More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1951 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1951  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 373 aa  747    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2362  ABC-2 type transporter  71.82 
 
 		 382 aa  548  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0759041  normal  0.863187 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1496  ABC-2 type transporter  71.54 
 
 		 382 aa  546  1e-154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.679397  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3447  ABC-2 type transporter  70.54 
 
 		 376 aa  538  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0565648  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2685  hypothetical protein  71.05 
 
 		 373 aa  534  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1505  ABC-2 type transporter  69.62 
 
 		 373 aa  528  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.366767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0166  hypothetical protein  70.54 
 
 		 374 aa  526  1e-148  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000154077 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3787  ABC transporter, ATP-binding protein  70.05 
 
 		 374 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2181  ABC-2 type transporter  69.71 
 
 		 374 aa  514  1.0000000000000001e-145  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64312  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3854  ABC transporter ATP-binding protein  69.79 
 
 		 374 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3957  ABC transporter ATP-binding protein  70.05 
 
 		 374 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0758  ABC-2 type transporter  70.81 
 
 		 376 aa  517  1.0000000000000001e-145  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1683  multidrug ABC transporter permease component  69.46 
 
 		 397 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0017586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3777  ABC transporter ATP-binding protein  70.05 
 
 		 374 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.439357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3897  ABC transporter ATP-binding protein  69.79 
 
 		 374 aa  514  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3837  ABC transporter, ATP-binding protein  68.83 
 
 		 374 aa  509  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03335  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  68.83 
 
 		 374 aa  509  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0229  ABC-2 type transporter  68.83 
 
 		 374 aa  509  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3684  ABC transporter, ATP-binding protein  68.83 
 
 		 374 aa  508  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4830  ABC transporter, ATP-binding protein  68.83 
 
 		 374 aa  509  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3774  ABC transporter, ATP-binding protein  69.11 
 
 		 374 aa  510  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3967  ABC transporter, ATP-binding protein  69.11 
 
 		 374 aa  510  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03287  hypothetical protein  68.83 
 
 		 374 aa  509  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0230  ABC-2 type transporter  68.83 
 
 		 374 aa  508  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3418  ABC-2 type transporter  68.82 
 
 		 373 aa  508  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16770  ABC-2 type transporter, permease component  66.76 
 
 		 372 aa  507  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00841824  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0626  ABC-2 type transporter  70.78 
 
 		 373 aa  505  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69060  putative permease of ABC transporter  68.11 
 
 		 374 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5973  ABC transporter permease  68.65 
 
 		 374 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1349  ABC transporter, permease protein, putative  67.21 
 
 		 370 aa  492  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4914  ABC-2 type transporter  66.12 
 
 		 370 aa  492  9.999999999999999e-139  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1307  putative ABC transporter, permease protein  66.67 
 
 		 370 aa  488  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0171  hypothetical protein  68.11 
 
 		 375 aa  489  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1825  ABC-2 type transporter  67.21 
 
 		 370 aa  489  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0526143  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0138  ABC transporter, permease  66.13 
 
 		 374 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2777  ABC-type multidrug transport system, permease component  65.86 
 
 		 374 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2634  ABC transporter, permease protein  65.86 
 
 		 374 aa  482  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0164  ABC transporter, permease protein  66.13 
 
 		 374 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0920361  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0169  hypothetical protein  65.4 
 
 		 371 aa  482  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1308  ABC transporter, permease protein  66.13 
 
 		 374 aa  482  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2341  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  66.94 
 
 		 374 aa  481  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1040  ABC transporter, permease  65.59 
 
 		 374 aa  479  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0437  ABC transporter, permease  65.59 
 
 		 374 aa  480  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3576  hypothetical protein  62.4 
 
 		 370 aa  476  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6205  ABC-2 type transporter  67.3 
 
 		 374 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.261883 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5884  ABC-2 type transporter  69.48 
 
