25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2405 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2405  hypothetical protein  100 
 
 
722 aa  1447    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.55716  normal  0.421428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4930  Ricin B lectin  45.31 
 
 
801 aa  556  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.199916  normal  0.917817 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4114  hypothetical protein  28.48 
 
 
832 aa  212  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0478518  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7222  hypothetical protein  28.05 
 
 
839 aa  199  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2776  hypothetical protein  27.29 
 
 
838 aa  189  1e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149981  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2736  hypothetical protein  26.81 
 
 
627 aa  180  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00161414  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  26 
 
 
965 aa  174  3.9999999999999995e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0539  hypothetical protein  29.74 
 
 
648 aa  169  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.280042  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6626  parallel beta-helix repeat protein  27.62 
 
 
1011 aa  164  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0442384  normal  0.141702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6726  hypothetical protein  28.79 
 
 
580 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474731  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  25.12 
 
 
951 aa  158  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  24.26 
 
 
2286 aa  141  4.999999999999999e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5098  hypothetical protein  26.91 
 
 
788 aa  133  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.381891 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5089  Parallel beta-helix repeat protein  26.62 
 
 
791 aa  127  9e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.46946 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5426  hypothetical protein  27.71 
 
 
563 aa  114  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4874  Ricin B lectin  26.42 
 
 
1049 aa  93.2  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524665  normal  0.633916 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1130  PDZ/DHR/GLGF domain protein  22.03 
 
 
789 aa  85.9  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.453504  normal  0.447933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4475  hypothetical protein  28.72 
 
 
1121 aa  77  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.161774 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2668  hypothetical protein  21.13 
 
 
677 aa  76.6  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4027  parallel beta-helix repeat-containing protein  23.64 
 
 
644 aa  67.8  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.644383  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6426  hypothetical protein  25.48 
 
 
708 aa  67.4  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6231  hypothetical protein  23.83 
 
 
709 aa  63.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.126959 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2913  hypothetical protein  23.82 
 
 
752 aa  60.1  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.706776  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1237  hypothetical protein  38.37 
 
 
689 aa  50.8  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.157954 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2936  hypothetical protein  35.71 
 
 
1022 aa  49.7  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.897534 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>