More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2417 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2417  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
373 aa  739    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.267444 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3413  glycosyl transferase group 1  58.82 
 
 
365 aa  395  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1807  glycosyl transferase, group 1  56.02 
 
 
456 aa  383  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  41.4 
 
 
350 aa  108  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  29.84 
 
 
388 aa  102  2e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3212  glycosyl transferase group 1  39.66 
 
 
374 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.283031  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29990  Glycosyl transferase, group 1 family protein  33.45 
 
 
378 aa  101  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3084  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 
379 aa  100  5e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2202  glycosyl transferase, group 1  27.33 
 
 
394 aa  96.7  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  34.81 
 
 
378 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3344  glycosyl transferase, group 1  31.1 
 
 
384 aa  94.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.224872  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  25.36 
 
 
353 aa  93.6  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0104  glycosyl transferase group 1  25.68 
 
 
377 aa  92.4  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  26.3 
 
 
377 aa  90.9  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2849  glycosyl transferase, group 1  41.08 
 
 
407 aa  90.5  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.639359  normal  0.534113 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0291  glycosyl transferase, group 1  29.14 
 
 
382 aa  87.8  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.614818  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  37.58 
 
 
419 aa  88.2  2e-16  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  31.92 
 
 
366 aa  88.2  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2758  glycosyl transferase group 1  31.64 
 
 
356 aa  87.8  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0673851  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  27.07 
 
 
360 aa  86.7  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1977  glycosyl transferase, group 1  35.54 
 
 
403 aa  85.9  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
367 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  29.69 
 
 
367 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1909  glycosyl transferase group 1  32.08 
 
 
386 aa  83.6  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.653406  hitchhiker  0.000425018 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0313  glycosyl transferase group 1  24.36 
 
 
398 aa  83.2  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2407  glycosyl transferase, group 1  26.74 
 
 
387 aa  83.2  0.000000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.126337  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  30.03 
 
 
390 aa  83.2  0.000000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2192  glycosyl transferase, group 1  34.8 
 
 
437 aa  83.2  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.111626  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4759  glycosyl transferase group 1  29.54 
 
 
374 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000028902  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  31.03 
 
 
395 aa  82.4  0.00000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1084  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  36.08 
 
 
405 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  32.73 
 
 
409 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5356  glycosyl transferase group 1  38.54 
 
 
418 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.119029 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 
362 aa  81.6  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2379  glycosyl transferase, group 1  27.01 
 
 
381 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2702  polysaccharide pyruvyl transferase  23.82 
 
 
745 aa  82  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000746297  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2745  glycosyl transferase, group 1  37.31 
 
 
405 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.712111 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0430  glycosyl transferase group 1  26.69 
 
 
379 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0131441  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2717  glycosyl transferase, group 1  26.61 
 
 
389 aa  81.3  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.114307  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2407  glycosyl transferase, group 1  38.04 
 
 
404 aa  80.9  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0984  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 
403 aa  80.9  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137415 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  31.32 
 
 
399 aa  81.3  0.00000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  29.82 
 
 
396 aa  81.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0676  glycosyl transferase group 1  30.17 
 
 
374 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  26.04 
 
 
372 aa  80.1  0.00000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  32.73 
 
 
414 aa  80.1  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0742  glycosyl transferase, group 1  27.86 
 
 
386 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2339  glycosyl transferase, group 1  25.09 
 
 
373 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2066  glycosyl transferase group 1  23.18 
 
 
375 aa  80.1  0.00000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.033296  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  27.06 
 
 
370 aa  80.1  0.00000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0668  glycosyl transferase, group 1  28.57 
 
 
392 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  34.44 
 
 
364 aa  79.7  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  35.93 
 
 
392 aa  78.6  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3080  glycosyl transferase group 1  34.87 
 
 
372 aa  78.6  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  30.39 
 
 
393 aa  78.6  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3098  glycosyl transferase group 1  28.84 
 
 
391 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.1957  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  26.13 
 
 
382 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  26.85 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05202  glycosyltransferase  25.85 
 
 
350 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  38.76 
 
 
638 aa  77.8  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  38.24 
 
 
400 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 
386 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  36.63 
 
 
373 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2514  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  31.37 
 
 
411 aa  77.4  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  0.0718636 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1562  glycosyl transferase group 1  34.46 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.395728  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3070  glycosyl transferase group 1  37.93 
 
 
403 aa  76.6  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  35.57 
 
 
750 aa  76.6  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2520  glycosyl transferase, group 1  30.51 
 
 
401 aa  76.3  0.0000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.303259  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  31.85 
 
 
346 aa  76.3  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  30.41 
 
 
371 aa  76.3  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  25.67 
 
 
689 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2965  hypothetical protein  25.76 
 
 
342 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2815  hypothetical protein  24.7 
 
 
341 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  38.36 
 
 
389 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  31.15 
 
 
369 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  26.29 
 
 
407 aa  75.9  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.728152  normal  0.862724 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  32.37 
 
 
364 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3362  glycosyl transferase, group 1  35.81 
 
 
433 aa  75.5  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3935  glycosyl transferase group 1  23.28 
 
 
367 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000241521  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4049  glycosyl transferase group 1  32.4 
 
 
363 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1652  glycosyltransferase  21.62 
 
 
350 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  22.97 
 
 
366 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2209  glycosyl transferase group 1  36.53 
 
 
379 aa  75.1  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2027  glycosyl transferase, group 1  29.31 
 
 
360 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000425706  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  24.37 
 
 
387 aa  75.1  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  36.77 
 
 
425 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001321  capsular polysaccharide synthesis enzyme cpsF glycosyltransferase  26.64 
 
 
350 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0838  glycosyl transferase, group 1 family protein  30.99 
 
 
419 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2333  putative colanic acid biosynthesis glycosyltransferase WcaL  28.36 
 
 
406 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.68197 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5115  glycosyl transferase, group 1  31.44 
 
 
353 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.136361  hitchhiker  0.00694478 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3090  glycosyl transferase, group 1  29.17 
 
 
440 aa  74.3  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  24.78 
 
 
376 aa  74.3  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  27.08 
 
 
364 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.97 
 
 
366 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  22.97 
 
 
366 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.97 
 
 
366 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  22.97 
 
 
366 aa  74.3  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2495  glycosyl transferase group 1  31.98 
 
 
392 aa  73.9  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.402405  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  33.94 
 
 
391 aa  73.9  0.000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0691  glycosyl transferase, group 1  32.78 
 
 
377 aa  74.3  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0533386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>