More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2024 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 373 aa  765    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  89.87 
 
 		 375 aa  691    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  60.91 
 
 		 363 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  62.61 
 
 		 378 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  60.73 
 
 		 365 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  61.47 
 
 		 354 aa  426  1e-118  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  59.77 
 
 		 359 aa  421  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  58.33 
 
 		 380 aa  419  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  61.76 
 
 		 360 aa  419  1e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  60.39 
 
 		 381 aa  411  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  57.22 
 
 		 385 aa  405  1.0000000000000001e-112  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3636  DNA polymerase IV  56.78 
 
 		 396 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  57.18 
 
 		 359 aa  402  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2097  DNA-directed DNA polymerase  63.02 
 
 		 373 aa  401  1e-111  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  58.19 
 
 		 363 aa  398  9.999999999999999e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0756  DNA polymerase IV  60.95 
 
 		 376 aa  397  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  55.95 
 
 		 378 aa  366  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  52.79 
 
 		 360 aa  356  3.9999999999999996e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  51.15 
 
 		 371 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  52.2 
 
 		 372 aa  343  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  49.85 
 
 		 359 aa  331  1e-89  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  50.15 
 
 		 358 aa  323  4e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02810  DNA polymerase IV  51.03 
 
 		 368 aa  322  8e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.495536  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  45.94 
 
 		 359 aa  320  3e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0662  DNA-directed DNA polymerase  49.85 
 
 		 353 aa  317  1e-85  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  47.52 
 
 		 359 aa  316  5e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  50.73 
 
 		 369 aa  314  9.999999999999999e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  51.33 
 
 		 369 aa  314  1.9999999999999998e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  50.85 
 
 		 355 aa  313  2.9999999999999996e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  52.19 
 
 		 356 aa  311  7.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1442  DNA polymerase IV (Pol IV 3)  49 
 
 		 330 aa  311  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  48.85 
 
 		 371 aa  309  5e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  51.33 
 
 		 356 aa  305  1.0000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  48.7 
 
 		 378 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  48.7 
 
 		 378 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3537  DNA-directed DNA polymerase  47.03 
 
 		 357 aa  301  9e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3809  DNA-directed DNA polymerase  69.76 
 
 		 412 aa  293  3e-78  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  46.94 
 
 		 374 aa  290  3e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  43.75 
 
 		 364 aa  285  7e-76  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  45 
 
 		 399 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1566  DNA polymerase IV  51.68 
 
 		 369 aa  281  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0682981  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0614  DNA polymerase IV  46.11 
 
 		 355 aa  280  3e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0597  DNA polymerase IV  46.96 
 
 		 355 aa  280  3e-74  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1621  DNA polymerase IV  42.15 
 
 		 367 aa  278  8e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2507  DNA-directed DNA polymerase  44.29 
 
 		 358 aa  275  7e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2871  DNA polymerase IV  45.63 
 
 		 359 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0961  DNA polymerase IV  47.71 
 
 		 359 aa  273  3e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215034  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1185  DNA polymerase IV  46.03 
 
 		 358 aa  272  6e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000335845  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3422  DNA polymerase IV  46.59 
 
 		 360 aa  272  6e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1433  DNA polymerase IV  44.74 
 
 		 356 aa  272  9e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3092  DNA polymerase IV  51.17 
 
 		 358 aa  271  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3604  DNA polymerase IV  45.21 
 
 		 364 aa  271  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.85941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1859  DNA polymerase IV  45.15 
 
 		 392 aa  270  2e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2527  DNA polymerase IV  47.18 
 
 		 355 aa  270  4e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  44.74 
 
 		 481 aa  269  5e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1949  DNA polymerase IV  45.03 
 
 		 356 aa  268  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1983  DNA polymerase IV  45.03 
 
 		 356 aa  268  2e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1726  DNA polymerase IV  49.33 
 
 		 352 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000164893  normal  0.305741 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5448  DNA polymerase IV  48.66 
 
 		 379 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2619  DNA polymerase IV  45.15 
 
 		 403 aa  265  7e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1963  DNA polymerase IV  47.32 
 
 		 357 aa  265  8e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.148262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2179  DNA polymerase IV  45.2 
 
 		 405 aa  265  8e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288104  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2675  DNA polymerase IV  45.15 
 
 		 406 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1727  DNA polymerase IV  45.15 
 
 		 404 aa  265  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2236  DNA polymerase IV  45.15 
 
 		 400 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.783166  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1508  DNA polymerase IV  45.15 
 
 		 400 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.408147  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3083  DNA polymerase IV  45.15 
 
 		 400 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1587  DNA polymerase IV  47.65 
 
 		 362 aa  264  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0762  DNA polymerase IV  42.9 
 
 		 352 aa  264  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2751  DNA polymerase IV  45.15 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52310  DNA polymerase IV  47.23 
 
 		 349 aa  263  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.88026 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1635  DNA polymerase IV  47.32 
 
 		 357 aa  264  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.107243  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  44.44 
 
 		 418 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1232  DNA polymerase IV  49.01 
 
 		 354 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.46587  normal  0.838167 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0276  DNA polymerase IV  43.17 
 
 		 351 aa  262  8e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.820662 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4587  DNA polymerase IV  54.58 
 
 		 349 aa  262  8e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.099232  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5935  DNA polymerase IV  48.32 
 
 		 383 aa  262  8.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0630772  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00226  DNA polymerase IV  43.17 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3376  DNA-directed DNA polymerase  43.17 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4215  DNA polymerase IV  48.68 
 
 		 354 aa  261  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3349  DNA polymerase IV  43.17 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00229  hypothetical protein  43.17 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2160  DNA polymerase IV  48.32 
 
 		 408 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.916632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  44.54 
 
 		 418 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0260  DNA polymerase IV  43.17 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3291  DNA polymerase IV  43.97 
 
 		 352 aa  261  1e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  42.31 
 
 		 426 aa  261  1e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0265  DNA polymerase IV  43.17 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2142  DNA polymerase IV  48.32 
 
 		 361 aa  261  1e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  43.45 
 
 		 386 aa  261  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3438  DNA polymerase IV  43.97 
 
 		 352 aa  260  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0343  DNA polymerase IV  42.55 
 
 		 351 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.663031 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0352  DNA polymerase IV  42.55 
 
 		 351 aa  260  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.990512 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0285  DNA polymerase IV  43.17 
 
 		 351 aa  260  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1128  DNA polymerase IV  48.99 
 
 		 429 aa  259  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.456598  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0228  DNA polymerase IV  42.7 
 
 		 354 aa  259  4e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.190428  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1203  DNA polymerase IV  48.34 
 
 		 354 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  43.86 
 
 		 418 aa  259  5.0000000000000005e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0362  DNA polymerase IV  42.55 
 
 		 351 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.933253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0347  DNA polymerase IV  42.55 
 
 		 351 aa  259  5.0000000000000005e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>