176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1803 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1803  acetamidase/formamidase  100 
 
 		 358 aa  740    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0385546 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0982  acetamidase/formamidase  78.11 
 
 		 359 aa  554  1e-157  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.555434 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0872  Acetamidase/Formamidase  72.02 
 
 		 345 aa  512  1e-144  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5149  acetamidase/formamidase  70.8 
 
 		 343 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.606988  normal  0.788992 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0603  acetamidase/formamidase  71.68 
 
 		 343 aa  497  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0751  Acetamidase/Formamidase  41.28 
 
 		 479 aa  266  5.999999999999999e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.271097 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0788  Acetamidase/Formamidase  41.03 
 
 		 479 aa  265  8e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0609458 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0828  acetamidase/formamidase  41.03 
 
 		 479 aa  264  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.47116 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2104  twin-arginine translocation pathway signal  39.24 
 
 		 483 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4962  acetamidase/formamidase  41.03 
 
 		 491 aa  261  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0497  acetamidase/formamidase  40.69 
 
 		 481 aa  258  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.380834 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6507  AraC family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 777 aa  255  7e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3600  hypothetical protein  38.44 
 
 		 485 aa  249  7e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.229476  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5148  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 791 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113403  normal  0.388231 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0602  transcriptional regulator  38.11 
 
 		 791 aa  243  5e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.459823 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6506  hypothetical protein  39.36 
 
 		 413 aa  241  1e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3599  AraC family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 844 aa  241  2e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.675813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4963  AraC family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 810 aa  233  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.559194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0981  helix-turn-helix domain-containing protein  36.61 
 
 		 791 aa  233  6e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300542 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4612  acetamidase/formamidase  38.12 
 
 		 324 aa  209  5e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153809  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37952  predicted protein  32.13 
 
 		 775 aa  187  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0486  Acetamidase/Formamidase  31.64 
 
 		 347 aa  186  8e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1690  Acetamidase/Formamidase  34.17 
 
 		 438 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177288  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2188  acetamidase/formamidase  34.44 
 
 		 379 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.318866  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1761  Acetamidase/Formamidase  34.17 
 
 		 438 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4613  putative acetamidase/formamidase family protein  35.22 
 
 		 313 aa  179  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.270897  normal  0.158803 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37719  formamidase-like protein  35.61 
 
 		 389 aa  176  8e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.990726  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2780  acetamidase/formamidase  34.62 
 
 		 484 aa  175  9e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1622  acetamidase/formamidase  36.84 
 
 		 318 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1548  amidase  34.11 
 
 		 439 aa  172  5.999999999999999e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0188778 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0290  acetamidase/formamidase  32.96 
 
 		 373 aa  171  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2054  acetamidase/formamidase  30.81 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23832  normal  0.254507 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3711  acetamidase/formamidase  33.43 
 
 		 315 aa  159  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4413  acetamidase/formamidase  34.03 
 
 		 315 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0256307  normal  0.284988 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2420  acetamidase/formamidase  31.65 
 
 		 416 aa  156  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2379  acetamidase/formamidase  31.65 
 
 		 416 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2426  acetamidase/formamidase  31.65 
 
 		 416 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00499516  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3746  hypothetical protein  30.63 
 
 		 443 aa  152  7e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06140  predicted acetamidase/formamidase  30.56 
 
 		 456 aa  152  8e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.200294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2779  Acetamidase/Formamidase  34.09 
 
 		 363 aa  150  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.190953  hitchhiker  0.0000139746 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3088  acetamidase/formamidase  29.97 
 
 		 321 aa  150  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.953735  normal  0.583419 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5574  acetamidase/formamidase  31.79 
 
 		 381 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.49831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1631  acetamidase/formamidase  33.43 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0518528  normal  0.012309 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1227  Acetamidase/Formamidase  32.84 
 
 		 316 aa  150  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3443  putative acetamidase/formamidase  29.39 
 
 		 321 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5975  putative acetamidase/formamidase family protein  31.27 
 
 		 312 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17320  predicted acetamidase/formamidase  32.44 
 
 		 412 aa  145  8.000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00772804  normal  0.101325 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2015  acetamidase/formamidase  31.11 
 
 		 454 aa  145  9e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.914321  normal  0.937022 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0465  formamidase  32.53 
 
