161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1888 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1888  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  406  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1732  TetR family transcriptional regulator  49.43 
 
 		 206 aa  89.7  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4548  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 247 aa  72  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00225011  normal  0.280375 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2259  TetR family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 221 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.289727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0388  TetR family transcriptional regulator  35.88 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.190078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3483  TetR family transcriptional regulator  35.76 
 
 		 218 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0521  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.769368  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1768  regulatory protein, TetR  35.78 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3897  regulatory protein, TetR  30.77 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0396363  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2468  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 255 aa  62  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  35.76 
 
 		 220 aa  62  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3211  regulatory protein, TetR  35.06 
 
 		 221 aa  61.6  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.878438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3769  TetR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.396044  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  34.42 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3842  TetR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3781  TetR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3285  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.672369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5753  hypothetical protein  40.85 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.391996 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2597  transcriptional regulator, TetR family  34.11 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.127933  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4236  TetR family transcriptional regulator  28.37 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.502121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5106  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5743  regulatory protein TetR  35.4 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.405607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4057  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 227 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0267673  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2416  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00485209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2515  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00143422  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7072  putative transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 240 aa  55.1  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 229 aa  55.1  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1506  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 227 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212096  hitchhiker  0.000526239 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2891  transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22730  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3894  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 223 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0466911 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3323  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 227 aa  52.4  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.481358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3446  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 335 aa  52  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.843948  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2515  regulatory protein, TetR  29.13 
 
 		 288 aa  52  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.977555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 223 aa  51.6  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1699  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 290 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0964215  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0223  regulatory protein TetR  34.65 
 
 		 234 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.029073 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 98 aa  50.4  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 317 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1511  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 273 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.752097  hitchhiker  0.00148325 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1055  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 273 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1535  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 273 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  33.64 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  33.64 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 272 aa  50.4  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3522  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 222 aa  50.1  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.239967  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 211 aa  49.7  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 222 aa  48.9  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1457  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 276 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.166824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4675  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 273 aa  48.9  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.104564 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1417  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 272 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.702279  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1862  TetR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2543  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214617 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2339  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.519522  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5299  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 227 aa  47.4  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 318 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 316 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01897  transcriptional regulator, TetR family protein  26.89 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111118  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 318 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 318 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 316 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 316 aa  47.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 318 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2116  regulatory protein, TetR  30.39 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000093152  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1888  transcriptional regulator, TetR family protein  33.33 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3952  TetR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 291 aa  46.2  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2258  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.968255  hitchhiker  0.0010637 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5390  transcriptional regulator, TetR family  48.89 
 
 		 291 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.787919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2245  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2126  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2171  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.068169  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0418  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 352 aa  45.4  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340149  hitchhiker  0.000146207 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  48.89 
 
 		 289 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1816  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 228 aa  45.4  0.0005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0241637  normal  0.594701 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4531  hypothetical protein  31.34 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0433  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 354 aa  45.8  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.425009  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 220 aa  45.4  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4188  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 211 aa  45.1  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2052  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 212 aa  45.1  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00634978  normal  0.379689 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 211 aa  45.1  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 206 aa  45.1  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 215 aa  43.9  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 287 aa  44.3  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2050  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00274298  normal  0.196014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1925  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00396712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 224 aa  44.3  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2155  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 212 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.116273  normal  0.663988 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1938  TetR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3294  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 255 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5228  TetR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 290 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>