More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2961 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2961  amino acid permease-associated region  100 
 
 		 481 aa  929    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.408205 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1143  amino acid permease-associated region  55.39 
 
 		 464 aa  489  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0388  putative amino acid permease  41.24 
 
 		 467 aa  329  5.0000000000000004e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63480  putative amino acid permease  41.06 
 
 		 465 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.059439  normal  0.982931 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0653  amino acid permease family protein  40.19 
 
 		 472 aa  326  5e-88  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3446  amino acid permease-associated region  36.08 
 
 		 455 aa  297  3e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0671  amino acid permease-associated region  36.14 
 
 		 500 aa  281  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122494  hitchhiker  0.0000196904 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0677  amino acid permease-associated region  34.45 
 
 		 500 aa  266  5e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.148387 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2190  amino acid permease-associated region  36.2 
 
 		 497 aa  266  5e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1050  hypothetical protein  28.34 
 
 		 473 aa  160  3e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.95455 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2501  putative amino acid transporter  28.09 
 
 		 473 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.957619  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2547  putative amino acid transporter  28.09 
 
 		 473 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2589  putative amino acid transporter  28.09 
 
 		 473 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2601  putative amino acid transporter  28.09 
 
 		 473 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2710  putative amino acid transporter  28.57 
 
 		 473 aa  153  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.484559  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1660  hypothetical protein  26.93 
 
 		 464 aa  145  1e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1654  hypothetical protein  26.68 
 
 		 464 aa  145  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0047  amino acid permease-associated region  28.11 
 
 		 499 aa  141  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2318  amino acid permease-associated region  25.58 
 
 		 469 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0145  amino acid permease-associated region  26.8 
 
 		 474 aa  139  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.270718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0037  amino acid permease-associated region  24.7 
 
 		 494 aa  138  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.877998 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2342  amino acid permease-associated region  29.58 
 
 		 508 aa  136  9e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0123104  normal  0.200985 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0063  amino acid antiporter  26.62 
 
 		 470 aa  134  3e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2121  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  26.62 
 
 		 476 aa  134  3.9999999999999996e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4375  amino acid permease-associated region  29.05 
 
 		 495 aa  130  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0470  hypothetical protein  23.57 
 
 		 467 aa  127  4.0000000000000003e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0446  hypothetical protein  23.57 
 
 		 467 aa  126  7e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1980  amino acid permease-associated region  26.18 
 
 		 504 aa  123  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.9875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1999  amino acid permease-associated region  26.18 
 
 		 504 aa  123  7e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0525134  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2045  amino acid permease-associated region  26.18 
 
 		 504 aa  123  7e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.708803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3825  glutamate/gamma-aminobutyrate anti-porter  28.76 
 
 		 506 aa  123  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02485  hypothetical protein  25.24 
 
 		 475 aa  121  1.9999999999999998e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0708  amino acid permease-associated region  26.1 
 
 		 480 aa  121  3e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000156631 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1536  amino acid transporter  26.35 
 
 		 476 aa  120  7.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0652543  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0046  amino acid permease-associated region  26.33 
 
 		 495 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2217  amino acid permease-associated region  25.55 
 
 		 503 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.291041 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0552  glutamate/GABA antiporter  28.54 
 
 		 506 aa  117  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4126  amino acid permease-associated region  25.4 
 
 		 502 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.635081  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0488  amino acid antiporter  27.07 
 
 		 466 aa  114  3e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.557891  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003630  amino acid/polyamine  24.43 
 
 		 475 aa  113  6e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1501  amino acid permease family protein  23.19 
 
 		 474 aa  114  6e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1434  glutamate/gamma-aminobutyrate antiporter  23.19 
 
 		 474 aa  113  7.000000000000001e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.298101  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1892  hypothetical protein  25.59 
 
 		 473 aa  109  1e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1881  hypothetical protein  25.99 
 
 		 473 aa  108  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  26.23 
 
 		 511 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01450  predicted glutamate:gamma-aminobutyric acid antiporter  26.23 
 
 		 511 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2155  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  26.23 
 
 		 511 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.316259  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2165  glutamate/g-aminobutyrate antiporter  26.23 
 
 		 511 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0669643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1577  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  25.83 
 
 		 511 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1755  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  26.23 
 
