More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1474 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1474  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 
715 aa  1464    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.052337 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1206  TonB-dependent siderophore receptor, putative  40.86 
 
 
833 aa  502  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.843883  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003321  ferrichrome-iron receptor  39.08 
 
 
711 aa  501  1e-140  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0008  TonB-dependent siderophore receptor  39.05 
 
 
713 aa  492  9.999999999999999e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000108759 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4602  TonB-dependent siderophore receptor  40.14 
 
 
784 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4489  TonB-dependent siderophore receptor  39.24 
 
 
785 aa  462  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4121  TonB-dependent siderophore receptor  39.24 
 
 
785 aa  462  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.922703 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3979  ferrichrome outer membrane transporter  39.05 
 
 
729 aa  457  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0909  ferrioxamine B receptor  36.28 
 
 
716 aa  458  1e-127  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0142  ferrichrome outer membrane transporter  36.11 
 
 
729 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0154  ferrichrome outer membrane transporter  36.11 
 
 
729 aa  448  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2591  TonB-dependent siderophore receptor  39.78 
 
 
797 aa  446  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0220  ferrichrome outer membrane transporter  36.43 
 
 
729 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.874732  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  36.01 
 
 
747 aa  443  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00149  ferrichrome outer membrane transporter  36.58 
 
 
747 aa  441  9.999999999999999e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.145506  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0160  ferrichrome outer membrane transporter  36.72 
 
 
747 aa  442  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3613  TonB-dependent siderophore receptor  38.7 
 
 
789 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.187378 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3509  ferrichrome outer membrane transporter  36.58 
 
 
747 aa  440  9.999999999999999e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0167136  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0208  ferrichrome outer membrane transporter  36.82 
 
 
703 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0209  ferrichrome outer membrane transporter  36.82 
 
 
703 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00148  hypothetical protein  36.58 
 
 
745 aa  436  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.140481  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0224  ferrichrome outer membrane transporter  36.01 
 
 
747 aa  439  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.969953  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0227  ferrichrome outer membrane transporter  36.01 
 
 
747 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.71013  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0162  ferrichrome outer membrane transporter  36.47 
 
 
752 aa  436  1e-121  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4066  TonB-dependent siderophore receptor  38.37 
 
 
785 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3452  TonB-dependent siderophore receptor  36.58 
 
 
747 aa  433  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.380409  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0155  ferrichrome outer membrane transporter  36.58 
 
 
747 aa  433  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7042  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  39.12 
 
 
689 aa  434  1e-120  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  38.11 
 
 
748 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1976  TonB-dependent siderophore receptor  37.89 
 
 
829 aa  431  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935502  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6086  TonB-dependent siderophore receptor  37.65 
 
 
829 aa  427  1e-118  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.252964  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06299  hypothetical protein  35.88 
 
 
715 aa  427  1e-118  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  37.87 
 
 
729 aa  424  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3773  TonB-dependent siderophore receptor  36.38 
 
 
701 aa  420  1e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32740  TonB-dependent receptor  36.81 
 
 
820 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014522  hitchhiker  0.000022757 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2772  TonB-dependent receptor  37.14 
 
 
794 aa  420  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.600395  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0121  TonB-dependent siderophore receptor  36.34 
 
 
797 aa  415  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06160  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  36.12 
 
 
797 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.616824  normal  0.0240396 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0160  TonB-dependent siderophore receptor  36.82 
 
 
828 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  hitchhiker  0.000124393 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0178  TonB-dependent siderophore receptor  37.11 
 
 
828 aa  410  1e-113  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  35.96 
 
 
806 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3895  TonB-dependent siderophore receptor  36.4 
 
 
753 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.495237  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0179  TonB-dependent siderophore receptor  36.38 
 
 
828 aa  402  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.267617 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3270  TonB-dependent siderophore receptor  38.19 
 
 
831 aa  400  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0050464 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5189  TonB-dependent siderophore receptor  35.1 
 
 
808 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.435834  normal  0.330016 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1319  TonB-dependent siderophore receptor  35.26 
 
 
740 aa  398  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000200525  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2861  ferrichrome-iron receptor  35.69 
 
 
808 aa  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.331625  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0747  TonB-dependent siderophore receptor  36.47 
 
 
806 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3272  TonB-dependent siderophore receptor  36.9 
 
 
750 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.46801  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2736  TonB-dependent siderophore receptor  34.36 
 
 
705 aa  395  1e-108  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00111092 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1491  TonB-dependent siderophore receptor  35.66 
 
 
717 aa  393  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000036194  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4852  TonB-dependent siderophore receptor  34.98 
 
