More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2641 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2641  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 
228 aa  453  1.0000000000000001e-126  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1581  ThiJ/PfpI domain-containing protein  51.56 
 
 
193 aa  168  7e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.183616 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2581  AraC family transcriptional regulator  43.62 
 
 
198 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.898766  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2164  ThiJ/PfpI domain protein  43.3 
 
 
202 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000571514 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2427  transcriptional regulator, AraC family  45.26 
 
 
198 aa  154  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.424893 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2867  transcriptional regulator, AraC family  45.26 
 
 
198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2656  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.09 
 
 
198 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102982  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2901  transcriptional regulator, AraC family; protease  44.68 
 
 
197 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2626  ThiJ/PfpI domain-containing protein  47.89 
 
 
199 aa  150  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.618286  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1495  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.32 
 
 
199 aa  149  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2883  hypothetical protein  45.21 
 
 
198 aa  144  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00738999  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.78 
 
 
207 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6177  ThiJ/PfpI domain protein  47.21 
 
 
207 aa  142  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0454094 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3414  hypothetical protein  41.97 
 
 
196 aa  141  6e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30652  normal  0.0495124 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0470  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.36 
 
 
210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2521  ThiJ/PfpI  44.1 
 
 
205 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.572774  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2739  ThiJ/PfpI  40.3 
 
 
201 aa  138  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.446828 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2951  ThiJ/PfpI domain protein  39.2 
 
 
254 aa  136  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.667358  normal  0.0783376 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0813  hypothetical protein  40.61 
 
 
198 aa  135  6.0000000000000005e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.396328  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2087  ThiJ/PfpI domain protein  42.63 
 
 
199 aa  134  8e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2446  ThiJ/PfpI family protein  37.97 
 
 
329 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2954  ThiJ/PfpI family protein  38.81 
 
 
201 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0165103  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1334  ThiJ/PfpI  42.41 
 
 
199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1462  ThiJ/PfpI domain protein  44.95 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2623  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.96 
 
 
242 aa  126  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2928  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.81 
 
 
233 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.012618  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0416  ThiJ/PfpI domain protein  39.36 
 
 
218 aa  125  5e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1154  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.78 
 
 
234 aa  124  9e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0937941 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1313  ThiJ/PfpI domain protein  42.78 
 
 
234 aa  124  9e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0812761  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2791  ThiJ/PfpI  35.38 
 
 
194 aa  124  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0140  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.52 
 
 
226 aa  122  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3528  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.57 
 
 
198 aa  122  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0079  ThiJ/PfpI domain protein  44.28 
 
 
239 aa  121  7e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245604  normal  0.248016 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1835  ThiJ/PfpI  39.2 
 
 
228 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1200  hypothetical protein  35.84 
 
 
241 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1507  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.79 
 
 
191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.233301  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3444  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.4 
 
 
188 aa  119  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1194  hypothetical protein  35.84 
 
 
241 aa  119  4.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2109  ThiJ/PfpI domain protein  39.68 
 
 
233 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0113293  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1644  transcriptional regulator  39.2 
 
 
220 aa  119  6e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3285  AraC family transcriptional regulator  41.04 
 
 
209 aa  118  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.898909 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3518  ThiJ/PfpI domain protein  40.11 
 
 
226 aa  118  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.553455  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1849  ThiJ/PfpI domain protein  40.64 
 
 
225 aa  117  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0641926  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1967  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.75 
 
 
226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.428082  normal  0.019614 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5782  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.58 
 
 
206 aa  116  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.639034  hitchhiker  0.00267139 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.81 
 
 
225 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0747669 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3318  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.5 
 
 
224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.652911 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3642  ThiJ/PfpI domain protein  39.04 
 
 
224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.667474  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3383  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.28 
 
 
225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0102  ThiJ/PfpI domain-containing protein  32.32 
 
 
227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0954  DJ-1/PfpI family protein  40 
 
 
691 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2666  isonitrile hydratase, putative  40 
 
 
242 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2320  ThiJ/PfpI domain protein  35.83 
 
 
228 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.931935 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2525  isonitrile hydratase  40 
 
 
242 aa  111  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0217881  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1415  DJ-1/PfpI family protein  40 
 
 
242 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2269  ThiJ/PfpI domain protein  35.83 
 
 
228 aa  112  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0232  DJ-1/PfpI family protein  40.11 
 
 
232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0269  DJ-1/PfpI family protein  40.11 
 
 
232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1680  ThiJ/PfpI domain protein  40.4 
 
 
207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.883371  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1611  DJ-1/PfpI family protein  40.11 
 
 
232 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2700  ThiJ/PfpI domain protein  37.97 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0269047  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0514  DJ-1/PfpI family protein  40.64 
 
 
238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2887  ThiJ/PfpI  38.42 
 
 
233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00139108  normal  0.0511878 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2562  ThiJ/PfpI domain protein  39.46 
 
 
198 aa  109  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4368  ThiJ/PfpI domain-containing protein  42.37 
 
 
276 aa  110  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3031  ThiJ/PfpI  40.1 
 
 
234 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.140928  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0354  ThiJ/PfpI  35.5 
 
 
225 aa  108  5e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0471248 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2904  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.71 
 
 
225 aa  108  6e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  36.17 
 
 
349 aa  108  8.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2687  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.43 
 
 
227 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4844  ThiJ/PfpI domain protein  42.94 
 
 
242 aa  107  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2047  ThiJ/PfpI  37.43 
 
 
227 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2658  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.43 
 
 
227 aa  107  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152452  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2019  ThiJ/PfpI domain protein  42.55 
 
 
204 aa  105  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5674  ThiJ/PfpI domain protein  39.15 
 
 
212 aa  106  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3669  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.8 
 
 
241 aa  105  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2759  ThiJ/PfpI domain protein  35.23 
 
 
211 aa  105  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.215201 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2969  ThiJ/PfpI domain protein  38.14 
 
 
205 aa  105  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.289839  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08527  ThiJ/PfpI family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G14240)  33.5 
 
 
284 aa  104  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0997255 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1435  ThiJ/PfpI domain protein  37.5 
 
 
199 aa  104  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3148  ThiJ/PfpI domain protein  39.57 
 
 
229 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5266  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.98 
 
 
246 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.55571 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  40.1 
 
 
324 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0748  ThiJ/PfpI  37.23 
 
 
245 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.958247  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  40.96 
 
 
316 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0762  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.23 
 
 
245 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.100444  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0742  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.23 
 
 
245 aa  101  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0649323  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  40.84 
 
 
357 aa  100  1e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  39.3 
 
 
334 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0973  ThiJ/PfpI domain-containing protein  33.33 
 
 
249 aa  100  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  38.81 
 
 
334 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0031  ThiJ/PfpI  39.36 
 
 
232 aa  99.4  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0533722 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  41.08 
 
 
320 aa  99.4  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4460  ThiJ/PfpI domain protein  34.57 
 
 
243 aa  99  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.322473  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1594  ThiJ/PfpI domain protein  33.82 
 
 
203 aa  99  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.157689 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 
327 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3105  ThiJ/PfpI domain protein  35.48 
 
 
231 aa  98.6  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4230  hypothetical protein  35.79 
 
 
232 aa  98.2  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2098  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.55 
 
 
231 aa  97.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4082  ThiJ/PfpI domain-containing protein  31.58 
 
 
237 aa  96.7  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>