109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2680 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2680  FAD-linked oxidoreductase  100 
 
 		 424 aa  868    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.845872  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3174  FAD-linked oxidoreductase  58.19 
 
 		 417 aa  471  1e-132  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.361801 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2981  FAD-linked oxidoreductase  41.72 
 
 		 440 aa  293  5e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.532365 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11799  oxidoreductase  36.77 
 
 		 428 aa  281  1e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.983221  hitchhiker  0.000835629 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0594  FAD-linked oxidoreductase  34.5 
 
 		 437 aa  276  4e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0747  oxidoreductase, FAD-binding  34.8 
 
 		 437 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286791  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0668  FAD-linked oxidoreductase  38.19 
 
 		 447 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493433  hitchhiker  0.000925445 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0807  oxidoreductase, FAD-binding  35.03 
 
 		 437 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.427447  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4626  flavin-dependent dehydrogenase  35.29 
 
 		 434 aa  275  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.278629  hitchhiker  0.000000015326 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0590  FAD-dependent oxidoreductase  34.27 
 
 		 437 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0381826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0591  FAD-dependent oxidoreductase  34.27 
 
 		 437 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0710  oxidoreductase, FAD-binding  35.29 
 
 		 438 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.248836  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0735  oxidoreductase, FAD-binding  34.27 
 
 		 437 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.70563e-29 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0646  oxidoreductase, FAD-binding  34.03 
 
 		 437 aa  272  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0680  FAD-binding oxidoreductase  34.03 
 
 		 437 aa  272  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.569946  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1740  FAD-linked oxidoreductase  38.39 
 
 		 460 aa  269  7e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.877746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0570  FAD-linked oxidoreductase  33.02 
 
 		 437 aa  265  8e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00510  FAD-linked oxidoreductase  37.39 
 
 		 452 aa  262  8.999999999999999e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.740797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3008  FAD-linked oxidoreductase  36.57 
 
 		 470 aa  255  9e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.562245  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0567  FAD-linked oxidoreductase  36.36 
 
 		 435 aa  253  5.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2494  FAD-linked oxidoreductase  36.32 
 
 		 464 aa  252  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00941267  normal  0.521213 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4026  FAD-linked oxidoreductase  36.89 
 
 		 437 aa  251  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0030  FAD-linked oxidoreductase  36.13 
 
 		 425 aa  247  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4703  FAD-linked oxidoreductase  34.79 
 
 		 437 aa  245  9e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.553428 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6103  putative oxidoreductase  35.05 
 
 		 464 aa  244  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.46461  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70330  putative oxidoreductase  35.58 
 
 		 442 aa  242  7.999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4407  FAD-linked oxidoreductase  35.63 
 
 		 437 aa  239  5.999999999999999e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.311331  normal  0.03216 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31780  FAD-linked oxidoreductase  34.11 
 
 		 486 aa  239  1e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.546471  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1688  FAD-linked oxidoreductase  34.58 
 
 		 441 aa  237  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00023644  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1899  FAD-linked oxidoreductase  34.71 
 
 		 438 aa  236  8e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0587039  decreased coverage  0.00000156043 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7369  FAD-linked oxidoreductase  32.95 
 
 		 434 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0322  FAD-linked oxidoreductase  32.55 
 
 		 412 aa  233  7.000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.34325 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1946  FAD-linked oxidoreductase  34.92 
 
 		 433 aa  231  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3584  FAD-linked oxidoreductase  33.33 
 
 		 423 aa  231  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2955  FAD-linked oxidoreductase  34.2 
 
 		 475 aa  223  4e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0094  FAD-linked oxidoreductase  31.62 
 
 		 469 aa  223  7e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1521  FAD-linked oxidoreductase  34.72 
 
 		 445 aa  222  9e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2890  FAD-linked oxidoreductase  33.72 
 
 		 432 aa  222  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.632681  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5223  oxidoreductase  33.73 
 
 		 429 aa  219  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0346  FAD-linked oxidoreductase  32.65 
 
 		 473 aa  217  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.18488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13140  FAD-linked oxidoreductase  32.24 
 
 		 436 aa  216  5.9999999999999996e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.828349  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5198  FAD-linked oxidoreductase  32.31 
 
 		 415 aa  212  9e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3361  FAD-linked oxidoreductase  32.08 
 
 		 415 aa  212  9e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.935953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2756  FAD-linked oxidoreductase  33.02 
 
 		 415 aa  209  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1281  FAD-linked oxidoreductase  31.51 
 
 		 439 aa  206  9e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.951079  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1084  FAD linked oxidase domain-containing protein  32.19 
 
 		 445 aa  203  5e-51  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160228 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2050  FAD-linked oxidoreductase  33.56 
 
 		 439 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614884  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1716  FAD-linked oxidoreductase  35.06 
 
 		 466 aa  200  5e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0745326  normal  0.233411 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2304  FAD-linked oxidoreductase  32.04 
 