 
810 aa  395  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  35.58 
 
 
705 aa  392  1e-108  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3043  TonB-dependent siderophore receptor  35.82 
 
 
819 aa  391  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.635062  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3502  TonB-dependent siderophore receptor  36.15 
 
 
771 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2675  TonB-dependent siderophore receptor  35.87 
 
 
802 aa  391  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2920  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor signal peptide protein  36.6 
 
 
801 aa  386  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0458  ferrichrome-iron receptor  34.45 
 
 
696 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000766311 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0404  ferrichrome-iron receptor  34.45 
 
 
696 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000262521 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3322  TonB-dependent siderophore receptor  36.06 
 
 
828 aa  388  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0493  TonB-dependent siderophore receptor  33.99 
 
 
696 aa  384  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3736  TonB-dependent siderophore receptor  34.32 
 
 
735 aa  383  1e-105  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2082  TonB-dependent siderophore receptor  36.24 
 
 
771 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.340788  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3327  TonB-dependent siderophore receptor  38.4 
 
 
799 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0378  TonB-dependent siderophore receptor  35.14 
 
 
810 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0398  ferrichrome-iron receptor  34.17 
 
 
698 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2881  TonB-dependent siderophore receptor  35.63 
 
 
821 aa  380  1e-104  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.196032  normal  0.431289 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2395  TonB-dependent siderophore receptor  36.66 
 
 
812 aa  379  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3258  TonB-dependent siderophore receptor  34.04 
 
 
736 aa  379  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.875335  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0416  ferrichrome-iron receptor  34.17 
 
 
696 aa  381  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345861 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4365  TonB-dependent siderophore receptor  35.62 
 
 
769 aa  378  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.145999  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1178  TonB-dependent siderophore receptor  35.24 
 
 
741 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0776508  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0876  TonB-dependent siderophore receptor  35.24 
 
 
736 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.195373  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0687  TonB-dependent siderophore receptor  34.83 
 
 
797 aa  377  1e-103  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.862135  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1436  TonB-dependent siderophore receptor  36.55 
 
 
750 aa  378  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1079  TonB-dependent siderophore receptor  34.98 
 
 
714 aa  376  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.181404  normal  0.689217 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0395  ferrichrome-iron receptor  34.3 
 
 
696 aa  378  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.458077  hitchhiker  0.000000000000143872 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0701  TonB-dependent siderophore receptor  36.3 
 
 
778 aa  379  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0300951  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1622  TonB-dependent siderophore receptor  35.24 
 
 
736 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0285  TonB-dependent siderophore receptor  35.24 
 
 
752 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0472595  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2091  TonB-dependent siderophore receptor  35.34 
 
 
737 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.552144  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1499  TonB-dependent siderophore receptor  37.52 
 
 
747 aa  374  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2415  TonB-dependent siderophore receptor  35.14 
 
 
738 aa  375  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0592424  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1945  ferric malleobactin transporter  35.34 
 
 
753 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0342742  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1930  ferric malleobactin transporter  35.34 
 
 
753 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1644  TonB-dependent siderophore receptor  37.2 
 
 
745 aa  374  1e-102  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3741  TonB-dependent siderophore receptor  34.05 
 
 
723 aa  370  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.433802  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0376  TonB-dependent siderophore receptor  34.87 
 
 
810 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.319241  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0350  TonB-dependent siderophore receptor  34.62 
 
 
810 aa  366  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3324  TonB-dependent siderophore receptor  35.01 
 
 
745 aa  366  1e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.177313 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1045  TonB-dependent siderophore receptor  34.98 
 
 
699 aa  364  3e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.616371  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0646  TonB-dependent siderophore receptor  35.48 
 
 
665 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123915  normal  0.553141 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2636  TonB-dependent siderophore receptor  35.25 
 
 
776 aa  363  7.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1595  TonB-dependent siderophore receptor  36.31 
 
 
744 aa  363  8e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.603088  normal  0.0988814 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1826  TonB-dependent siderophore receptor  34.57 
 
 
779 aa  361  3e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.605271  normal  0.34402 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0683  TonB-dependent siderophore receptor  35.47 
 
 
728 aa  360  5e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0344523 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0672  TonB-dependent siderophore receptor  35.62 
 
 
728 aa  359  9.999999999999999e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.264811  normal  0.669281 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1876  TonB-dependent siderophore receptor  36.17 
 
 
744 aa  359  9.999999999999999e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.0292257 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7174  TonB-dependent siderophore receptor  33.96 
 
 
729 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.229498 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  34.76 
 
 
799 aa  357  3.9999999999999996e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>