113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1857 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1857  outer membrane autotransporter  100 
 
 
2848 aa  5239    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150379  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.91 
 
 
774 aa  212  7e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  28.57 
 
 
939 aa  187  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  29.26 
 
 
972 aa  161  1e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  28.4 
 
 
1012 aa  121  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  25.39 
 
 
1369 aa  113  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  27.85 
 
 
3822 aa  112  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  27.85 
 
 
4238 aa  112  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  27.67 
 
 
4238 aa  111  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  27.31 
 
 
3954 aa  103  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1095  outer membrane autotransporter  25.54 
 
 
10429 aa  99.8  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  24.34 
 
 
3506 aa  95.1  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  26.92 
 
 
2346 aa  92.8  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  26.92 
 
 
2365 aa  92  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  26.56 
 
 
2396 aa  90.5  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  26.7 
 
 
2371 aa  88.6  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1209  outer membrane autotransporter, putative  33.28 
 
 
3484 aa  89.4  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  26.75 
 
 
2366 aa  89  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  27.16 
 
 
1508 aa  87.4  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  30.16 
 
 
1769 aa  85.9  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  22.28 
 
 
1881 aa  84.7  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.86 
 
 
1489 aa  81.3  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  27.46 
 
 
1066 aa  79  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1775  outer membrane autotransporter  25.22 
 
 
831 aa  79  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00532654 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  26.82 
 
 
1179 aa  77.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4997  Outer membrane autotransporter barrel  26.06 
 
 
998 aa  75.9  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1194  autotransporter domain-containing protein  24.88 
 
 
1068 aa  74.7  0.00000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.170523 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  25.15 
 
 
763 aa  73.2  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2238  putative Outer membrane autotransporter protein  27.52 
 
 
1025 aa  73.2  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.669565  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  27.14 
 
 
995 aa  71.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  26.69 
 
 
985 aa  70.9  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  26.79 
 
 
1156 aa  70.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  26.77 
 
 
994 aa  70.5  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1208  outer membrane autotransporter TapA  37.17 
 
 
991 aa  69.7  0.0000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  25.7 
 
 
1458 aa  68.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  28.64 
 
 
1119 aa  68.6  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1155  autotransporter domain-containing protein  23.25 
 
 
1677 aa  68.6  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  26.53 
 
 
1004 aa  67.8  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3802  outer membrane autotransporter  28.24 
 
 
2083 aa  67.4  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  25.76 
 
 
759 aa  67  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.553237 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  25.62 
 
 
1459 aa  66.6  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.81 
 
 
1134 aa  66.2  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  27.08 
 
 
1154 aa  65.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.25 
 
 
1227 aa  65.1  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  24.6 
 
 
990 aa  64.7  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.48 
 
 
1322 aa  65.1  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  24.58 
 
 
1222 aa  64.7  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  31.37 
 
 
1001 aa  64.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1981  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.06 
 
 
1242 aa  64.7  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1833  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.76 
 
 
1048 aa  63.5  0.00000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  26.38 
 
 
1033 aa  63.2  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  32.03 
 
 
1001 aa  63.2  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  29.41 
 
 
983 aa  62.4  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.9 
 
 
1029 aa  62.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  24.9 
 
 
1550 aa  62.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1511  outer membrane autotransporter  23.59 
 
 
1886 aa  62  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.188015  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  24.74 
 
 
986 aa  61.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  36.2 
 
 
1129 aa  59.7  0.0000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  36.2 
 
 
1129 aa  59.7  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  36.2 
 
 
1131 aa  59.7  0.0000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  36.2 
 
 
1131 aa  59.7  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  36.2 
 
 
1131 aa  59.7  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  36.2 
 
 
1131 aa  59.7  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  36.2 
 
 
1131 aa  59.7  0.0000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  29.28 
 
 
1130 aa  58.2  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  25.47 
 
 
1177 aa  58.2  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  23.42 
 
 
882 aa  57.4  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  23.09 
 
 
650 aa  57  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1109  autotransporter beta-domain-containing protein  25.18 
 
 
1071 aa  57  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  22.93 
 
 
1078 aa  57  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3958  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  23.31 
 
 
907 aa  56.6  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  26.79 
 
 
1130 aa  56.2  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  26.7 
 
 
1055 aa  55.5  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1533  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.99 
 
 
1251 aa  55.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  24.21 
 
 
2711 aa  55.8  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.65 
 
 
919 aa  55.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  24.04 
 
 
3322 aa  55.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3913  outer membrane autotransporter  27.2 
 
 
1091 aa  54.7  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.61 
 
 
1285 aa  55.1  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.43 
 
 
1848 aa  54.3  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  27.23 
 
 
1038 aa  53.5  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  28.1 
 
 
1028 aa  52.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  26.23 
 
 
816 aa  52.4  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.56 
 
 
1081 aa  52.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  24.43 
 
 
980 aa  51.6  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.23 
 
 
1673 aa  51.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  21.78 
 
 
2407 aa  51.2  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  23.03 
 
 
1011 aa  50.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  26.32 
 
 
2003 aa  50.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  23.43 
 
 
1016 aa  50.1  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  24.86 
 
 
1180 aa  50.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1154  autotransporter beta-domain-containing protein  31.89 
 
 
965 aa  50.1  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00168321  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.06 
 
 
3629 aa  49.7  0.0007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0402  outer membrane autotransporter  30.77 
 
 
714 aa  49.3  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  21.81 
 
 
987 aa  48.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  29.58 
 
 
991 aa  48.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4377  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.18 
 
 
641 aa  48.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0427  putative autotransporter/pertactin  29.67 
 
 
1003 aa  48.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.326572  normal  0.353879 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.97 
 
 
972 aa  48.1  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  27.97 
 
 
995 aa  47.8  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.169589 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>