  41.35 
 
 		 246 aa  128  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.845686  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3877  ABC transporter related  42.91 
 
 		 266 aa  128  8.000000000000001e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0419238 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1152  multi anti extrusion protein MatE  29.72 
 
 		 255 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05239  hemin importer ATP-binding subunit  33.88 
 
 		 260 aa  128  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3979  ABC transporter related  32.73 
 
 		 252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.97942 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1237  anchored repeat-type ABC transporter, ATP-binding subunit  34.39 
 
 		 262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000165117 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0289  ABC transporter related  30.2 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.137233  normal  0.108159 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>