 		 511 aa  98.2  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.489766  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01463  hypothetical protein  26.23 
 
 		 511 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1681  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  26.23 
 
 		 511 aa  98.2  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2105  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter  25.9 
 
 		 511 aa  97.1  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.902861  normal  0.230296 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2317  glutamate:gamma aminobutyrate antiporter family protein  24.66 
 
 		 472 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6600  amino acid permease-associated region  21.3 
 
 		 490 aa  80.5  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1412  glutamate gamma-aminobutyrate antiporter  23.94 
 
 		 503 aa  80.5  0.00000000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0796975  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1012  amino acid permease family protein  25.93 
 
 		 489 aa  80.1  0.00000000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000367074  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2221  amino acid permease-associated region  31.47 
 
 		 495 aa  79.3  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300523  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2031  putative amino acid antiporter/acid resistance protein  24.66 
 
 		 472 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1109  amino acid permease-associated region  30.65 
 
 		 538 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.332112  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3075  amino acid permease-associated region  27.72 
 
 		 468 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1342  amino acid permease-associated region  26.97 
 
 		 438 aa  77.8  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0943  amino acid permease-associated region  30.15 
 
 		 464 aa  77.8  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.975115 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3056  amino acid permease-associated region  27.72 
 
 		 468 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.738455  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2442  amino acid permease-associated region  27.72 
 
 		 468 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3053  amino acid permease-associated region  27.97 
 
 		 466 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3317  amino acid permease family protein  26.4 
 
 		 426 aa  77.4  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.474485  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1640  amino acid permease-associated region  26.92 
 
 		 503 aa  77.4  0.0000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.469925  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4029  amino acid permease-associated region  30.28 
 
 		 488 aa  77.4  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.891947  normal  0.206887 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3074  amino acid permease family protein  26.4 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0700117  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3295  amino acid permease family protein  26.4 
 
 		 431 aa  77.4  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6404  amino acid tranporter  28.33 
 
 		 468 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0046  amino acid permease-associated region  29.72 
 
 		 481 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3620  amino acid permease-associated region  28.28 
 
 		 494 aa  75.5  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1185  amino acid permease-associated region  30.15 
 
 		 500 aa  75.5  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000031704 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2967  amino acid permease-associated region  26.87 
 
 		 466 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.799342  normal  0.23719 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3101  amino acid permease-associated region  26.87 
 
 		 466 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29025  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0973  inner membrane transporter YcaM  22.25 
 
 		 473 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4549  arginine:agmatin antiporter  25.21 
 
 		 445 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.226613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1082  inner membrane transporter YcaM  22.25 
 
 		 473 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.224417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1002  inner membrane transporter YcaM  22.25 
 
 		 473 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1067  inner membrane transporter YcaM  22.25 
 
 		 473 aa  74.7  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.154382  normal  0.709783 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1181  amino acid permease family protein  24.88 
 
 		 489 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0293618  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3379  amino acid permease-associated region  25.72 
 
 		 505 aa  74.7  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1033  inner membrane transporter YcaM  22.25 
 
 		 473 aa  74.3  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.843228 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4640  arginine:agmatin antiporter  25.21 
 
 		 445 aa  73.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4640  arginine:agmatin antiporter  25.21 
 
 		 445 aa  73.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4556  arginine:agmatin antiporter  25.21 
 
 		 445 aa  73.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4689  arginine:agmatin antiporter  25.21 
 
 		 445 aa  73.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1308  amino acid permease  28.96 
 
 		 497 aa  73.2  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00903  predicted transporter  21.85 
 
 		 476 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1062  amino acid permease family protein  21.92 
 
 		 476 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2744  amino acid permease-associated region  21.85 
 
 		 476 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.397041  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2220  amino acid permease family protein  21.85 
 
 		 476 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.52526 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1005  amino acid permease family protein  21.97 
 
 		 540 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2697  amino acid permease-associated region  21.85 
 
 		 476 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00910  hypothetical protein  21.85 
 
 		 476 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.913245  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1603  amino acid permease-associated region  28.96 
 
 		 494 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0963262  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0976  amino acid permease family protein  21.97 
 
 		 540 aa  72.8  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.953218  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0027  hypothetical protein  23.2 
 
 		 463 aa  72.4  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>