240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2682 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  419  1e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  68.66 
 
 
209 aa  290  8e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  68.16 
 
 
210 aa  289  3e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  67.16 
 
 
207 aa  288  5.0000000000000004e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  66.18 
 
 
205 aa  287  8e-77  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  66.34 
 
 
230 aa  284  5e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  68.66 
 
 
212 aa  283  9e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  67.66 
 
 
206 aa  283  1.0000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  67.66 
 
 
202 aa  281  6.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  66.83 
 
 
207 aa  280  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  67.16 
 
 
209 aa  280  1e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  66.34 
 
 
207 aa  279  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  64.71 
 
 
205 aa  277  8e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  65.52 
 
 
206 aa  277  9e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  64.18 
 
 
209 aa  271  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  63.24 
 
 
206 aa  271  4.0000000000000004e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  63.68 
 
 
208 aa  271  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  63.24 
 
 
205 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  63.37 
 
 
209 aa  270  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  63.68 
 
 
201 aa  268  5e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  62.69 
 
 
207 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  65.33 
 
 
209 aa  267  7e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  65.33 
 
 
208 aa  267  8e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  64.82 
 
 
210 aa  266  2e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  64.82 
 
 
208 aa  265  2.9999999999999995e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  61 
 
 
205 aa  265  4e-70  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  64.82 
 
 
208 aa  265  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  62.69 
 
 
201 aa  263  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  63.18 
 
 
207 aa  263  1e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  62.69 
 
 
201 aa  263  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  63.18 
 
 
221 aa  262  3e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  63.18 
 
 
201 aa  262  3e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  62.87 
 
 
209 aa  262  3e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  63.32 
 
 
209 aa  261  4.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  63.32 
 
 
209 aa  260  8e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  63.32 
 
 
209 aa  260  8e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  63.32 
 
 
209 aa  260  8.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  63.32 
 
 
209 aa  260  1e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  61 
 
 
209 aa  259  2e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  64 
 
 
209 aa  258  4e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  62.81 
 
 
203 aa  252  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  61.19 
 
 
205 aa  252  3e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  59.61 
 
 
208 aa  248  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  61.62 
 
 
216 aa  248  6e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  59.61 
 
 
208 aa  248  7e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  60.1 
 
 
208 aa  246  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  59.11 
 
 
208 aa  245  3e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  60.1 
 
 
221 aa  245  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  54.15 
 
 
208 aa  234  5.0000000000000005e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  55.5 
 
 
218 aa  233  1.0000000000000001e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  57 
 
 
184 aa  228  5e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  61.29 
 
 
202 aa  221  4.9999999999999996e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6309  hypothetical protein  54 
 
 
207 aa  221  6e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  54.04 
 
 
202 aa  211  7.999999999999999e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  49.75 
 
 
203 aa  190  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  49.22 
 
 
200 aa  185  5e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2270  hypothetical protein  51.58 
 
 
201 aa  184  7e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3787  hypothetical protein  63.31 
 
 
140 aa  184  7e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  51.58 
 
 
201 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  51.58 
 
 
201 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  48.99 
 
 
203 aa  181  9.000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  48.48 
 
 
203 aa  177  7e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  50.56 
 
 
212 aa  171  9e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  48.06 
 
 
201 aa  171  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  44.72 
 
 
209 aa  169  3e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0267  hypothetical protein  46.94 
 
 
209 aa  168  5e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  45.55 
 
 
208 aa  167  1e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  43.5 
 
 
201 aa  167  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.08 
 
 
203 aa  165  5e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  45.08 
 
 
203 aa  162  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  44.39 
 
 
201 aa  160  9e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  45.45 
 
 
194 aa  155  3e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  45.85 
 
 
201 aa  155  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  48.82 
 
 
241 aa  155  5.0000000000000005e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0487  flavin reductase domain-containing protein  43.94 
 
 
194 aa  151  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1838  hypothetical protein  43.94 
 
 
194 aa  150  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  43.13 
 
 
230 aa  150  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  43.13 
 
 
230 aa  150  1e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  42.18 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.78 
 
 
199 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  41.45 
 
 
209 aa  139  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3621  hypothetical protein  42.45 
 
 
220 aa  138  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  40.1 
 
 
228 aa  131  7.999999999999999e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1083  hypothetical protein  37.7 
 
 
204 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.2808  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4414  hypothetical protein  38.65 
 
 
218 aa  129  3e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.629184  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  42.61 
 
 
206 aa  128  6e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.55 
 
 
216 aa  125  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4263  flavin reductase domain-containing protein  41.11 
 
 
210 aa  124  6e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  39.53 
 
 
200 aa  123  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1981  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  38.12 
 
 
197 aa  122  4e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.780004  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5933  hypothetical protein  36.65 
 
 
209 aa  122  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5247  hypothetical protein  39.9 
 
 
216 aa  117  9e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3627  hypothetical protein  37.17 
 
 
202 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.174937  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1593  hypothetical protein  36.98 
 
 
291 aa  116  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0762  flavin reductase domain protein FMN-binding  38.1 
 
 
203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2815  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  44.3 
 
 
219 aa  115  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112665  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0412  hypothetical protein  33.87 
 
 
206 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2452  hypothetical protein  36.08 
 
 
201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.108576  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  42.47 
 
 
203 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2857  hypothetical protein  33.51 
 
 
200 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>