More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2212 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  100 
 
 
347 aa  686  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  48.12 
 
 
366 aa  307  2e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  49.54 
 
 
346 aa  303  2e-81  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  43.16 
 
 
384 aa  239  4e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  42.25 
 
 
368 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  35.08 
 
 
337 aa  184  2e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  34.77 
 
 
350 aa  179  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  33.43 
 
 
351 aa  174  2e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  36.2 
 
 
350 aa  174  2e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  34.15 
 
 
351 aa  173  4e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  35.95 
 
 
332 aa  172  7e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 
350 aa  169  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  33.33 
 
 
350 aa  169  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  34.67 
 
 
346 aa  164  2e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  33.02 
 
 
347 aa  163  4e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  34.27 
 
 
346 aa  162  6e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  32.51 
 
 
354 aa  161  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  32.92 
 
 
371 aa  160  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  34.5 
 
 
350 aa  157  3e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  5.96347e-06  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  33.78 
 
 
338 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  1.59336e-12  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  31.75 
 
 
355 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.3583e-11 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  30.7 
 
 
352 aa  149  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  36.99 
 
 
335 aa  146  6e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  33.44 
 
 
350 aa  143  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  30.32 
 
 
330 aa  141  1e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  29.86 
 
 
334 aa  141  1e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  7.93674e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  30.75 
 
 
325 aa  141  2e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  29.86 
 
 
334 aa  141  2e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  31.27 
 
 
333 aa  140  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  29.57 
 
 
330 aa  139  5e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  29.62 
 
 
330 aa  139  9e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  31.55 
 
 
332 aa  138  1e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  34.38 
 
 
337 aa  138  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  29.47 
 
 
337 aa  137  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  31.85 
 
 
332 aa  137  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  33.98 
 
 
330 aa  136  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  32.51 
 
 
335 aa  136  6e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  30.03 
 
 
356 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  30.96 
 
 
362 aa  135  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  30.03 
 
 
356 aa  134  2e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  33.59 
 
 
330 aa  133  4e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  33.59 
 
 
345 aa  132  9e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  29.03 
 
 
336 aa  131  1e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  31.69 
 
 
335 aa  129  7e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  25 
 
 
351 aa  127  2e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  25 
 
 
351 aa  127  2e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  30.6 
 
 
331 aa  127  2e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  25 
 
 
351 aa  127  4e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  35.87 
 
 
256 aa  126  4e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  30.45 
 
 
335 aa  125  9e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  30.41 
 
 
352 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  24.11 
 
 
351 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  29.29 
 
 
355 aa  120  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  30.58 
 
 
341 aa  119  6e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  25.07 
 
 
346 aa  119  6e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 
335 aa  116  6e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  4.39413e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  29.05 
 
 
359 aa  115  1e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  32.06 
 
 
339 aa  113  6e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  29.43 
 
 
346 aa  112  1e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  29.43 
 
 
346 aa  112  1e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  29.22 
 
 
341 aa  109  6e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  30.51 
 
 
324 aa  109  7e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  31.83 
 
 
341 aa  109  7e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  28 
 
 
352 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  30.65 
 
 
357 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  26.44 
 
 
509 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  32.53 
 
 
351 aa  101  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  29.73 
 
 
395 aa  100  4e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  32.11 
 
 
531 aa  99.8  6e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  29.74 
 
 
393 aa  97.4  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1993  TrkA-N domain protein  29.15 
 
 
399 aa  97.1  4e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0873902 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  29.64 
 
 
364 aa  97.1  4e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  28.46 
 
 
386 aa  96.3  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  28.8 
 
 
364 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  28.8 
 
 
364 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  28.8 
 
 
364 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  27.57 
 
 
395 aa  94.4  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  28.44 
 
 
368 aa  94  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  27.6 
 
 
388 aa  91.7  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  29.33 
 
 
364 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  31.51 
 
 
350 aa  90.9  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  29.33 
 
 
364 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.809582 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4663  TrkA domain-containing protein  25.75 
 
 
359 aa  84.7  2e-15  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1460  TrkA domain-containing protein  28.84 
 
 
413 aa  82.8  9e-15  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0542  TrkA domain-containing protein  26.16 
 
 
326 aa  82  1e-14  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1025  putative potassium channel protein  26.16 
 
 
326 aa  82  1e-14  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1196  TrkA-N domain protein  29.17 
 
 
569 aa  82.4  1e-14  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1293  TrkA domain-containing protein  26.16 
 
 
326 aa  82  1e-14  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0270  putative potassium channel protein  26.16 
 
 
326 aa  82  1e-14  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.435171  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  28.07 
 
 
359 aa  82.4  1e-14  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1364  TrkA domain-containing protein  28.44 
 
 
369 aa  81.3  2e-14  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2540  TrkA domain-containing protein  28.44 
 
 
369 aa  81.3  2e-14  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13223  transmembrane cation transporter  25.65 
 
 
355 aa  81.6  2e-14  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1286  putative potassium channel protein  28.44 
 
 
369 aa  81.3  2e-14  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5245  potassium channel protein, C-terminus  31.28 
 
 
182 aa  81.6  2e-14  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.835427  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1346  TrkA domain-containing protein  24.33 
 
 
376 aa  81.3  2e-14  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.538374  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1590  TrkA-N domain protein  32.19 
 
 
252 aa  80.5  4e-14  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3603  TrkA-N domain protein  28.34 
 
 
335 aa  77.8  2e-13  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.497588 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2167  TrkA-N domain protein  31.69 
 
 
232 aa  77.8  2e-13  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2323  TrkA domain-containing protein  29.89 
 
 
549 aa  77.8  3e-13  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.551813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>