 		 427 aa  192  7e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.613006  normal  0.539077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6780  L-gulonolactone oxidase  31.46 
 
 		 438 aa  192  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.244692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4040  FAD linked oxidase domain-containing protein  30.84 
 
 		 409 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.7202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3910  FAD-linked oxidoreductase  29.34 
 
 		 411 aa  180  4e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0723  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.8 
 
 		 417 aa  149  6e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.608067  normal  1 
 
 
-
 
NC_006683  CNN01640  D-arabinono-1,4-lactone oxidase, putative  27.63 
 
 		 478 aa  144  4e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0055  FAD linked oxidase domain protein  27.59 
 
 		 418 aa  140  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3313  FAD linked oxidase domain protein  25.88 
 
 		 437 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6373  FAD linked oxidase domain protein  24.48 
 
 		 448 aa  130  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4763  FAD linked oxidase domain protein  28.47 
 
 		 418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2461  FAD linked oxidase domain protein  27.35 
 
 		 446 aa  127  5e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0132969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2313  sorbitol oxidase  27.94 
 
 		 427 aa  123  5e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2565  FAD linked oxidase domain protein  26.71 
 
 		 421 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0930  FAD linked oxidase domain protein  28.31 
 
 		 423 aa  121  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29560  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  26.93 
 
 		 429 aa  120  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4010  FAD linked oxidase domain-containing protein  27 
 
 		 449 aa  110  6e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2879  FAD linked oxidase domain protein  27.92 
 
 		 421 aa  106  6e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00684532 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2301  FAD linked oxidase domain protein  26.09 
 
 		 413 aa  106  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000142311  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1977  FAD linked oxidase domain protein  28.17 
 
 		 424 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.265548  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00836  D-Arabinono-1,4-lactone oxidase (Eurofung)  25.23 
 
 		 574 aa  101  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.764968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35760  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  25 
 
 		 462 aa  99  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.744016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_88335  D-arabinono-1,4-lactone oxidase (ALO) (L-galactono-gamma-lactone oxidase)  26.52 
 
 		 556 aa  96.3  9e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.766269  normal  0.0733119 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3634  FAD linked oxidase domain protein  25.29 
 
 		 430 aa  88.6  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.263077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14850  D-arabinono-1,4-lactone oxidase  28.32 
 
 		 246 aa  88.6  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00156556  normal  0.178862 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23292  L-galactono-1,4-lactone dehydrogenase  26.14 
 
 		 572 aa  85.1  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.260276  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0598  FAD linked oxidase domain-containing protein  24.41 
 
 		 504 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.7417 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_1854  predicted protein  23.79 
 
 		 483 aa  77.4  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.438498  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1732  FAD linked oxidase domain protein  24.49 
 
 		 475 aa  66.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1781  FAD/FMN-containing dehydrogenase  24.46 
 
 		 642 aa  58.9  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.926813  normal  0.0106686 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02192  conserved hypothetical protein  35.56 
 
 		 376 aa  58.2  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0118307  normal  0.261701 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2461  putative oxidoreductase  28.57 
 
 		 452 aa  58.2  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.203738  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0142  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.65 
 
 		 432 aa  57.4  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5285  FAD linked oxidase domain protein  24.27 
 
 		 366 aa  57  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.288656  normal  0.274846 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0270  FAD linked oxidase domain protein  28.96 
 
 		 455 aa  57  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.865067 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6248  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.51 
 
 		 433 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.987377  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1966  FAD linked oxidase domain protein  30.34 
 
 		 378 aa  53.9  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00596955  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0859  L-gulonolactone oxidase  24.39 
 
 		 481 aa  52.4  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1111  FAD binding domain-containing protein  28 
 
 		 481 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.287749 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3577  FAD linked oxidase-like  29.2 
 
 		 495 aa  49.3  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.310441  normal  0.085604 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1142  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.32 
 
 		 445 aa  49.7  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.125202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0328  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.63 
 
 		 433 aa  49.3  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.382424  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2566  oxidoreductase, FAD-binding, putative  29.22 
 
 		 433 aa  48.9  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14476  predicted protein  27.75 
 
 		 558 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4086  FAD linked oxidase domain protein  28.79 
 
 		 539 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503677  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1011  FAD linked oxidase domain protein  26.35 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.765853 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4954  FAD linked oxidase domain-containing protein  25.38 
 
 		 462 aa  47.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4213  FAD linked oxidase-like  22.66 
 
 		 464 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.82131 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4288  hypothetical protein  34.33 
 
 		 69 aa  45.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0353708 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1404  FAD-binding protein  25.93 
 
 		 578 aa  45.1  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4907  FAD linked oxidase-like protein  22.89 
 
 		 459 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4996  FAD linked oxidase domain-containing protein  22.89 
 
 		 459 aa  44.7  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  27.27 
 
 		 481 aa  44.7  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>