More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2502 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_3501  amidophosphoribosyltransferase  66.25 
 
 
509 aa  657    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4300  amidophosphoribosyltransferase  68.45 
 
 
491 aa  667    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.182299  normal  0.0484415 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2599  amidophosphoribosyltransferase  67.08 
 
 
499 aa  666    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0391838  normal  0.218764 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3932  amidophosphoribosyltransferase  68.45 
 
 
491 aa  667    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.961822  normal  0.0894126 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4629  amidophosphoribosyltransferase  68.24 
 
 
500 aa  660    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.691036  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2502  amidophosphoribosyltransferase  100 
 
 
500 aa  1019    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1499  amidophosphoribosyltransferase  63.52 
 
 
529 aa  636    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.338535  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2452  amidophosphoribosyltransferase  67.08 
 
 
514 aa  639    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.729356 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2282  amidophosphoribosyltransferase  65.74 
 
 
503 aa  649    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.235461  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2997  amidophosphoribosyltransferase  65.84 
 
 
514 aa  657    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.807987  normal  0.439972 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0983  amidophosphoribosyltransferase  63.51 
 
 
490 aa  638    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.592161  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3787  amidophosphoribosyltransferase  65.64 
 
 
510 aa  647    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0413  amidophosphoribosyltransferase  67.7 
 
 
491 aa  647    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.577853 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4407  amidophosphoribosyltransferase  68.24 
 
 
491 aa  663    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2400  amidophosphoribosyltransferase  66.46 
 
 
514 aa  678    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.453817  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0560  amidophosphoribosyltransferase  63.37 
 
 
496 aa  640    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.605887  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2311  amidophosphoribosyltransferase  69.57 
 
 
501 aa  671    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.672659  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3894  amidophosphoribosyltransferase  67.08 
 
 
491 aa  671    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.065306 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3487  amidophosphoribosyltransferase  67.99 
 
 
503 aa  675    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.746658  normal  0.621078 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1187  amidophosphoribosyltransferase  61.94 
 
 
496 aa  633  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.44974 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1042  amidophosphoribosyltransferase  62.55 
 
 
496 aa  634  1e-180  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.236184  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1205  amidophosphoribosyltransferase  63.43 
 
 
493 aa  625  1e-178  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0727  amidophosphoribosyltransferase  61.45 
 
 
496 aa  622  1e-177  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0446  amidophosphoribosyltransferase  63.58 
 
 
485 aa  619  1e-176  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0453  amidophosphoribosyltransferase  63.37 
 
 
509 aa  618  1e-176  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0404  amidophosphoribosyltransferase  62.13 
 
 
488 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305555  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0486  amidophosphoribosyltransferase  59.24 
 
 
496 aa  611  9.999999999999999e-175  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.937235  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2017  amidophosphoribosyltransferase  63.86 
 
 
504 aa  607  9.999999999999999e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2293  amidophosphoribosyltransferase  62.15 
 
 
504 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0578  amidophosphoribosyltransferase  61.04 
 
 
486 aa  599  1e-170  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1763  amidophosphoribosyltransferase  59 
 
 
496 aa  594  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.644721  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1541  amidophosphoribosyltransferase  60 
 
 
502 aa  592  1e-168  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267372  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0405  amidophosphoribosyltransferase  60.37 
 
 
493 aa  584  1.0000000000000001e-165  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2878  amidophosphoribosyltransferase  59.37 
 
 
517 aa  574  1.0000000000000001e-162  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.116336 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2454  amidophosphoribosyltransferase  57.77 
 
 
487 aa  552  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1117  amidophosphoribosyltransferase  57.77 
 
 
487 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.981489  normal  0.353735 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1062  amidophosphoribosyltransferase  57.26 
 
 
486 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.739126  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1707  amidophosphoribosyltransferase  55.21 
 
 
497 aa  542  1e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0317953  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3939  amidophosphoribosyltransferase  57.82 
 
 
499 aa  543  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2132  amidophosphoribosyltransferase  57.26 
 
 
508 aa  531  1e-150  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.864953  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1326  amidophosphoribosyltransferase  53.07 
 
 
468 aa  519  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1891  amidophosphoribosyltransferase  51.73 
 
 
477 aa  513  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2329  amidophosphoribosyltransferase  51.52 
 
 
477 aa  512  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.64237  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2702  amidophosphoribosyltransferase  53.1 
 
 
475 aa  509  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1636  amidophosphoribosyltransferase  52.81 
 
 
467 aa  509  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1939  amidophosphoribosyltransferase  53.57 
 
 
466 aa  511  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1153  amidophosphoribosyltransferase  53.45 
 
 
474 aa  509  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0265  amidophosphoribosyltransferase  53.53 
 
