56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2257 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2257  hypothetical protein  100 
 
 
138 aa  271  3e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338715  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3357  hypothetical protein  48.48 
 
 
145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.800437  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3902  hypothetical protein  48.8 
 
 
146 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0514  helix-turn-helix protein, CopG  44.03 
 
 
140 aa  113  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.139241  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3189  hypothetical protein  46.56 
 
 
173 aa  110  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3540  hypothetical protein  43.07 
 
 
149 aa  110  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1195  hypothetical protein  43.07 
 
 
149 aa  110  9e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.423858  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7439  hypothetical protein  49.19 
 
 
145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3850  helix-turn-helix protein, CopG  46.22 
 
 
142 aa  105  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00136711  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1732  hypothetical protein  45.11 
 
 
141 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2617  hypothetical protein  40.15 
 
 
150 aa  102  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0811  helix-turn-helix protein, CopG  41.41 
 
 
156 aa  101  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1022  hypothetical protein  44.7 
 
 
144 aa  100  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3194  hypothetical protein  45.74 
 
 
149 aa  99.8  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.14235  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0143  hypothetical protein  45.08 
 
 
136 aa  97.4  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.802001  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1680  helix-turn-helix protein, CopG  45.67 
 
 
149 aa  97.8  5e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.522229  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3690  hypothetical protein  38.81 
 
 
139 aa  96.7  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2877  hypothetical protein  40.58 
 
 
143 aa  95.5  2e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1494  CopG family protein  39.71 
 
 
144 aa  95.1  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00276069  normal  0.69135 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0700  hypothetical protein  42.75 
 
 
145 aa  95.1  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7740  hypothetical protein  42.14 
 
 
144 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.589979 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0319  hypothetical protein  50.91 
 
 
127 aa  94.4  4e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0127184  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4194  CopG/DNA-binding domain-containing protein  40.16 
 
 
150 aa  92.8  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0590  hypothetical protein  44 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1505  hypothetical protein  43.55 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.738458 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0439  CopG/DNA-binding domain-containing protein  42.19 
 
 
154 aa  90.9  6e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3085  hypothetical protein  43.2 
 
 
150 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.835522  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2700  CopG/DNA-binding domain-containing protein  41.41 
 
 
154 aa  90.1  9e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0802362  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3826  hypothetical protein  40.48 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2644  CopG domain protein DNA-binding domain protein  42.19 
 
 
154 aa  89.7  1e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.862924 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30950  hypothetical protein  38.58 
 
 
154 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000217049  unclonable  2.16388e-22 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0750  hypothetical protein  38.46 
 
 
144 aa  89  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.751711  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1340  CopG-like DNA-binding  40 
 
 
154 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.126057  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3707  CopG/DNA-binding domain-containing protein  42.75 
 
 
154 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1549  CopG-like DNA-binding  40 
 
 
154 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0162848  normal  0.655156 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1894  CopG domain protein DNA-binding domain protein  41.41 
 
 
154 aa  88.6  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2819  hypothetical protein  41.27 
 
 
143 aa  88.2  4e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0725  CopG/DNA-binding domain-containing protein  41.98 
 
 
158 aa  88.2  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.946674  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2326  CopG-like DNA-binding  35.88 
 
 
145 aa  87.4  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.17892  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3005  CopG/DNA-binding domain-containing protein  35 
 
 
145 aa  86.3  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.78909  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3507  CopG domain protein DNA-binding domain protein  39.84 
 
 
154 aa  86.3  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.709312  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2912  CopG/DNA-binding domain-containing protein  41.98 
 
 
148 aa  86.7  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2003  CopG/DNA-binding domain-containing protein  41.98 
 
 
158 aa  86.3  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.31572  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1281  CopG/DNA-binding domain-containing protein  37.01 
 
 
154 aa  85.9  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2349  CopG/DNA-binding domain-containing protein  41.98 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.61469 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4006  hypothetical protein  41.98 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.567441 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0967  hypothetical protein  42.06 
 
 
143 aa  84  6e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35730  hypothetical protein  36.22 
 
 
154 aa  83.2  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3547  CopG-like DNA-binding  39.02 
 
 
154 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.715677 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0687  hypothetical protein  33.07 
 
 
142 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2585  hypothetical protein  45.26 
 
 
158 aa  70.5  0.000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1834  CopG/DNA-binding domain-containing protein  38.52 
 
 
139 aa  70.5  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2026  CopG/DNA-binding domain-containing protein  38.52 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1066  putative regulator protein  31.01 
 
 
144 aa  65.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.638052  normal 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2345  hypothetical protein  31.19 
 
 
157 aa  63.2  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1496  hypothetical protein  35.35 
 
 
461 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.000950555  normal  0.877787 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>