 		 374 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0315  ABC-2 type transporter  68.29 
 
 		 374 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1431  hypothetical protein  63.78 
 
 		 371 aa  459  9.999999999999999e-129  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4687  ABC-2 type transporter  63.76 
 
 		 370 aa  457  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.696171  normal  0.325536 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0988  hypothetical protein  62.33 
 
 		 374 aa  457  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3659  putative ABC transporter (permease protein)  61.75 
 
 		 370 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00759514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1150  ABC-2 type transporter  63.04 
 
 		 412 aa  446  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.13202  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4663  hypothetical protein  63.49 
 
 		 370 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00132  putative ABC transport protein  58.18 
 
 		 373 aa  434  1e-121  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0811  ABC-2 type transporter  55.34 
 
 		 375 aa  408  1e-113  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0019  ABC-2 type transporter  57.14 
 
 		 373 aa  399  9.999999999999999e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0537  ABC-2 type transporter  54.5 
 
 		 398 aa  397  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0501  ABC-2 type transporter  54.5 
 
 		 399 aa  398  1e-109  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0566  ABC-2 type transporter  54.5 
 
 		 399 aa  398  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222842  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5208  ABC transporter  51.62 
 
 		 370 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5269  ABC-2 type transporter  51.62 
 
 		 370 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5116  ABC-2 type transporter  51.89 
 
 		 370 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.75858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7848  putative ABC transporter (permease protein)  54.82 
 
 		 376 aa  394  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00792305  normal  0.174905 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1562  ABC-2 type transporter  52.04 
 
 		 374 aa  382  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.986622  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2949  ABC-2 type transporter  54.19 
 
 		 382 aa  383  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3789  ABC-2 type transporter  53.12 
 
 		 390 aa  378  1e-104  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5443  hypothetical protein  52.32 
 
 		 372 aa  379  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889571 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0209  ABC-2 type transporter  52.21 
 
 		 393 aa  375  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4844  ABC-2 type transporter  49.86 
 
 		 375 aa  372  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0699099 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0750  ABC-2 type transporter  50.82 
 
 		 375 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1613  ABC-2 type transporter  50.27 
 
 		 374 aa  371  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0557  hypothetical protein  52.72 
 
 		 379 aa  365  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0080  ABC-2 type transporter  53.39 
 
 		 379 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0879828  normal  0.577589 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1742  ABC-2 type transporter  48.91 
 
 		 401 aa  359  4e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00338931 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9218  ABC transporter  46.05 
 
 		 374 aa  352  5e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.797463  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5749  ABC-2 type transporter  47.93 
 
 		 375 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.166668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3879  ABC transporter  48.99 
 
 		 350 aa  335  7e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3157  ABC transporter, inner membrane subunit  45.08 
 
 		 374 aa  306  3e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00527406  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3895  ABC-2 type transporter  44.81 
 
 		 374 aa  306  5.0000000000000004e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.505485  normal  0.0804287 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3215  hypothetical protein  42.62 
 
 		 374 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1136  hypothetical protein  31.12 
 
 		 381 aa  209  5e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  31.54 
 
 		 377 aa  162  1e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  29.92 
 
 		 376 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  28.94 
 
 		 377 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  29.62 
 
 		 376 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  29.89 
 
 		 368 aa  139  8.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  29.92 
 
 		 378 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  26.88 
 
 		 379 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  30.99 
 
 		 370 aa  137  2e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  27.1 
 
 		 375 aa  138  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  29.07 
 
 		 379 aa  137  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  30.92 
 
 		 370 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  29.31 
 
 		 380 aa  137  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  30.03 
 
 		 376 aa  137  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  27.84 
 
 		 372 aa  137  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  32.24 
 
 		 376 aa  135  9e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  29.19 
 
 		 376 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  28.8 
 
 		 376 aa  133  5e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  26.93 
 
 		 376 aa  133  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  27.72 
 
 		 376 aa  132  9e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>