218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1678 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1678  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 354 aa  688    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.936868  normal  0.549476 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3066  permease YjgP/YjgQ family protein  31.95 
 
 		 355 aa  151  1e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.326563 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3416  permease YjgP/YjgQ family protein  34.9 
 
 		 377 aa  143  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.738379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2177  permease YjgP/YjgQ  29.48 
 
 		 366 aa  99  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  26.33 
 
 		 359 aa  94  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  26.33 
 
 		 366 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  21.81 
 
 		 356 aa  89.7  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  28.26 
 
 		 364 aa  89.4  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2837  permease YjgP/YjgQ family protein  26.09 
 
 		 364 aa  89.4  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.240939  normal  0.233455 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1855  permease YjgP/YjgQ family protein  29.66 
 
 		 357 aa  87.8  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2199  YjgP/YjgQ family protein  29.66 
 
 		 357 aa  87.8  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0311  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  25.68 
 
 		 362 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  24.71 
 
 		 359 aa  84  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1919  permease YjgP/YjgQ family protein  25.22 
 
 		 369 aa  83.6  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3164  permease YjgP/YjgQ family protein  25.47 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  25.57 
 
 		 358 aa  82.8  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  25.4 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1723  permease YjgP/YjgQ family protein  24.93 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4924  permease YjgP/YjgQ family protein  24.92 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2171  permease YjgP/YjgQ family protein  21.31 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.103114 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2114  permease YjgP/YjgQ  23.55 
 
 		 368 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  27.49 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2406  permease YjgP/YjgQ  21.7 
 
 		 381 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0876436  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2222  permease YjgP/YjgQ family protein  26.51 
 
 		 361 aa  78.2  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.225398 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2678  permease YjgP/YjgQ family protein  26.02 
 
 		 371 aa  76.6  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197081  normal  0.64085 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  24.63 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2597  permease YjgP/YjgQ family protein  27.37 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10146 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1542  hypothetical protein  27.71 
 
 		 362 aa  74.7  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0651  permease YjgP/YjgQ family protein  24.01 
 
 		 362 aa  75.1  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2728  permease YjgP/YjgQ family protein  23.91 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.437446  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0679  permease YjgP/YjgQ family protein  27.66 
 
 		 350 aa  73.6  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  27.19 
 
 		 359 aa  72  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5837  permease YjgP/YjgQ family protein  26.87 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  24.3 
 
 		 374 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  23.89 
 
 		 353 aa  71.6  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  24.38 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  24.05 
 
 		 792 aa  70.9  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1944  hypothetical protein  24.5 
 
 		 373 aa  70.9  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.085708 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0582  hypothetical protein  26.12 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.878195  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3932  permease YjgP/YjgQ family protein  27.27 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44340  permease YjgP/YjgQ family  26.92 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.127644  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3339  permease YjgP/YjgQ family protein  26.01 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465141 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  24.72 
 
 		 356 aa  70.1  0.00000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1695  permease YjgP/YjgQ family protein  25.21 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  24.44 
 
 		 356 aa  69.3  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0528  putative permease  23.29 
 
 		 358 aa  68.9  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.0041624  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3472  permease YjgP/YjgQ family protein  23.21 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  22.28 
 
 		 359 aa  68.2  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1067  permease YjgP/YjgQ family protein  25.08 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183228 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3649  permease YjgP/YjgQ family protein  26.98 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.904037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002430  hypothetical protein  22.12 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00895033  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3942  permease YjgP/YjgQ family protein  26.98 
 
 		 362 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3537  permease YjgP/YjgQ family protein  24.63 
 
 		 369 aa  67.4  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0234236 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1678  permease YjgP/YjgQ  24.11 
 
 		 365 aa  67.4  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.626554 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1211  permease YjgP/YjgQ family protein  27.02 
 
 		 362 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000556533 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  23.81 
 
 		 353 aa  67  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0963  permease YjgP/YjgQ family protein  25.22 
 
 		 353 aa  67  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.670481  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1637  permease YjgP/YjgQ  23.21 
 
 		 391 aa  66.6  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0299198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0518  permease  23.78 
 
 		 356 aa  66.2  0.0000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.29406  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3045  permease YjgP/YjgQ family protein  24.32 
 
 		 369 aa  65.9  0.0000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.453296 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2341  permease YjgP/YjgQ  23.56 
 
 		 365 aa  65.5  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.231587  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2602  permease YjgP/YjgQ family protein  23.36 
 
 		 362 aa  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193291  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0873  permease YjgP/YjgQ  28.42 
 
 		 351 aa  64.7  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000147876  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0678  hypothetical protein  22.37 
 
 		 362 aa  64.7  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0941  permease YjgP/YjgQ family protein  24.1 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00480022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2479  permease YjgP/YjgQ  23.65 
 
 		 361 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0686  hypothetical protein  22.7 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3080  permease YjgP/YjgQ  26.03 
 
 		 362 aa  63.9  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  22.62 
 
 		 359 aa  63.9  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03633  hypothetical protein  21.88 
 
 		 356 aa  63.5  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  24.62 
 
 		 360 aa  63.2  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  23.97 
 
 		 364 aa  63.2  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187975 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0403  permease YjgP/YjgQ  27.22 
 
 		 354 aa  63.2  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0309466  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1837  permease YjgP/YjgQ family protein  22.54 
 
 		 434 aa  63.2  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1375  permease YjgP/YjgQ family protein  24.57 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1198  permease  20.61 
 
 		 359 aa  63.2  0.000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00112188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2967  permease YjgP/YjgQ  23.21 
 
 		 361 aa  62.8  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0631438  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  21.94 
 
 		 355 aa  62.4  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1016  permease YjgP/YjgQ family protein  23.35 
 
 		 352 aa  62  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00281225  normal  0.223874 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  21.32 
 
 		 388 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0397  permease YjgP/YjgQ family protein  22.92 
 
 		 354 aa  62.8  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0180892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5099  permease YjgP/YjgQ family protein  27.55 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.624296  normal  0.158403 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3264  YjgP/YjgQ permease  24.16 
 
 		 359 aa  62  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.917388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  22.74 
 
 		 359 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0538  permease YjgP/YjgQ  21.97 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.914546  decreased coverage  0.0076294 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2825  permease YjgP/YjgQ family protein  22.8 
 
 		 352 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0282438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2138  permease YjgP/YjgQ  26.5 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3830  putative permease  23.94 
 
 		 365 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.105268 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  22.64 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1370  hypothetical protein  23.91 
 
 		 352 aa  60.8  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  23.96 
 
 		 360 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2113  permease YjgP/YjgQ family protein  26.21 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.741512 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  22.19 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3159  YjgP/YjgQ permease  23.83 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2907  permease YjgP/YjgQ family protein  23.55 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000245216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3004  permease YjgP/YjgQ family protein  22.48 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000801817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0560  permease YjgP/YjgQ family protein  24.56 
 
 		 360 aa  59.7  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0147721  hitchhiker  0.00000329056 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2916  permease YjgP/YjgQ  22.92 
 
 		 354 aa  59.3  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0912  permease YjgP/YjgQ family protein  23.05 
 
 		 352 aa  58.9  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00097364  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  22.22 
 
 		 360 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>