More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1911 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1911  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 817 aa  1670    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1908  TonB-dependent receptor plug  31.17 
 
 		 755 aa  303  1e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0730  TonB-dependent receptor  32.02 
 
 		 761 aa  288  2.9999999999999996e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.455478  normal  0.0840976 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1136  TonB-dependent receptor  32.03 
 
 		 765 aa  284  6.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.438205  hitchhiker  0.000214411 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 704 aa  283  1e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3080  TonB-dependent receptor  31.77 
 
 		 710 aa  281  5e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2301  TonB-dependent receptor  30.89 
 
 		 730 aa  269  1e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00156441  decreased coverage  0.0000705013 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1776  TonB-dependent receptor  29.28 
 
 		 734 aa  268  2e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00365566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0989  TonB-dependent receptor  29.85 
 
 		 780 aa  266  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.220833 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2041  TonB-dependent receptor  28.44 
 
 		 784 aa  266  2e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.573834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3771  TonB-dependent receptor  28.2 
 
 		 794 aa  265  3e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000982846  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4257  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 		 755 aa  264  4e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.737167 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0330  TonB-dependent receptor  28.47 
 
 		 777 aa  261  3e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5045  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 726 aa  258  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0895856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3147  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 775 aa  258  3e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.774521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0277  TonB-dependent receptor  28.96 
 
 		 775 aa  258  4e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.644124  normal  0.280389 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3084  TonB-dependent receptor  29.31 
 
 		 730 aa  256  8e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0886  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 806 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.0016588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0478  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 720 aa  254  3e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.742191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0673  TonB-dependent receptor  30.7 
 
 		 761 aa  254  5.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3314  TonB-dependent receptor  30.58 
 
 		 804 aa  254  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.0000257561  unclonable  0.000000438861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0999  TonB-dependent receptor  27.54 
 
 		 722 aa  253  7e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.285089  normal  0.123899 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0725  TonB-dependent receptor  29.15 
 
 		 790 aa  253  9.000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0453465 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1436  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 		 749 aa  251  4e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000358025  decreased coverage  0.0000102915 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3336  TonB-dependent receptor  29.3 
 
 		 741 aa  251  5e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0286811 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2045  TonB-dependent receptor  30.43 
 
 		 787 aa  250  9e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.785428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4282  TonB-dependent receptor, plug  28.08 
 
 		 739 aa  249  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.030658  normal  0.745652 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3904  TonB-dependent receptor  27.15 
 
 		 762 aa  248  2e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.5243  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1868  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 867 aa  246  9e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.215038  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0230  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 729 aa  243  1e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0302  TonB-dependent receptor  29.49 
 
 		 795 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.122608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3713  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 854 aa  241  5e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  unclonable  0.00000001326  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1910  TonB-dependent receptor  29.97 
 
 		 736 aa  240  8e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0812  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 780 aa  240  9e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.724428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3263  TonB-dependent receptor  28.71 
 
 		 860 aa  239  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.327376  hitchhiker  0.00174671 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1708  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 808 aa  238  3e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.164622  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0213  TonB-dependent receptor plug  28.09 
 
 		 776 aa  237  6e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121403 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3653  TonB-dependent receptor  30.11 
 
 		 771 aa  236  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3027  TonB-dependent receptor  28.1 
 
 		 851 aa  235  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1542  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 779 aa  234  3e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3067  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 		 903 aa  235  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0377  TonB-dependent receptor  25.64 
 
 		 783 aa  234  7.000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1063  TonB-dependent receptor  29.22 
 
 		 780 aa  233  8.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0659178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0709  TonB-dependent receptor  27.48 
 
 		 790 aa  233  9e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.072981  hitchhiker  0.00423974 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0226  TonB-dependent receptor  30.7 
 
 		 745 aa  232  2e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.385209  normal  0.613725 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2075  TonB-dependent receptor, plug  29.91 
 
 		 759 aa  232  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0706  TonB-dependent receptor  27.2 
 
 		 792 aa  231  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00993483 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0521  TonB-dependent receptor  28.89 
 
