More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2871 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02157  DNA gyrase subunit A  48.16 
 
 		 875 aa  829    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1428  DNA gyrase, A subunit  52.1 
 
 		 875 aa  762    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000222135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0004  DNA gyrase, A subunit  47.08 
 
 		 857 aa  786    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1767  DNA gyrase subunit A  45.7 
 
 		 923 aa  798    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.159029  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_002950  PG1386  DNA gyrase, A subunit  43.43 
 
 		 859 aa  712    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000518586 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2548  DNA gyrase, A subunit  43.74 
 
 		 893 aa  743    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1421  DNA gyrase, A subunit  48.63 
 
 		 860 aa  801    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.633923  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1202  DNA gyrase subunit A  50.5 
 
 		 900 aa  915    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0901  DNA gyrase subunit A  45.8 
 
 		 885 aa  792    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.018045  normal  0.748507 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0006  DNA gyrase subunit A  44.17 
 
 		 823 aa  756    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.711032  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2331  DNA gyrase, A subunit  46.14 
 
 		 908 aa  778    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.627723  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0960  DNA gyrase subunit A  41.04 
 
 		 819 aa  687    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00632258  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1097  DNA gyrase subunit A  62.26 
 
 		 922 aa  1123    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.788697  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2411  DNA gyrase, A subunit  44.33 
 
 		 919 aa  723    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1745  DNA gyrase, subunit A  44.37 
 
 		 928 aa  768    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.6885  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0006  DNA gyrase subunit A  44.17 
 
 		 823 aa  756    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814718  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0006  DNA gyrase subunit A  44.17 
 
 		 823 aa  756    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0006  DNA gyrase subunit A  44.17 
 
 		 823 aa  756    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0435  DNA gyrase subunit A  46.44 
 
 		 866 aa  763    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.361933  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1372  DNA gyrase, subunit A, type II topoisomerase  51.63 
 
 		 863 aa  752    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1368  DNA gyrase, subunit A, type II topoisomerase  51.77 
 
 		 863 aa  754    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3647  DNA gyrase subunit A  44.37 
 
 		 925 aa  769    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1543  DNA gyrase subunit A  42.62 
 
 		 930 aa  741    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.255758 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1230  DNA gyrase subunit A  45.37 
 
 		 879 aa  766    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0017603  normal  0.486018 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0007  DNA gyrase subunit A  42.36 
 
 		 848 aa  692    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0689  DNA gyrase subunit A  41 
 
 		 872 aa  661    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.39823  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2578  DNA gyrase subunit A  46.2 
 
 		 883 aa  784    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0234  DNA gyrase subunit A  48.55 
 
 		 898 aa  892    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2804  DNA gyrase subunit A  43.21 
 
 		 949 aa  686    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.371561  hitchhiker  0.000745999 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0948  DNA gyrase subunit A  45.61 
 
 		 849 aa  764    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.309422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1801  DNA gyrase subunit A  59.17 
 
 		 913 aa  1104    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303162  normal  0.145926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4464  DNA gyrase subunit A  41.93 
 
 		 872 aa  697    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.32353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3000  DNA gyrase subunit A  46.44 
 
 		 866 aa  764    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0171  DNA gyrase, subunit A  47.72 
 
 		 846 aa  794    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101835  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4078  DNA gyrase subunit A  46.15 
 
 		 887 aa  785    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0373422  normal  0.530642 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2630  DNA gyrase subunit A  58.84 
 
 		 907 aa  1076    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0005  DNA gyrase, A subunit  46.52 
 
 		 835 aa  764    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.170541  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4153  DNA gyrase subunit A  46.28 
 
 		 867 aa  761    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0098  DNA gyrase, subunit A  42.66 
 
 		 815 aa  676    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.333525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0723  DNA gyrase subunit A  43.46 
 
 		 886 aa  681    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.217067  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0088  DNA gyrase, subunit A  43.16 
 
 		 828 aa  700    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1942  DNA gyrase subunit A  42.04 
 
 		 865 aa  669    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.72276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0005  DNA gyrase subunit A  46.81 
 
 		 857 aa  783    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000593628  normal  0.429362 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0004  DNA gyrase subunit A  42.31 
 
 		 811 aa  691    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.882068  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1191  DNA gyrase, A subunit  46.23 
 
 		 871 aa  735    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0006  DNA gyrase subunit A  44.17 
 
 		 823 aa  756    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1074  DNA gyrase subunit A  40.9 
 
 		 863 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0254  DNA gyrase subunit A  42.43 
 
 		 856 aa  688    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2189  DNA gyrase subunit A  45.41 
 
 		 893 aa  776    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1744  DNA gyrase subunit A  60.32 
 
 		 943 aa  1066    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0008  DNA gyrase, A subunit  44.02 
 
 		 814 aa  745    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000266151  unclonable  0.0000000153333 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1632  DNA gyrase subunit A  46.4 
 
