More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2111 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  100 
 
 
362 aa  700    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1027  peptidase M23B  42.54 
 
 
464 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3284  Peptidase M23  42.8 
 
 
665 aa  181  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0190084 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4275  peptidase M23B  41.04 
 
 
695 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0353482 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3798  peptidase M23B  42.13 
 
 
676 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.24711  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4245  peptidase M23B  37.31 
 
 
680 aa  176  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.442759 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0419  peptidase M23  46.19 
 
 
695 aa  176  5e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0620331 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4919  Peptidase M23  40.28 
 
 
676 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4092  peptidase M23B  40.57 
 
 
681 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2993  peptidase M23B  39.68 
 
 
645 aa  176  7e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5824  Peptidase M23  44.81 
 
 
681 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  35.82 
 
 
569 aa  175  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0567  peptidase M23B  38.25 
 
 
692 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2498  peptidase M23B  43 
 
 
646 aa  171  2e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.13296 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0660  peptidase M23B  37.85 
 
 
690 aa  171  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.375288  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3949  hypothetical protein  43.98 
 
 
648 aa  171  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3520  Peptidase M23  43.2 
 
 
640 aa  171  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.259567  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3812  Peptidase M23  42.79 
 
 
640 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1196  putative metalloendopeptidase  36.55 
 
 
687 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.336043  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1150  Peptidase M23  41.71 
 
 
697 aa  167  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.812424  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0770  peptidase M23B  35.32 
 
 
533 aa  167  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1023  peptidase M23B  41.71 
 
 
697 aa  168  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.490188 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0955  Peptidase M23  42.59 
 
 
699 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1861  M24/M37 family peptidase  43.69 
 
 
651 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.00185296  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1795  M24/M37 family peptidase  43.69 
 
 
651 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.00000763008  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1041  peptidase M23B  42.08 
 
 
651 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2390  peptidase M23  43.13 
 
 
674 aa  162  6e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0160214 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  36.68 
 
 
470 aa  161  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  38.7 
 
 
448 aa  160  2e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  38.61 
 
 
441 aa  159  7e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  43.61 
 
 
429 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  39.13 
 
 
523 aa  157  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  46.91 
 
 
440 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  46.91 
 
 
440 aa  156  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1227  peptidase M23B  46.39 
 
 
437 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0681  M24/M37 family peptidase  36.49 
 
 
577 aa  153  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  37.6 
 
 
490 aa  153  4e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0673  M24/M37 family peptidase  36.02 
 
 
577 aa  152  8e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.38498  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  34.55 
 
 
490 aa  152  8.999999999999999e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0256  M23 peptidase domain-containing protein  42.11 
 
 
646 aa  151  1e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0280  peptidase M23  37.73 
 
 
656 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.076484  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2607  peptidase M23B  38.54 
 
 
581 aa  150  4e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  35.4 
 
 
472 aa  149  5e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1220  peptidase, M23/M37 family  33.77 
 
 
385 aa  149  6e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000900007  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  40.76 
 
 
464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  36.47 
 
 
441 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  35.25 
 
 
471 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  38.57 
 
 
474 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  34.87 
 
 
471 aa  146  5e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  38.1 
 
 
475 aa  146  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  40 
 
 
479 aa  146  6e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  41.63 
 
 
421 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  40.49 
 
 
517 aa  145  8.000000000000001e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  41.25 
 
 
420 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  39.3 
 
 
464 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  41.25 
 
 
400 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  38.5 
 
 
417 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  37.25 
 
 
475 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  37.25 
 
 
473 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  37.25 
 
 
473 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  41.25 
 
 
421 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  37.25 
 
 
472 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3043  peptidase M23B  39.11 
 
 
621 aa  144  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.022206 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  37.25 
 
 
470 aa  143  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  37.81 
 
 
503 aa  142  7e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  36.76 
 
 
475 aa  142  7e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  40.47 
 
 
412 aa  141  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  36.8 
 
 
438 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1228  M24/M37 family peptidase  42.27 
 
 
386 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00112662  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1350  M24/M37 family peptidase  41.75 
 
 
386 aa  140  3e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  36.49 
 
 
468 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  35.25 
 
 
741 aa  140  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  36 
 
 
460 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  36.49 
 
 
447 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  36.84 
 
 
430 aa  139  6e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0696  M24/M37 family peptidase  36.09 
 
 
388 aa  139  6e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0489006  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  34.98 
 
 
460 aa  139  7e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  43.72 
 
 
425 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  43.72 
 
 
425 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  31.27 
 
 
477 aa  139  8.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  36.32 
 
 
490 aa  138  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  31.02 
 
 
477 aa  138  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4572  Peptidase M23  40.64 
 
 
615 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.476433  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  33.64 
 
 
480 aa  137  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0514  M24/M37 family peptidase  41.24 
 
 
386 aa  137  4e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000380878  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  36.25 
 
 
513 aa  135  8e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3541  peptidase M23B  34.5 
 
 
527 aa  135  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59745  normal  0.860043 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1905  peptidase M23B  33.33 
 
 
683 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0809274  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  37.39 
 
 
491 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0732  M24/M37 family peptidase  36.62 
 
 
353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.056304  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  32.61 
 
 
457 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  40.36 
 
 
503 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1331  M23 peptidase domain-containing protein  38.54 
 
 
389 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  42.67 
 
 
312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2738  peptidase M23B  35.9 
 
 
524 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1887  M24/M37 family peptidase  39.02 
 
 
472 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0768301  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2055  peptidase  39.02 
 
 
512 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.485622  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0370  peptidase M23B  37.31 
 
 
402 aa  133  6e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.890076  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  34.25 
 
 
457 aa  133  6e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1900  M24/M37 family peptidase  39.02 
 
 
471 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0520216  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>