More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2957 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2957  major facilitator transporter  100 
 
 		 406 aa  791    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.902774 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3771  major facilitator superfamily MFS_1  71.57 
 
 		 404 aa  560  1e-158  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0825  nitrate transporter  65.35 
 
 		 404 aa  537  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0211862 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1145  nitrite transporter  66.34 
 
 		 404 aa  537  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0321  nitrate transporter  68.45 
 
 		 403 aa  526  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2304  nitrate transporter  62.53 
 
 		 403 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.144946  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1783  nitrate transporter  61.54 
 
 		 403 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1264  major facilitator transporter  64.85 
 
 		 411 aa  493  9.999999999999999e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2102  nitrate transporter  62.03 
 
 		 403 aa  491  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00251699 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1705  major facilitator transporter  68.21 
 
 		 414 aa  485  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.460049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2970  major facilitator transporter  64.54 
 
 		 417 aa  475  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.17819  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1610  nitrite transporter  61.29 
 
 		 403 aa  478  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000151581 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1971  major facilitator transporter  62.31 
 
 		 423 aa  474  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23390  Nitrate/nitrite transporter  62.53 
 
 		 403 aa  468  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2092  nitrite transporter  61.54 
 
 		 411 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0926353 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3648  nitrite transporter  61.54 
 
 		 403 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2098  nitrite transporter  60.3 
 
 		 403 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209947  normal  0.0376264 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1603  nitrite transporter  61.04 
 
 		 403 aa  450  1e-125  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.966318  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41510  nitrate transporter  60.05 
 
 		 403 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3522  nitrate transporter  60.81 
 
 		 403 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0594  nitrate transporter, putative  48.8 
 
 		 424 aa  366  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1735  major facilitator transporter  50.78 
 
 		 412 aa  350  3e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2675  major facilitator superfamily MFS_1  50.9 
 
 		 400 aa  342  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3273  major facilitator transporter  44.72 
 
 		 403 aa  317  3e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.180374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2315  nitrate transporter  43.14 
 
 		 418 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2916  major facilitator transporter  43.11 
 
 		 416 aa  305  7e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0195936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2676  major facilitator transporter  44.97 
 
 		 418 aa  300  2e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4825  major facilitator transporter  43.14 
 
 		 418 aa  294  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.0172769 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1700  major facilitator superfamily MFS_1  41.69 
 
 		 421 aa  294  2e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194128  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0306  major facilitator transporter  42.2 
 
 		 439 aa  288  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.456873 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0382  major facilitator superfamily MFS_1  42.2 
 
 		 419 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.577765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0350  major facilitator superfamily MFS_1  41.69 
 
 		 419 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.222192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1411  major facilitator superfamily transporter  40.7 
 
 		 433 aa  274  2.0000000000000002e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.865704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3526  major facilitator superfamily MFS_1  40.45 
 
 		 421 aa  273  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1986  major facilitator superfamily MFS_1  38.67 
 
 		 455 aa  234  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.53952 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2211  major facilitator superfamily nitrate/nitrite transporter NarK/NasA  37.99 
 
 		 455 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.586117  normal  0.0196419 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2626  putative nitrate transporter  38.25 
 
 		 467 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2441  nitrate transporter, putative  38.25 
 
 		 467 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1215  putative nitrate transporter  38.25 
 
 		 467 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0357  putative nitrate transporter  38.25 
 
 		 467 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1222  nitrate transporter, putative  38.16 
 
 		 606 aa  220  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2337  major facilitator transporter  37.9 
 
 		 465 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.276907  normal  0.0352199 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3435  major facilitator family transporter  38.39 
 
 		 468 aa  209  9e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3401  major facilitator family transporter  38.39 
 
 		 468 aa  208  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0193  major facilitator transporter  34.89 
 
 		 425 aa  188  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.81343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2637  major facilitator superfamily MFS_1  30.93 
 
 		 420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2171  nitrate transporter  33.61 
 
 		 389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3390  major facilitator transporter  35.28 
 
 		 389 aa  184  3e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3170  nitrate transporter  33.33 
 
