More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1950 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_0170  response regulator receiver domain-containing protein  65.19 
 
 
930 aa  1173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696598  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  67.76 
 
 
916 aa  1189  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  67.46 
 
 
912 aa  1185  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3778  ABC transporter permease and ATP-binding protein  67.62 
 
 
913 aa  1231  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0174984  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3898  ABC transporter permease and ATP-binding protein  67.29 
 
 
913 aa  1227  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  59.91 
 
 
909 aa  1037  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  63.16 
 
 
936 aa  1154  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1309  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  71.73 
 
 
1071 aa  709  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  55.09 
 
 
901 aa  902  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3855  ABC transporter permease and ATP-binding protein  67.62 
 
 
913 aa  1231  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2776  response regulator receiver domain-containing protein  71.93 
 
 
1089 aa  710  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.591057  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2633  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  71.02 
 
 
1066 aa  709  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3788  ABC transporter, ATP binding protein  67.51 
 
 
913 aa  1230  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1561  ABC transporter related  54.1 
 
 
918 aa  1007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1612  ABC transporter related  53.06 
 
 
935 aa  975  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  68.23 
 
 
930 aa  1215  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4664  ABC transporter related  65.86 
 
 
927 aa  1198  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  66.23 
 
 
921 aa  1174  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0500  ABC transporter related  57.74 
 
 
912 aa  995  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2340  ABC multidrug efflux pump, fused duplicated ATPase and inner membrane subunits  64.89 
 
 
927 aa  1149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0626468  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  55.62 
 
 
912 aa  973  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  58.42 
 
 
943 aa  1067  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1432  ABC transporter related  62.2 
 
 
908 aa  1109  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  60.36 
 
 
994 aa  1115  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1684  response regulator receiver domain-containing protein  65.68 
 
 
919 aa  1181  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00676218  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4831  ABC transporter, ATP binding protein  67.29 
 
 
911 aa  1218  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0165  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  71.73 
 
 
1079 aa  709  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243814  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  58.64 
 
 
904 aa  1010  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  68.92 
 
 
929 aa  1238  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4845  ABC transporter related  53.99 
 
 
928 aa  927  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771087  normal  0.268191 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  68.07 
 
 
933 aa  1260  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  68.05 
 
 
914 aa  1244  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  56.47 
 
 
916 aa  1007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0229  ABC transporter related  67.29 
 
 
911 aa  1221  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3685  ABC transporter, ATP binding protein  67.29 
 
 
911 aa  1221  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3968  ABC transporter, ATP binding protein  67.29 
 
 
911 aa  1222  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  100 
 
 
921 aa  1851  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  52.27 
 
 
906 aa  930  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  57.62 
 
 
912 aa  1018  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  65.43 
 
 
918 aa  1165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3775  ABC transporter, ATP binding protein  67.29 
 
 
911 aa  1222  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0081  ABC transporter related  57.48 
 
 
911 aa  998  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6206  ABC transporter related  63.31 
 
 
936 aa  1104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.84654  normal  0.203674 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  56.14 
 
 
901 aa  923  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  67.83 
 
 
901 aa  1200  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0536  ABC transporter related  58.76 
 
 
912 aa  1026  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.94583  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3836  ABC transporter, ATP binding protein  67.14 
 
 
911 aa  1220  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.932304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  67.86 
 
 
924 aa  1234  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7849  ABC transporter permease ATP-binding protein  57.14 
 
 
915 aa  1033  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0180786  normal  0.28937 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  55.89 
 
 
917 aa  1008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  52.38 
 
 
906 aa  926  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  56.99 
 
 
932 aa  1038  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  67.76 
 
 
916 aa  1213  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1824  ABC transporter related  63.77 
 
 
926 aa  1198  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5883  ABC transporter related  62.85 
 
 
942 aa  1081  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.49 
 
 
913 aa  955  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  55.03 
 
 
901 aa  902  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0438  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  71.29 
 
 
1017 aa  721  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  63.37 
 
 
936 aa  1154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1039  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  71.68 
 
 
1082 aa  708  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  64.65 
 
 
911 aa  1143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  52.49 
 
 
906 aa  929  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  59.84 
 
 
907 aa  1018  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0139  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  71.73 
 
 
1071 aa  709  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  65.02 
 
 
922 aa  1206  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  66.41 
 
 
922 aa  1190  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0170  ABC-2 type transport system  65.8 
 
 
925 aa  1211  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.476544  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3880  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  54.36 
 
 
914 aa  949  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.859575  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  62.2 
 
 
920 aa  1127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03288  hypothetical protein  67.4 
 
 
911 aa  1223  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5750  ABC transporter related  50.64 
 
 
942 aa  870  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.295356  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2180  ABC transporter related  65.97 
 
 
927 aa  1201  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03336  fused ribosome-associated ATPase: ATP-binding protein/ATP-binding protein/predicted membrane protein  67.4 
 
 
911 aa  1223  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0228  ABC transporter related protein  67.4 
 
 
911 aa  1223  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  69.45 
 
 
930 aa  1249  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  52.77 
 
 
906 aa  909  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1740  ABC transporter related  39.97 
 
 
593 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.733872  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1795  ABC transporter related  40.72 
 
 
578 aa  371  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3706  ABC transporter related  39.72 
 
 
594 aa  367  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4062  ABC transporter related protein  38.89 
 
 
583 aa  367  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3106  ABC transporter related  40.73 
 
 
510 aa  365  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1479  ABC transporter related protein  38.97 
 
 
589 aa  361  3e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2905  ABC transporter related  40.92 
 
 
512 aa  360  6e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.725658  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0350  ABC transporter, ATP-binding protein  35.58 
 
 
541 aa  356  9e-97  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1328  ABC transporter-related protein  37.52 
 
 
576 aa  355  2e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  39.35 
 
 
581 aa  345  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  37.5 
 
 
588 aa  344  4e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  39.76 
 
 
585 aa  343  6e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2369  ABC transporter related  39.31 
 
 
575 aa  341  3e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.296305  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1285  ABC transporter related  36.48 
 
 
579 aa  336  9e-91  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1381  ABC transporter related  37.61 
 
 
587 aa  334  4e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  3.41514e-05 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8103  ABC transporter related  37.35 
 
 
578 aa  327  5e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1520  ABC transporter related  37.21 
 
 
580 aa  326  1e-87  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.226797  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2943  ABC transporter related protein  37.21 
 
 
585 aa  323  1e-86  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.773013  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1792  ABC transporter component  38.68 
 
 
580 aa  320  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.380874  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1134  ABC transporter related  35.58 
 
 
651 aa  318  2e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  32.11 
 
 
1106 aa  312  2e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2708  ABC transporter related  31.15 
 
 
691 aa  290  6e-77  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.163982  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0260  ABC transporter, ATP-binding protein  34.25 
 
 
551 aa  288  4e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1304  ABC transporter related  34.97 
 
 
590 aa  284  5e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>