More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1819 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  100 
 
 
662 aa  1297    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  45.48 
 
 
653 aa  434  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  45.3 
 
 
639 aa  430  1e-119  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  44.53 
 
 
657 aa  430  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  40.23 
 
 
656 aa  412  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  37.28 
 
 
656 aa  402  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  36.27 
 
 
665 aa  392  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  38.75 
 
 
634 aa  345  1e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  35.78 
 
 
697 aa  329  8e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  35.04 
 
 
787 aa  283  6.000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  35.56 
 
 
697 aa  280  8e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  45.4 
 
 
743 aa  268  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  41.08 
 
 
744 aa  265  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  41.23 
 
 
725 aa  246  9.999999999999999e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  35.84 
 
 
680 aa  240  5e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  42.66 
 
 
619 aa  234  5e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  40.16 
 
 
749 aa  234  5e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  39.76 
 
 
1085 aa  232  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  41.39 
 
 
689 aa  229  9e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  48.38 
 
 
698 aa  224  6e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  44.32 
 
 
652 aa  215  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  45.45 
 
 
450 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  45.04 
 
 
450 aa  211  3e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  47.29 
 
 
671 aa  208  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  41.74 
 
 
682 aa  205  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  39.58 
 
 
1193 aa  204  4e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  43.64 
 
 
646 aa  204  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  41.57 
 
 
442 aa  202  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  43.73 
 
 
687 aa  199  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  46.06 
 
 
444 aa  196  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  47.73 
 
 
441 aa  194  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  37.86 
 
 
434 aa  193  8e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  44.01 
 
 
445 aa  191  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  39.47 
 
 
432 aa  191  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  44.23 
 
 
622 aa  189  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  40.65 
 
 
450 aa  184  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  45.45 
 
 
450 aa  184  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  44.44 
 
 
459 aa  184  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  36.82 
 
 
466 aa  183  8.000000000000001e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  44.34 
 
 
478 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  46.09 
 
 
448 aa  179  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  48.39 
 
 
448 aa  177  5e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  37.18 
 
 
678 aa  173  7.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  45.13 
 
 
725 aa  170  6e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  39.65 
 
 
478 aa  170  9e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  37.02 
 
 
577 aa  160  8e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  34.93 
 
 
578 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  34.93 
 
 
569 aa  147  8.000000000000001e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  31.6 
 
 
299 aa  137  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  32.02 
 
 
570 aa  136  9.999999999999999e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  31.74 
 
 
570 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  31.74 
 
 
570 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  35.02 
 
 
580 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  31.72 
 
 
570 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3668  AAA ATPase central domain protein  47.2 
 
 
134 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  35.89 
 
 
617 aa  127  8.000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  37.7 
 
 
305 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  34.39 
 
 
352 aa  120  6e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  36.42 
 
 
443 aa  110  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2275  AAA ATPase, central region  37.97 
 
 
771 aa  106  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0746104  hitchhiker  0.00641076 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  37.91 
 
 
387 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4229  ATPase central domain-containing protein  35.82 
 
 
328 aa  101  4e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  40 
 
 
789 aa  101  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  30.77 
 
 
391 aa  99.8  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2234  AAA ATPase, central region  35 
 
 
766 aa  99.4  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.218503  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2115  AAA ATPase central domain protein  41.73 
 
 
773 aa  99.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00930684  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1791  AAA ATPase central domain protein  41.73 
 
 
773 aa  99.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.615211 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1961  putative ATPase protein  42.45 
 
 
771 aa  98.6  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.242778  normal  0.909939 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  40.41 
 
 
795 aa  98.2  4e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  46.97 
 
 
772 aa  97.4  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  41.35 
 
 
789 aa  96.7  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5327  ATPase central domain-containing protein  32.17 
 
 
327 aa  97.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.449619  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08153  conserved hypothetical protein  30.81 
 
 
697 aa  96.3  2e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.677221 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  31.56 
 
 
308 aa  96.3  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3321  AAA family ATPase  33.89 
 
 
326 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.81305  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  35.61 
 
 
228 aa  93.6  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.754524 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06718  AAA family ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05752)  29.39 
 
 
822 aa  92.4  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1585  AAA ATPase, central domain-containing protein  32.28 
 
 
329 aa  92.8  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3863  ATPase central domain-containing protein  32.28 
 
 
329 aa  92.8  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000266484 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  39.01 
 
 
775 aa  91.7  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03290  ATPase, putative  30.23 
 
 
405 aa  90.1  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4892  AAA ATPase central domain protein  32.42 
 
 
326 aa  89.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2337  vesicle-fusing ATPase  28.98 
 
 
639 aa  89.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0101674 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1765  ATPase central domain-containing protein  36.75 
 
 
655 aa  89  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.835623  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2775  ATPase central domain-containing protein  32.16 
 
 
325 aa  89.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.36839  normal  0.706454 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  38.64 
 
 
698 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10210  AAA+ family ATPase  34.63 
 
 
336 aa  88.6  3e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.954892  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  35.71 
 
 
369 aa  88.6  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1692  putative ATPase  32.64 
 
 
322 aa  88.6  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.593174 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4803  ATPase central domain-containing protein  31.25 
 
 
328 aa  87.8  6e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2677  ATPase central domain-containing protein  32.49 
 
 
328 aa  87.8  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.681731 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4276  ATPase central domain-containing protein  28.95 
 
 
327 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1180  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  35.93 
 
 
781 aa  86.7  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.119571  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4417  ATPase central domain-containing protein  28.95 
 
 
327 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0735  AAA ATPase central domain protein  29.08 
 
 
459 aa  86.3  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00294  ATPase, AAA family protein  27.62 
 
 
676 aa  85.9  0.000000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0486  ATPase central domain-containing protein  29.61 
 
 
424 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1890  AAA ATPase central domain protein  32.14 
 
 
367 aa  85.1  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.439906  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1120  AAA ATPase central domain protein  33.97 
 
 
711 aa  85.5  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.986172  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2025  Vesicle-fusing ATPase  31.82 
 
 
601 aa  85.5  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>