More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1639 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  100 
 
 
137 aa  280  7.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2992  50S ribosomal protein L17  78.1 
 
 
142 aa  225  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.40506 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1570  50S ribosomal protein L17  75.74 
 
 
138 aa  218  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.207942  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1389  50S ribosomal protein L17  75.74 
 
 
138 aa  216  7e-56  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.814135  normal  0.354425 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2040  50S ribosomal protein L17  75.18 
 
 
140 aa  216  1e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.631241  normal  0.819045 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3159  50S ribosomal protein L17  73.33 
 
 
136 aa  210  5.999999999999999e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.286053  normal  0.4337 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5045  50S ribosomal protein L17  76.15 
 
 
137 aa  208  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146141  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3641  50S ribosomal protein L17  72.93 
 
 
139 aa  207  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.178298  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0723  50S ribosomal protein L17  75.81 
 
 
141 aa  206  7e-53  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.556575  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2761  ribosomal protein L17  71.53 
 
 
139 aa  206  8e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.336822 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2320  50S ribosomal protein L17  75.97 
 
 
138 aa  205  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.116353  normal  0.244368 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0328  50S ribosomal protein L17  73.85 
 
 
138 aa  203  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.997979  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1933  50S ribosomal protein L17  70.37 
 
 
140 aa  202  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0721548  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1011  50S ribosomal protein L17  77.42 
 
 
141 aa  199  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.264601 
 
 
-
 
NC_004310  BR1208  50S ribosomal protein L17  75.2 
 
 
142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.178196  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1171  50S ribosomal protein L17  75.2 
 
 
142 aa  198  1.9999999999999998e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.198804  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3423  50S ribosomal protein L17  75 
 
 
135 aa  198  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.108892 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1981  50S ribosomal protein L17  75.2 
 
 
142 aa  198  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  70.07 
 
 
140 aa  197  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1869  50S ribosomal protein L17  75.81 
 
 
141 aa  193  5.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1770  50S ribosomal protein L17P  75.81 
 
 
140 aa  194  5.000000000000001e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1455  50S ribosomal protein L17  75 
 
 
140 aa  192  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.026202  normal  0.30678 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2175  50S ribosomal protein L17  66.92 
 
 
138 aa  191  2e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.283997 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2453  50S ribosomal protein L17  67.69 
 
 
138 aa  192  2e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0612359  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1357  50S ribosomal protein L17  74.19 
 
 
140 aa  191  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.139721  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0280  50S ribosomal protein L17  70.16 
 
 
141 aa  191  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.39249 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2138  50S ribosomal protein L17  64.71 
 
 
138 aa  190  6e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.968449 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1653  50S ribosomal protein L17P  74.19 
 
 
143 aa  190  6e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4773  50S ribosomal protein L17  72.58 
 
 
140 aa  190  6e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000039604 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  72.87 
 
 
141 aa  190  7e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0310  50S ribosomal protein L17  66.18 
 
 
138 aa  188  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.43624 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0618  50S ribosomal protein L17  68.55 
 
 
138 aa  187  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2509  50S ribosomal protein L17  70.16 
 
 
139 aa  185  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.745035  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2190  50S ribosomal protein L17  65.19 
 
 
136 aa  184  3e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.407841  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0785  50S ribosomal protein L17  68.55 
 
 
140 aa  184  3e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.694499  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1740  50S ribosomal protein L17  68.55 
 
 
139 aa  184  5e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.219561  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0386  50S ribosomal protein L17  68.55 
 
 
139 aa  184  5e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592753  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  69.77 
 
 
146 aa  182  9e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0564  50S ribosomal protein L17  66.42 
 
 
139 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.684509  normal  0.93978 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2526  50S ribosomal protein L17  60.58 
 
 
141 aa  173  5e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505003  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1325  50S ribosomal protein L17  61.19 
 
 
140 aa  167  5e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.355864 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  61.98 
 
