More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2571 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2571  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
473 aa  957    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1295  peptidase M48, Ste24p  48.13 
 
 
453 aa  374  1e-102  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.226604  normal  0.704605 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3280  peptidase M48 Ste24p  39.96 
 
 
452 aa  299  7e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.227869  normal  0.68858 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3013  peptidase M48, Ste24p  37.86 
 
 
475 aa  272  8.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0874514  normal  0.639267 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2723  peptidase M48 Ste24p  37.19 
 
 
475 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.205433  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2439  peptidase M48, Ste24p  37.33 
 
 
475 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.496916 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2861  peptidase M48, Ste24p  37.5 
 
 
472 aa  259  9e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.750031 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4208  hypothetical protein  35.76 
 
 
465 aa  255  9e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.961779  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3498  peptidase M48 Ste24p  36.38 
 
 
475 aa  253  5.000000000000001e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.814298  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1712  peptidase M48, Ste24p  37.56 
 
 
491 aa  253  6e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.189246  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1749  peptidase M48, Ste24p  35.48 
 
 
477 aa  244  3e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0882405  normal  0.165401 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2184  peptidase M48, Ste24p  34.6 
 
 
473 aa  239  9e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0230  peptidase M48, Ste24p  36.66 
 
 
461 aa  228  1e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0393595  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3171  peptidase M48, Ste24p  36.84 
 
 
467 aa  229  1e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0504963  normal  0.228205 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3849  peptidase M48, Ste24p  36.92 
 
 
460 aa  226  7e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.123819  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2425  peptidase M48  38.02 
 
 
457 aa  224  3e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.716938  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2270  peptidase M48 Ste24p  33.86 
 
 
471 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0906  hypothetical protein  33.26 
 
 
489 aa  208  2e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.362461  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0910  hypothetical protein  33.26 
 
 
471 aa  208  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0661  peptidase M48, Ste24p  29.75 
 
 
435 aa  194  2e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0347  M48 family peptidase  30.77 
 
 
435 aa  194  4e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1167  peptidase M48 Ste24p  33.41 
 
 
448 aa  193  4e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.136165  normal  0.923958 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0864  peptidase M48, Ste24p  32.85 
 
 
473 aa  169  1e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0891552  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0652  M48 family peptidase  27.71 
 
 
426 aa  162  1e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.59081  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  26.36 
 
 
484 aa  116  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  26.51 
 
 
486 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  26.68 
 
 
502 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  26.65 
 
 
489 aa  108  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  25.46 
 
 
489 aa  108  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  25.42 
 
 
486 aa  106  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  26.39 
 
 
489 aa  106  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  0.00000000108832 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  26.12 
 
 
489 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  24.58 
 
 
485 aa  105  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0492  peptidase M48 Ste24p  32.7 
 
 
553 aa  103  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0157273 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1913  peptidase M48, Ste24p  25.36 
 
 
489 aa  104  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.910226  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  25.53 
 
 
485 aa  102  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1647  peptidase M48, Ste24p  26.35 
 
 
490 aa  101  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0056  peptidase M48, Ste24p  25.43 
 
 
461 aa  101  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.147991 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  26.71 
 
 
487 aa  100  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  27.76 
 
 
474 aa  100  4e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4033  peptidase M48, Ste24p  27.45 
 
 
521 aa  100  6e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0860  peptidase M48 Ste24p  31.37 
 
 
541 aa  100  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.283962 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  25.07 
 
 
489 aa  100  8e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  25.07 
 
 
489 aa  100  8e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  25.07 
 
 
489 aa  100  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  27.95 
 
 
480 aa  100  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  25.07 
 
 
489 aa  100  8e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  37.35 
 
 
533 aa  99.4  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3383  peptidase M48 Ste24p  32.17 
 
 
521 aa  99.4  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4676  peptidase M48, Ste24p  31.86 
 
 
554 aa  98.6  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3919  peptidase M48, Ste24p  31.88 
 
 
549 aa  98.6  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749041  hitchhiker  0.000945115 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  25.51 
 
 
483 aa  98.2  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  25.4 
 
 
605 aa  98.2  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  24.46 
 
 
483 aa  97.1  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2437  peptidase M48, Ste24p  25.71 
 
 
486 aa  97.1  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00870552 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  25.85 
 
 
488 aa  97.1  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  25.51 
 
 
521 aa  96.7  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  24.81 
 
 
484 aa  96.7  9e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  27.3 
 
 
470 aa  96.3  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0209  hypothetical protein  25.63 
 
 
561 aa  96.3  1e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  25.91 
 
 
478 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  25.91 
 
 
478 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  25.91 
 
 
478 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  26.7 
 
 
573 aa  94.4  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1755  peptidase M48, Ste24p  26.98 
 
 
489 aa  94.4  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  25.52 
 
 
561 aa  93.6  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  27.46 
 
 
479 aa  93.6  7e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0229  peptidase M48, Ste24p  25.07 
 
 
553 aa  93.6  8e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00038191  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1695  peptidase M48, Ste24p  25.08 
 
 
490 aa  93.2  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160832  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03193  protease  23.04 
 
 
484 aa  92  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  26.17 
 
 
478 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  25.33 
 
 
487 aa  91.7  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  31.31 
 
 
564 aa  91.3  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  31.31 
 
 
564 aa  91.7  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  34.2 
 
 
562 aa  91.3  4e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  27.45 
 
 
477 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0568  M48 family peptidase  27.96 
 
 
518 aa  90.9  5e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.017113  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0581  peptidase M48 Ste24p  26.77 
 
 
424 aa  90.9  5e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0013814  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4669  peptidase M48, Ste24p  29.47 
 
 
514 aa  90.1  7e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  24.35 
 
 
483 aa  90.1  8e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  30.81 
 
 
588 aa  90.1  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  30.81 
 
 
564 aa  90.1  8e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  30.81 
 
 
588 aa  90.1  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  33.68 
 
 
565 aa  89.7  9e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  32.12 
 
 
572 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  32.12 
 
 
560 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1543  peptidase M48, Ste24p  26.68 
 
 
477 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  25 
 
 
524 aa  89.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  32.12 
 
 
572 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4041  peptidase M48, Ste24p  28.22 
 
 
548 aa  89.7  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  32.12 
 
 
572 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  32.12 
 
 
572 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  32.12 
 
 
589 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  32.12 
 
 
589 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  25 
 
 
494 aa  89  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  25 
 
 
494 aa  89  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0679  peptidase M48 Ste24p  27.39 
 
 
472 aa  88.2  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.156874  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  30.3 
 
 
588 aa  88.2  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  30.3 
 
 
589 aa  87.8  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2576  molybdopterin converting factor, subunit 1  24.79 
 
 
503 aa  87.4  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>