50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2764 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2764  ribosomal protein L32  100 
 
 		 46 aa  97.4  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000122605 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4153  50S ribosomal protein L32  73.33 
 
 		 61 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.867327 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3825  50S ribosomal protein L32  73.33 
 
 		 61 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.828831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3119  50S ribosomal protein L32  71.11 
 
 		 61 aa  75.5  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0820  50S ribosomal protein L32  77.27 
 
 		 62 aa  75.5  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177127 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1411  50S ribosomal protein L32P  69.57 
 
 		 60 aa  74.7  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.361798  hitchhiker  0.00000964737 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4342  50S ribosomal protein L32  71.11 
 
 		 61 aa  73.9  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3426  50S ribosomal protein L32  73.33 
 
 		 60 aa  73.9  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0122  50S ribosomal protein L32  72.73 
 
 		 61 aa  73.2  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1710  50S ribosomal protein L32  68.89 
 
 		 59 aa  72  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.142223  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0425  50S ribosomal protein L32  70.45 
 
 		 63 aa  72.4  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.311335 
 
 
-
 
NC_004310  BR1775  50S ribosomal protein L32  68.89 
 
 		 59 aa  72  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3111  50S ribosomal protein L32  69.57 
 
 		 61 aa  71.2  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3466  50S ribosomal protein L32  70.45 
 
 		 62 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.357647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3774  50S ribosomal protein L32  70.45 
 
 		 62 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3664  50S ribosomal protein L32  70.45 
 
 		 62 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.416645  normal  0.271996 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5920  50S ribosomal protein L32  67.39 
 
 		 61 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5277  50S ribosomal protein L32  67.39 
 
 		 61 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.5638  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5115  50S ribosomal protein L32  70.45 
 
 		 62 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.637 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1128  ribosomal protein L32  66.67 
 
 		 59 aa  68.6  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.798956  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0499  50S ribosomal protein L32  66.67 
 
 		 60 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00950666 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0497  50S ribosomal protein L32  63.04 
 
 		 61 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0527  50S ribosomal protein L32  64.44 
 
 		 60 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7619  50S ribosomal protein L32P  64.44 
 
 		 46 aa  66.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00560447  normal  0.375625 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0625  50S ribosomal protein L32  60.87 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19517  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1559  ribosomal protein L32  68.18 
 
 		 60 aa  65.1  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0311  50S ribosomal protein L32  62.22 
 
 		 60 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.953611 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0514  50S ribosomal protein L32  62.22 
 
 		 60 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3554  50S ribosomal protein L32  52.38 
 
 		 59 aa  51.6  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.873264  normal  0.953551 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0271  50S ribosomal protein L32  47.83 
 
 		 67 aa  52  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.750719  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1665  50S ribosomal protein L32  47.62 
 
 		 61 aa  50.4  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0871064  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2467  ribosomal protein L32  45.65 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000135728  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2368  50S ribosomal protein L32  47.62 
 
 		 59 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3291  50S ribosomal protein L32  45.24 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.366938 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1420  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 59 aa  44.3  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.640468  normal  0.982205 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2129  ribosomal protein L32  51.16 
 
 		 59 aa  43.9  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120071  normal  0.0237649 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1786  50S ribosomal protein L32  44.44 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.213514  normal  0.442946 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1272  50S ribosomal protein L32  45.24 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.165805 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0633  ribosomal protein L32  46.51 
 
 		 63 aa  43.1  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2614  50S ribosomal protein L32  45.24 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.417222  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1910  50S ribosomal protein L32  45.24 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0633  ribosomal protein L32  43.9 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1870  ribosomal protein L32  43.48 
 
 		 59 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.819487  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0386  50S ribosomal protein L32  43.59 
 
 		 59 aa  41.2  0.005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0173336  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0916  50S ribosomal protein L32  48.78 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1585  50S ribosomal protein L32  48.89 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0810373  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0600  50S ribosomal protein L32  48.89 
 
 		 64 aa  40.8  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113317  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1859  50S ribosomal protein L32  45.24 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.898391  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0013  50S ribosomal protein L32  42.86 
 
 		 60 aa  40.4  0.009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3599  ribosomal protein L32  41.46 
 
 		 59 aa  40  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.590227  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>