More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2803 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2803  uridylate kinase  100 
 
 
245 aa  499  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00682301  normal  0.644518 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3194  uridylate kinase  74.79 
 
 
241 aa  355  3.9999999999999996e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1371  uridylate kinase  72.02 
 
 
244 aa  354  8.999999999999999e-97  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.184523  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0462  uridylate kinase  72.46 
 
 
237 aa  350  8.999999999999999e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.531009  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1382  uridylate kinase  72.53 
 
 
263 aa  350  1e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.1666  normal  0.0472283 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2553  uridylate kinase  67.63 
 
 
246 aa  342  2.9999999999999997e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1958  uridylate kinase  72.1 
 
 
241 aa  342  2.9999999999999997e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1588  uridylate kinase  67.52 
 
 
250 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10521  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0371  uridylate kinase  66.81 
 
 
246 aa  321  8e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0645095  normal  0.460164 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2710  uridylate kinase  64.94 
 
 
239 aa  319  1.9999999999999998e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0334145  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1252  uridylate kinase  65.24 
 
 
239 aa  319  3e-86  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000157297  hitchhiker  0.0010531 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2705  uridylate kinase  65.09 
 
 
246 aa  318  5e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.836917  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1362  uridylate kinase  64.66 
 
 
246 aa  317  9e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00482599 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2153  uridylate kinase  64.22 
 
 
246 aa  316  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0530  uridylate kinase  61.09 
 
 
247 aa  316  2e-85  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0280  uridylate kinase  63.45 
 
 
251 aa  315  4e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0302  uridylate kinase  64.07 
 
 
251 aa  315  5e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0291  uridylate kinase  64.07 
 
 
251 aa  315  5e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1487  uridylate kinase  62.82 
 
 
240 aa  313  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0028883 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2754  uridylate kinase  62.82 
 
 
240 aa  313  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1919  uridylate kinase  63.52 
 
 
239 aa  312  2.9999999999999996e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0304  uridylate kinase  63.56 
 
 
249 aa  312  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336367  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1493  uridylate kinase  62.18 
 
 
243 aa  311  4.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.452684  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2046  uridylate kinase  62.08 
 
 
239 aa  311  9e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.198854  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3731  uridylate kinase  62.34 
 
 
239 aa  310  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000303912  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2460  uridylate kinase  63.49 
 
 
249 aa  310  1e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.930006  hitchhiker  0.000425697 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1780  uridylate kinase  61.28 
 
 
245 aa  309  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2473  uridylate kinase  62.23 
 
 
240 aa  306  1.0000000000000001e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0628  uridylate kinase  60.61 
 
 
242 aa  306  2.0000000000000002e-82  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.440032 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0759  uridylate kinase  59.5 
 
 
244 aa  305  3e-82  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0066  uridylate kinase  61.04 
 
 
242 aa  305  3e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.815822  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3993  uridylate kinase  62.34 
 
 
244 aa  305  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.927712  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05481  uridylate kinase  59.05 
 
 
234 aa  303  1.0000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.35761  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0522  uridylate kinase  58.62 
 
 
234 aa  301  5.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1414  uridylate kinase  63.79 
 
 
249 aa  301  5.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.305711 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07621  uridylate kinase  60.52 
 
 
237 aa  301  5.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0651167 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05861  uridylate kinase  58.62 
 
 
234 aa  301  6.000000000000001e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0506  uridylate kinase  61.04 
 
 
253 aa  300  1e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0266  uridylate kinase  60.34 
 
 
244 aa  300  1e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3779  uridylate kinase  58.01 
 
 
244 aa  300  1e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591518 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05781  uridylate kinase  58.19 
 
 
234 aa  299  2e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.155099  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23620  uridylate kinase  59.32 
 
 
238 aa  299  3e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.240792 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2559  uridylate kinase  58.87 
 
 
240 aa  299  3e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1919  uridylate kinase  59.75 
 
 
241 aa  298  6e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.6242299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2697  uridylate kinase  59.74 
 
 
240 aa  298  6e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05791  uridylate kinase  58.8 
 
 
237 aa  297  8e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1854  uridylate kinase  58.8 
 
 
237 aa  297  8e-80  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1446  uridylate kinase  61.95 
 