 		 322 aa  145  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000577809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3416  acetamidase/formamidase  33.03 
 
 		 315 aa  144  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4455  Acetamidase/Formamidase  31.5 
 
 		 418 aa  144  3e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.182113  normal  0.335394 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6677  Acetamidase/Formamidase  31.21 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.47216 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3711  Formamidase  33.43 
 
 		 328 aa  141  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2045  hypothetical protein  30.15 
 
 		 360 aa  141  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1574  acetamidase/formamidase  29.75 
 
 		 498 aa  138  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.569924  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3253  acetamidase / formamidase  32.51 
 
 		 319 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.426618  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3987  acetamidase/formamidase  32.51 
 
 		 319 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0987  acetamidase/formamidase  32.79 
 
 		 479 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.117184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3274  ABC-type oligopeptide transport system periplasmic component-like protein  32.51 
 
 		 319 aa  136  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5629  formamidase  32.09 
 
 		 314 aa  136  6.0000000000000005e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1750  acetamidase/formamidase  33.85 
 
 		 314 aa  132  6.999999999999999e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.057245  normal  0.122228 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0213  acetamidase/formamidase  32.99 
 
 		 315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179184  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1337  acetamidase/formamidase  31.78 
 
 		 312 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3551  acetamidase/formamidase  31.49 
 
 		 312 aa  130  4.0000000000000003e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2810  Acetamidase/Formamidase  30.03 
 
 		 313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.451627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6020  Acetamidase/Formamidase  29.51 
 
 		 339 aa  126  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4153  Acetamidase/Formamidase  30.06 
 
 		 305 aa  125  9e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1186  acetamidase/formamidase  30.86 
 
 		 337 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0627  Formamidase  29.29 
 
 		 318 aa  119  7.999999999999999e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5147  acetamidase/formamidase  31.54 
 
 		 337 aa  119  9e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.107753  normal  0.632762 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1964  Acetamidase/Formamidase  27.45 
 
 		 337 aa  119  9.999999999999999e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0147995  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1970  Acetamidase/Formamidase  29.93 
 
 		 342 aa  117  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0131196  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2656  acetamidase/formamidase  28.29 
 
 		 366 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2323  acetamidase  30.29 
 
 		 336 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2701  acetamidase/formamidase  31.34 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2686  acetamidase/formamidase  31.34 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.141733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0539  acetamidase/formamidase  30 
 
 		 291 aa  113  5e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6200  Acetamidase/Formamidase  28.21 
 
 		 303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.938221 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23480  predicted acetamidase/formamidase  30.43 
 
 		 300 aa  110  5e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00543842  hitchhiker  0.00000756798 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4920  Acetamidase/Formamidase  30 
 
 		 339 aa  110  5e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0606245 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6378  Acetamidase/Formamidase  27.59 
 
 		 303 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.344554 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4293  acetamidase/formamidase  30.36 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097508 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2678  Acetamidase/Formamidase  29.18 
 
 		 311 aa  106  5e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2109  Acetamidase/Formamidase  29.48 
 
 		 310 aa  106  7e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1964  acetamidase/formamidase  30.8 
 
 		 350 aa  105  1e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1104  acetamidase/formamidase  26.54 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.411366  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3015  acetamidase/formamidase  28.31 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.507939 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0644  acetamidase/formamidase  28.27 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.330219  normal  0.272858 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2995  Acetamidase/Formamidase  28.17 
 
 		 298 aa  104  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3317  acetamidase/formamidase  28.82 
 
 		 330 aa  104  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1423  acetamidase/formamidase  28.62 
 
 		 340 aa  103  5e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2613  acetamidase/formamidase family protein  27.3 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000108676 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0804  Acetamidase/Formamidase  30.38 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.700678  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2662  formamidase  29.53 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2928  Acetamidase/Formamidase  29.92 
 
 		 303 aa  101  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0774  Acetamidase/Formamidase  28.84 
 
 		 304 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0636  Acetamidase/Formamidase  29.85 
 
 		 305 aa  100  5e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2377  acetamidase  27.82 
 
 		 303 aa  100  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.91327  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2569  acetamidase/formamidase family protein  28.37 
 
 		 304 aa  99.4  9e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2018  acetamidase/formamidase  26.82 
 
 		 429 aa  99.4  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00169735  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>