More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1625 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1625  50S ribosomal protein L24  100 
 
 
104 aa  201  2e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.290984 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2207  50S ribosomal protein L24  61.9 
 
 
104 aa  123  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.848645  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1919  50S ribosomal protein L24  63.21 
 
 
105 aa  123  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.800609  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0372  50S ribosomal protein L24  61.76 
 
 
101 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1726  50S ribosomal protein L24  61.76 
 
 
101 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.267784  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0117  50S ribosomal protein L24  59 
 
 
103 aa  120  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.09018e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0115  50S ribosomal protein L24  59 
 
 
103 aa  120  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  1.77787e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0133  50S ribosomal protein L24  59 
 
 
103 aa  120  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.5334e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0121  50S ribosomal protein L24  59 
 
 
103 aa  120  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  5.45325e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0121  50S ribosomal protein L24  59 
 
 
103 aa  120  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  1.27512e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2523  50S ribosomal protein L24  60.78 
 
 
101 aa  120  5e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5184  50S ribosomal protein L24  59 
 
 
103 aa  120  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  1.36575e-10  unclonable  1.12682e-25 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0121  50S ribosomal protein L24  59 
 
 
103 aa  120  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  1.11062e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0152  50S ribosomal protein L24  59 
 
 
103 aa  120  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.07051e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0142  50S ribosomal protein L24  59 
 
 
103 aa  120  5e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  6.03774e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2468  50S ribosomal protein L24  60 
 
 
104 aa  120  6e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.167187  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2190  50S ribosomal protein L24  60 
 
 
104 aa  120  6e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3437  50S ribosomal protein L24  62.86 
 
 
104 aa  120  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.372971  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0997  50S ribosomal protein L24  61.76 
 
 
103 aa  120  8e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0287179 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0116  50S ribosomal protein L24  58 
 
 
103 aa  120  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  4.83187e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0569  50S ribosomal protein L24  62.26 
 
 
105 aa  119  1e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1365  50S ribosomal protein L24  62.26 
 
 
105 aa  119  1e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.363618  normal  0.0194376 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1342  50S ribosomal protein L24  61.17 
 
 
105 aa  118  2e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1343  50S ribosomal protein L24  61.39 
 
 
102 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0303664  normal  0.0414713 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0115  50S ribosomal protein L24  57 
 
 
103 aa  117  4e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  5.84056e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1441  50S ribosomal protein L24  60.4 
 
 
102 aa  117  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.191537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2153  50S ribosomal protein L24  61.9 
 
 
104 aa  117  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05775  ribosomal protein L24  55.56 
 
 
104 aa  117  6e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0296  50S ribosomal protein L24  58.82 
 
 
101 aa  117  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.814079 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2747  ribosomal protein L24  61.32 
 
 
105 aa  117  7e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0215334  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0118  50S ribosomal protein L24  56 
 
 
103 aa  116  1e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00949  50S ribosomal protein L24  60.58 
 
 
104 aa  115  2e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  5.85684e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0122  50S ribosomal protein L24  56 
 
 
103 aa  115  2e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2700  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 
106 aa  115  2e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2807  50S ribosomal protein L24  60.95 
 
 
105 aa  115  2e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.426501 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1851  50S ribosomal protein L24  58.42 
 
 
102 aa  114  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.369616  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1667  50S ribosomal protein L24  61.17 
 
 
104 aa  114  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00304946  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1260  50S ribosomal protein L24  58.25 
 
 
105 aa  114  4e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3173  50S ribosomal protein L24  57.14 
 
 
104 aa  113  7e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.926144 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4787  50S ribosomal protein L24  60.38 
 
 
105 aa  113  9e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  7.60345e-07  unclonable  2.81859e-10 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1784  50S ribosomal protein L24P  66.35 
 
 
104 aa  113  1e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0499077  normal  0.110496 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5059  50S ribosomal protein L24  57.14 
 
 
104 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.944884  normal  0.752652 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0602  50S ribosomal protein L24  57.84 
 
 
101 aa  110  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0265  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 
101 aa  110  7e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0644649  normal  0.434055 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1556  50S ribosomal protein L24  56.19 
 
 
104 aa  110  8e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0770  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 
101 aa  110  9e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220954  normal  0.799575 
 
 
-
 
NC_004310  BR1222  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 
103 aa  110  9e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3656  50S ribosomal protein L24  58.1 
 
 
104 aa  109  1e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2306  50S ribosomal protein L24  58.1 
 
 
104 aa  109  1e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0131397  normal  0.106944 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1967  50S ribosomal protein L24  56.86 
 