 
178 aa  159  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  60 
 
 
175 aa  157  4e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  61.67 
 
 
137 aa  154  5.0000000000000005e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  59.02 
 
 
184 aa  153  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0781  50S ribosomal protein L17  61.29 
 
 
127 aa  151  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.478066  normal  0.0510863 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  50 
 
 
151 aa  151  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04495  50S ribosomal protein L17  61.79 
 
 
127 aa  150  7e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0320  ribosomal protein L17  61.86 
 
 
128 aa  150  8e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0873  50S ribosomal protein L17P  59.35 
 
 
126 aa  149  8.999999999999999e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000802536  normal  0.0321624 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0431  50S ribosomal protein L17P  56.92 
 
 
129 aa  148  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.209959 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  55.28 
 
 
155 aa  149  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0447  50S ribosomal protein L17  60.83 
 
 
127 aa  148  2e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0079  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 
129 aa  148  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  60.33 
 
 
130 aa  147  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  60.33 
 
 
130 aa  147  3e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0305  50S ribosomal protein L17P  60.17 
 
 
131 aa  148  3e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000179668  hitchhiker  0.00147195 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0420  50S ribosomal protein L17  54.1 
 
 
127 aa  147  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0077  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 
131 aa  147  4e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000148079 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  58.97 
 
 
168 aa  147  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0346  50S ribosomal protein L17  58.91 
 
 
133 aa  147  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.000393302 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1015  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 
133 aa  146  8e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000218208  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001716  LSU ribosomal protein L17p  57.14 
 
 
126 aa  146  9e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000224597  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  60.33 
 
 
130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0396  50S ribosomal protein L17  49.64 
 
 
127 aa  146  1.0000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4250  50S ribosomal protein L17  59.5 
 
 
125 aa  146  1.0000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00366931  unclonable  0.00000000000172 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0793  ribosomal protein L17  57.63 
 
 
131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0240293  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  59.5 
 
 
129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  59.5 
 
 
129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  59.5 
 
 
129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2148  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 
128 aa  144  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000146092  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0431  50S ribosomal protein L17  59.5 
 
 
130 aa  144  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0355  50S ribosomal protein L17  58.2 
 
 
124 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0525  50S ribosomal protein L17  58.2 
 
 
124 aa  144  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000217625 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  59.5 
 
 
128 aa  144  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03145  50S ribosomal protein L17  58.06 
 
 
127 aa  144  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  58.06 
 
 
127 aa  144  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3777  50S ribosomal protein L17  58.06 
 
 
127 aa  144  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0600397  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  58.06 
 
 
127 aa  144  5e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4616  50S ribosomal protein L17  58.06 
 
 
127 aa  144  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00563678  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03096  hypothetical protein  58.06 
 
 
127 aa  144  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.363749  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  58.06 
 
 
127 aa  144  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  58.06 
 
 
127 aa  144  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  58.06 
 
 
127 aa  144  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0407  50S ribosomal protein L17  59.32 
 
 
129 aa  143  6e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3617  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 
130 aa  144  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201184  hitchhiker  0.0000000362399 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0745  50S ribosomal protein L17  60 
 
 
132 aa  144  6e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0341  50S ribosomal protein L17  61.02 
 
 
130 aa  144  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0245552 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  58.12 
 
 
124 aa  143  6e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0399  50S ribosomal protein L17  59.32 
 
 
129 aa  143  6e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00964  50S ribosomal protein L17  59.32 
 
 
133 aa  143  6e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0291857  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4518  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 
129 aa  143  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00131046  hitchhiker  0.0000327833 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  59.66 
 
 
127 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  59.66 
 
 
127 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2298  50S ribosomal protein L17P  59.32 
 
 
134 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  59.66 
 
 
127 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3780  50S ribosomal protein L17  59.66 
 
 
127 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3610  50S ribosomal protein L17  59.66 
 
 
127 aa  143  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.60339  normal  0.379851 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0354  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 
131 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.341272 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0375  50S ribosomal protein L17  60.17 
 
 
131 aa  143  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>