 
476 aa  504  1e-141  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1722  amidophosphoribosyltransferase  56.02 
 
 
481 aa  499  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.56305  normal  0.196104 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2068  amidophosphoribosyltransferase  49.89 
 
 
474 aa  500  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.286768  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2064  amidophosphoribosyltransferase  56.02 
 
 
475 aa  499  1e-140  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1109  amidophosphoribosyltransferase  52.62 
 
 
461 aa  488  1e-137  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1032  amidophosphoribosyltransferase  51.95 
 
 
495 aa  477  1e-133  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0276  amidophosphoribosyltransferase  50.87 
 
 
471 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4621  amidophosphoribosyltransferase  50.65 
 
 
482 aa  471  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.059877  normal  0.48412 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0274  amidophosphoribosyltransferase  50.43 
 
 
471 aa  471  1.0000000000000001e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0327  amidophosphoribosyltransferase  50.44 
 
 
471 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0324  amidophosphoribosyltransferase  50.44 
 
 
471 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0282  amidophosphoribosyltransferase  50.44 
 
 
471 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0267  amidophosphoribosyltransferase  50.44 
 
 
471 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0270  amidophosphoribosyltransferase  50.44 
 
 
471 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4361  amidophosphoribosyltransferase  51.16 
 
 
485 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0295  amidophosphoribosyltransferase  50.44 
 
 
471 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.312701  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4338  amidophosphoribosyltransferase  50.94 
 
 
485 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4979  amidophosphoribosyltransferase  50.44 
 
 
471 aa  467  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0368  amidophosphoribosyltransferase  50.44 
 
 
471 aa  468  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4354  amidophosphoribosyltransferase  50.63 
 
 
484 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.463043 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4206  amidophosphoribosyltransferase  50.95 
 
 
485 aa  464  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.975393  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0341  amidophosphoribosyltransferase  50.22 
 
 
471 aa  464  1e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1136  amidophosphoribosyltransferase  50.87 
 
 
470 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0878  glutamine phosphoribosylpyrophosphate amidotransferase  50.54 
 
 
503 aa  459  9.999999999999999e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.141495  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0299  amidophosphoribosyltransferase  50.11 
 
 
446 aa  456  1e-127  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0260  amidophosphoribosyltransferase  49.34 
 
 
470 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1871  amidophosphoribosyltransferase  50.34 
 
 
451 aa  455  1.0000000000000001e-126  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.10696  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2307  amidophosphoribosyltransferase  49.34 
 
 
467 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0139  amidophosphoribosyltransferase  48.12 
 
 
462 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2807  amidophosphoribosyltransferase  49.01 
 
 
462 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0321  amidophosphoribosyltransferase  47.44 
 
 
461 aa  451  1e-125  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1448  amidophosphoribosyltransferase  48.39 
 
 
474 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22120  amidophosphoribosyltransferase  50 
 
 
480 aa  446  1.0000000000000001e-124  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.357347  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0398  amidophosphoribosyltransferase  50.86 
 
 
480 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1102  amidophosphoribosyltransferase  49.35 
 
 
466 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0174  amidophosphoribosyltransferase  50.23 
 
 
445 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.838457  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0724  amidophosphoribosyltransferase  48.71 
 
 
536 aa  448  1.0000000000000001e-124  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1475  amidophosphoribosyltransferase  49.35 
 
 
472 aa  446  1.0000000000000001e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3588  amidophosphoribosyltransferase  49.49 
 
 
503 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.51846 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0026  amidophosphoribosyltransferase  46.44 
 
 
484 aa  444  1e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4217  amidophosphoribosyltransferase  49.36 
 
 
494 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0090  amidophosphoribosyltransferase  49 
 
 
462 aa  443  1e-123  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4178  amidophosphoribosyltransferase  49.36 
 
 
494 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2184  amidophosphoribosyltransferase  46 
 
 
487 aa  443  1e-123  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0674  amidophosphoribosyltransferase  46.97 
 
 
473 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0672  amidophosphoribosyltransferase  46.97 
 
 
473 aa  444  1e-123  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1249  amidophosphoribosyltransferase  49.35 
 
 
488 aa  441  9.999999999999999e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.917797  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3637  amidophosphoribosyltransferase  50.54 
 
 
499 aa  441  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.811729 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1632  amidophosphoribosyltransferase  49.78 
 
 
469 aa  440  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3699  amidophosphoribosyltransferase  48.7 
 
 
493 aa  439  9.999999999999999e-123  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.549743  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3212  amidophosphoribosyltransferase  49 
 
 
463 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.903412  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3396  amidophosphoribosyltransferase  49.46 
 
 
492 aa  441  9.999999999999999e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0189  amidophosphoribosyltransferase  48.76 
 
 
445 aa  436  1e-121  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>