 
241 aa  298  8e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4636  uridylate kinase  58.87 
 
 
242 aa  298  8e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.426273  normal  0.860476 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1162  uridylate kinase  61.95 
 
 
241 aa  298  8e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.899352 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05241  uridylate kinase  57.45 
 
 
237 aa  297  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.87702  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3547  uridylate kinase  58.87 
 
 
240 aa  297  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07670  uridylate kinase  59.75 
 
 
239 aa  296  1e-79  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000164144  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1648  uridylate kinase  62.5 
 
 
237 aa  296  2e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0115  uridylate kinase  57.08 
 
 
235 aa  296  2e-79  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10930  uridylate kinase  59.23 
 
 
240 aa  292  3e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0253389  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3707  uridylate kinase  57.81 
 
 
240 aa  290  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0190689  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0884  uridylate kinase  57.26 
 
 
237 aa  290  1e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2035  uridylate kinase  57.2 
 
 
240 aa  287  9e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0711  uridylate kinase  62.39 
 
 
237 aa  287  9e-77  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1129  uridylate kinase  57.5 
 
 
238 aa  286  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.168829  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0575  uridylate kinase  58.87 
 
 
236 aa  287  1e-76  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000374821  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0707  uridylate kinase  58.87 
 
 
274 aa  285  4e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000695592  unclonable  0.0000000228976 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1861  uridylate kinase  60 
 
 
242 aa  285  4e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57108  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2037  uridylate kinase  60.61 
 
 
237 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865842  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1259  uridylate kinase  60.61 
 
 
237 aa  285  5e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.370411  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1943  uridylate kinase  59.48 
 
 
239 aa  285  5e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6060  uridylate kinase  60.61 
 
 
237 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2017  uridylate kinase  60.61 
 
 
237 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1464  uridylate kinase  61.37 
 
 
246 aa  285  5.999999999999999e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.360774  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0426  uridylate kinase  57.63 
 
 
239 aa  284  8e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.777884  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0009  uridylate kinase  58.77 
 
 
261 aa  284  8e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.137208  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1879  uridylate kinase  60.09 
 
 
236 aa  284  8e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.422558  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2029  uridylate kinase  59.74 
 
 
237 aa  284  8e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1437  uridylate kinase  59.49 
 
 
258 aa  284  8e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.439884  hitchhiker  0.000435544 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0520  uridylate kinase  61.47 
 
 
237 aa  284  8e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3257  uridylate kinase  59.74 
 
 
237 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2491  uridylate kinase  59.74 
 
 
237 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2453  uridylate kinase  59.74 
 
 
237 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.176053  hitchhiker  0.00168891 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1406  uridylate kinase  59.66 
 
 
236 aa  283  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1553  uridylate kinase  59.74 
 
 
237 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2581  uridylate kinase  59.74 
 
 
237 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5327  uridylate kinase  60.17 
 
 
237 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0388616  normal  0.289961 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1326  uridylate kinase  59.74 
 
 
237 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.280205  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1976  uridylate kinase  56.36 
 
 
242 aa  283  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0392494  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2054  uridylate kinase  58.9 
 
 
286 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2435  uridylate kinase  59.74 
 
 
237 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0771842  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0509  uridylate kinase  60.09 
 
 
236 aa  283  2.0000000000000002e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.00424433  normal  0.390175 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1344  uridylate kinase  58.8 
 
 
236 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0291388  normal  0.514352 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1280  uridylate kinase  58.8 
 
 
236 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.23079 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0405  uridylate kinase  57.14 
 
 
235 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.899064  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1897  uridylate kinase  56.03 
 
 
235 aa  283  2.0000000000000002e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.12781  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2920  uridylate kinase  59 
 
 
238 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.402742 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1528  uridylate kinase  59.29 
 
 
238 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000286053  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1684  uridylate kinase  59.74 
 
 
237 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.193496 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2378  uridylate kinase  58.12 
 
 
239 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1336  uridylate kinase  59.74 
 
 
237 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.399857  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1161  uridylate kinase  56.67 
 
 
242 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1143  uridylate kinase  55.51 
 
 
240 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000986718  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1919  uridylate kinase  60.17 
 
 
237 aa  282  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.302064 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>