 		 866 aa  763    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4346  DNA gyrase subunit A  44.22 
 
 		 907 aa  701    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0007  DNA gyrase subunit A  42.64 
 
 		 834 aa  667    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2876  DNA gyrase subunit A  60.09 
 
 		 925 aa  1100    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.987294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1918  DNA gyrase subunit A  56.69 
 
 		 908 aa  1028    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0264462  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1045  DNA gyrase, A subunit  42.71 
 
 		 839 aa  687    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.980476  normal  0.0656064 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0958  DNA gyrase, A subunit  44.73 
 
 		 869 aa  795    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.687987  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0858  DNA gyrase subunit A  49.17 
 
 		 898 aa  893    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.683478  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2494  DNA gyrase subunit A  56.63 
 
 		 919 aa  1034    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.257377  normal  0.164499 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1571  DNA gyrase subunit A  45.76 
 
 		 880 aa  770    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.612234  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2148  DNA gyrase subunit A  48.65 
 
 		 886 aa  721    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0598325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2584  DNA gyrase subunit A  61.23 
 
 		 927 aa  1117    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.216203  normal  0.308753 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1688  DNA gyrase subunit A  45.76 
 
 		 864 aa  780    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.352233  normal  0.651217 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1795  DNA gyrase subunit A  45.59 
 
 		 880 aa  778    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.979791  unclonable  0.00000642236 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0974  DNA gyrase subunit A  46.73 
 
 		 882 aa  781    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1948  DNA gyrase, A subunit  45.91 
 
 		 908 aa  729    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000559672  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0420  DNA gyrase subunit A  42.89 
 
 		 830 aa  731    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.422569  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2596  DNA gyrase subunit A  60.66 
 
 		 917 aa  1112    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0785629 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2168  DNA gyrase subunit A  47.38 
 
 		 907 aa  815    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1764  DNA gyrase subunit A  59.72 
 
 		 913 aa  1108    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.314085  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1724  DNA gyrase, A subunit  42.6 
 
 		 928 aa  739    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0733273  normal  0.707795 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0713  DNA gyrase subunit A  46.8 
 
 		 897 aa  798    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0387  DNA gyrase, A subunit  43.69 
 
 		 847 aa  731    Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4772  DNA gyrase subunit A  43.42 
 
 		 865 aa  724    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427862  decreased coverage  0.00451801 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1332  DNA gyrase subunit A  58.1 
 
 		 912 aa  1064    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1164  DNA gyrase subunit A  57.48 
 
 		 901 aa  1013    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.703676  normal  0.148807 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0561  DNA gyrase subunit A  46.28 
 
 		 867 aa  763    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3573  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0006  DNA gyrase subunit A  41.51 
 
 		 852 aa  677    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2470  DNA gyrase, A subunit  46.53 
 
 		 897 aa  790    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.931023  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1400  DNA gyrase subunit A  61.56 
 
 		 929 aa  1104    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1682  DNA gyrase subunit A  43.31 
 
 		 865 aa  672    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0007  DNA gyrase subunit A  43.92 
 
 		 839 aa  761    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0007  DNA gyrase subunit A  44.03 
 
 		 839 aa  763    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1163  DNA gyrase subunit A  47.3 
 
 		 881 aa  816    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00841835  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4186  DNA gyrase subunit A  41.54 
 
 		 885 aa  660    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.327784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1919  DNA gyrase subunit A  44.22 
 
 		 946 aa  723    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000233211  hitchhiker  0.00000000296006 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2059  DNA gyrase subunit A  46.65 
 
 		 944 aa  779    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00127013  unclonable  0.0000452472 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0923  DNA gyrase subunit A  47.26 
 
 		 862 aa  800    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.222877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2130  DNA gyrase, A subunit  46.76 
 
 		 909 aa  762    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.717755  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1873  DNA gyrase subunit A  60.16 
 
 		 946 aa  1112    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0970945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0916  DNA gyrase subunit A  46.17 
 
 		 867 aa  762    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23260  DNA gyrase subunit A  46 
 
 		 921 aa  818    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00503917 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1216  DNA gyrase subunit A  41.77 
 
 		 836 aa  677    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.504333  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0006  DNA gyrase, A subunit  40.74 
 
 		 829 aa  704    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000708877  hitchhiker  8.0391e-18 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0006  DNA gyrase subunit A  47.3 
 
 		 848 aa  664    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.889145  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1256  DNA gyrase subunit A  43.64 
 
 		 817 aa  718    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1040  DNA gyrase subunit A  46.28 
 
 		 867 aa  763    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1394  DNA gyrase, A subunit  42.05 
 
 		 796 aa  684    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2690  DNA gyrase, A subunit  44.22 
 
 		 813 aa  713    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.163226  decreased coverage  0.000223283 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>