 		 389 aa  184  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2285  nitrate transporter  33.33 
 
 		 389 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1990  nitrate transporter  33.33 
 
 		 389 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.019185  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1942  nitrite extrusion protein  33.33 
 
 		 389 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2138  nitrate transporter  33.33 
 
 		 389 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2145  nitrate transporter  33.33 
 
 		 389 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1964  nitrite extrusion protein  33.33 
 
 		 389 aa  182  7e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1981  major facilitator transporter  33.06 
 
 		 389 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0384257  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1980  nitrite extrusion protein  32.7 
 
 		 387 aa  181  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428351  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0434  major facilitator superfamily transporter  30.63 
 
 		 435 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2656  major facilitator superfamily MFS_1  32.38 
 
 		 417 aa  178  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1711  nitrate/proton symporter  30.81 
 
 		 436 aa  179  1e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.20518  normal  0.395808 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0425  major facilitator superfamily MFS_1  30.63 
 
 		 435 aa  177  2e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1856  nitrate/nitrite transporter  33.85 
 
 		 426 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2753  nitrate/nitrite transporter  33.33 
 
 		 426 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2622  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  33.33 
 
 		 426 aa  176  7e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4597  major facilitator transporter  29.87 
 
 		 420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4666  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 		 438 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3589  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 		 438 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.745266  normal  0.490734 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2718  major facilitator superfamily MFS_1  37.8 
 
 		 382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.189417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1107  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 440 aa  174  3.9999999999999995e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2412  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 389 aa  173  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2459  major facilitator transporter  32.27 
 
 		 389 aa  173  5e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2535  major facilitator superfamily MFS_1  39.3 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2708  major facilitator transporter  30.64 
 
 		 441 aa  171  2e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.144735 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3763  major facilitator superfamily transporter  29.87 
 
 		 417 aa  169  6e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0659  major facilitator superfamily transporter  31.99 
 
 		 428 aa  169  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.726769 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2790  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 418 aa  168  2e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.284899  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1204  major facilitator transporter  38.36 
 
 		 394 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1401  nitrate/proton symporter  32.08 
 
 		 422 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5214  major facilitator superfamily MFS_1  35.23 
 
 		 403 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.833951  normal  0.607033 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4237  nitrite transporter  32.41 
 
 		 905 aa  164  2.0000000000000002e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.880598  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3703  major facilitator superfamily MFS_1  35.19 
 
 		 406 aa  164  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.524195  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0300  nitrite extrusion protein  31.62 
 
 		 895 aa  163  5.0000000000000005e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.129473  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0899  major facilitator superfamily MFS_1  32.89 
 
 		 397 aa  163  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4547  major facilitator superfamily transporter  34.56 
 
 		 390 aa  162  7e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.273372 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4430  major facilitator superfamily MFS_1  35.11 
 
 		 398 aa  162  8.000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5388  major facilitator transporter  33.92 
 
 		 422 aa  162  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0135338 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11755  nitrate/nitrite transporter narK2  33.71 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0227286 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0972  nitrite/nitrate ABC transporter transmembrane protein  33.07 
 
 		 437 aa  161  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.43709 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2678  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  33.33 
 
 		 426 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1511  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  33.33 
 
 		 426 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3080  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  33.33 
 
 		 426 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1264  major facilitator transporter  34.24 
 
 		 406 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.75392  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1281  major facilitator superfamily transporter  34.24 
 
 		 406 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.473374  normal  0.0788075 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2239  nitrate/nitrite porter (NNP) family protein  33.33 
 
 		 426 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.803213  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4453  major facilitator transporter  34.22 
 
 		 402 aa  160  3e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1290  major facilitator transporter  33.97 
 
 		 406 aa  160  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0492982 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2890  nitrite transporter  31.25 
 
 		 912 aa  160  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3676  major facilitator superfamily MFS_1  33.78 
 
 		 398 aa  159  6e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000606692  normal  0.0196107 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1729  nitrate/nitrite transporter  33.6 
 
 		 409 aa  159  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6459  major facilitator transporter  33.82 
 
 		 421 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338256  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>