 		 758 aa  230  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.466347  normal  0.153456 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3171  TonB-dependent receptor  28.18 
 
 		 759 aa  228  2e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0174506  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1489  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 859 aa  228  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3312  TonB-dependent receptor  28.66 
 
 		 784 aa  228  3e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  hitchhiker  0.0000067501 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2677  TonB-dependent receptor plug  29.45 
 
 		 759 aa  228  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3458  TonB-dependent receptor  27.76 
 
 		 758 aa  228  3e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.485472  normal  0.120897 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0964  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 803 aa  227  8e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.110635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0665  TonB-dependent receptor  27.87 
 
 		 758 aa  226  1e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.252208 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3744  TonB-dependent receptor  28.69 
 
 		 753 aa  224  4e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1600  receptor precursor-mostly Fe transport  27.54 
 
 		 715 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.147311  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3282  TonB-dependent receptor  28.09 
 
 		 758 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.166859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1747  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 771 aa  221  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2756  TonB-dependent receptor, plug  28.05 
 
 		 741 aa  221  6e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000284329  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0765  TonB-dependent receptor  29.9 
 
 		 779 aa  220  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.305  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0936  TonB-dependent receptor  28.25 
 
 		 750 aa  219  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2300  TonB-dependent receptor  25.93 
 
 		 730 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000740519  hitchhiker  0.000350666 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3348  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 747 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2882  TonB-dependent receptor  28.13 
 
 		 786 aa  217  5e-55  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3453  TonB-dependent receptor  27.8 
 
 		 856 aa  215  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0426513  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4826  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  28.48 
 
 		 755 aa  214  7e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1980  TonB-dependent receptor  26.89 
 
 		 774 aa  214  7e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.228726  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3857  TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 743 aa  213  1e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3256  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 730 aa  212  3e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000366625  decreased coverage  0.0000730384 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1862  TonB-dependent receptor plug  27.49 
 
 		 799 aa  211  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02410  putative TonB-dependent receptor  27.29 
 
 		 790 aa  211  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.363923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0250  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 763 aa  210  7e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2088  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 764 aa  209  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.976356  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0250  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 741 aa  209  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2803  TonB-dependent receptor  26.57 
 
 		 796 aa  209  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00000028196  n/a   
 
 
 
NC_009656  PSPA7_0271  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 790 aa  208  3e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1547  TonB-dependent receptor  26.33 
 
 		 794 aa  208  4e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0831797 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4894  TonB-dependent receptor  25.8 
 
 		 808 aa  207  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0512869  normal  0.075257 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0474  TonB-dependent receptor  27.26 
 
 		 873 aa  207  7e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3473  TonB-dependent receptor  28.12 
 
 		 786 aa  206  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08150  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 803 aa  205  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02261  putative TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 792 aa  204  4e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.895044  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1901  TonB-dependent receptor  28.11 
 
 		 744 aa  204  7e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4274  TonB-dependent receptor  29.08 
 
 		 758 aa  203  9e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.021682  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3406  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 722 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0595288 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2663  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 728 aa  203  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0150828  normal  0.481934 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1474  TonB-dependent receptor  29.06 
 
 		 817 aa  202  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.698611  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3530  TonB-dependent receptor  27 
 
 		 785 aa  202  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  26.46 
 
 		 731 aa  202  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4348  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 755 aa  202  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4125  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 751 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000875615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4039  TonB-dependent receptor  26.71 
 
 		 758 aa  201  5e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0501183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1656  TonB-dependent receptor  27.33 
 
 		 764 aa  201  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  unclonable  0.0000000000345148  decreased coverage  0.00188078 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3725  TonB-dependent receptor, plug  27.73 
 
 		 763 aa  200  9e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1631  TonB-dependent receptor  27.49 
 
 		 766 aa  200  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.888347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2600  TonB-dependent receptor  27.92 
 
 		 773 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4618  TonB-dependent receptor, plug  28.64 
 
 		 733 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0845524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3871  TonB-dependent receptor  27.45 
 
 		 832 aa  199  2.0000000000000003e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.234106  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0818  TonB-dependent receptor  26.68 
 
 		 789 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>