 
103 aa  109  1e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00312191  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1185  50S ribosomal protein L24  55.88 
 
 
103 aa  109  1e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200549  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1000  50S ribosomal protein L24  55.77 
 
 
104 aa  108  2e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00244473  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2266  50S ribosomal protein L24  57.58 
 
 
105 aa  108  2e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000691586  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2307  50S ribosomal protein L24  57.58 
 
 
105 aa  108  2e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000480232  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1375  50S ribosomal protein L24  57.14 
 
 
104 aa  109  2e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.526606 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0612  ribosomal protein L24  57.69 
 
 
104 aa  109  2e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.257804  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0709  50S ribosomal protein L24  55.34 
 
 
104 aa  106  9e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000657544  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0677  50S ribosomal protein L24  55.34 
 
 
104 aa  106  9e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  1.08454e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1820  50S ribosomal protein L24  56.57 
 
 
105 aa  105  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.314422  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0613  ribosomal protein L24  57.43 
 
 
112 aa  104  5e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.584465 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2828  50S ribosomal protein L24  53.47 
 
 
102 aa  103  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000539429  normal  0.361907 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0342  50S ribosomal protein L24  62.26 
 
 
105 aa  103  9e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2977  50S ribosomal protein L24  52.83 
 
 
106 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0386  50S ribosomal protein L24  52 
 
 
104 aa  102  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0224  50S ribosomal protein L24  56.73 
 
 
104 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  8.6996e-10  unclonable  7.23515e-06 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0207  50S ribosomal protein L24  50.51 
 
 
102 aa  102  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1927  50S ribosomal protein L24  52 
 
 
106 aa  102  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0260  50S ribosomal protein L24  54.46 
 
 
102 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0016412  hitchhiker  0.00832042 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1472  50S ribosomal protein L24  50 
 
 
102 aa  101  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  7.19742e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0297  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 
106 aa  100  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.32797e-05  normal  0.0989855 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1935  50S ribosomal protein L24  50.94 
 
 
106 aa  100  6e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1566  ribosomal protein L24  47.12 
 
 
109 aa  100  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4304  50S ribosomal protein L24  51.92 
 
 
106 aa  100  9e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.375946  normal  0.0109188 
 
 
-
 
NC_002978  WD0670  50S ribosomal protein L24  55.66 
 
 
105 aa  99.8  1e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.077767  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04090  50S ribosomal protein L24  53.4 
 
 
104 aa  99.4  2e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0069  50S ribosomal protein L24  49.49 
 
 
101 aa  99  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.331076  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1127  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 
107 aa  99  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0371151  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2677  50S ribosomal protein L24  62.86 
 
 
106 aa  98.6  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.790603  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3811  50S ribosomal protein L24  55.77 
 
 
104 aa  98.2  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  3.90603e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6603  50S ribosomal protein L24  51.46 
 
 
104 aa  97.8  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1513  ribosomal protein L24  52.48 
 
 
107 aa  97.8  4e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.523195  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0606  50S ribosomal protein L24P  57.47 
 
 
89 aa  97.8  4e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  1.25199e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3633  50S ribosomal protein L24  53.61 
 
 
102 aa  98.2  4e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  4.32444e-06  decreased coverage  1.35878e-12 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2144  50S ribosomal protein L24P  49.06 
 
 
112 aa  98.2  4e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.168667  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0325  50S ribosomal protein L24  52.58 
 
 
102 aa  97.8  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000177904  decreased coverage  0.0025148 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0964  50S ribosomal protein L24  53.33 
 
 
106 aa  97.4  5e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0198062  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3489  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 
102 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00124411  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1935  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 
102 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000142192  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3158  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 
102 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  5.69435e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3735  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 
102 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  1.53975e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3793  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 
102 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.098  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3420  ribosomal protein L24  50.5 
 
 
101 aa  97.4  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3990  50S ribosomal protein L24  54.81 
 
 
104 aa  97.4  6e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0024494  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3765  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 
102 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000275135  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2621  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 
102 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.199386  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3057  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 
102 aa  97.4  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  2.84312e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0853  ribosomal protein L24  48.57 
 
 
118 aa  97.1  7e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3458  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 
102 aa  97.1  8e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  5.15991e-08  decreased coverage  0.00425299 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3912  50S ribosomal protein L24  48.08 
 
 
108 aa  97.1  8e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146923  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2748  50S ribosomal protein L24  52.48 
 
 
102 aa  97.1  8e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  2.11604e-08  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>