185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1472 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1472  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  100 
 
 		 501 aa  987    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.150448 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0946  PepSY-associated TM helix  40.24 
 
 		 502 aa  302  8.000000000000001e-81  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.553628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0313  PepSY-associated TM helix  35.46 
 
 		 496 aa  273  7e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0564279  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01777  Aspartate kinase  32.63 
 
 		 497 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3918  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.08 
 
 		 374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.666771  normal  0.0844019 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1365  PepSY-associated TM helix  28.54 
 
 		 543 aa  124  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.708347  normal  0.863113 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3639  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  30.59 
 
 		 387 aa  120  4.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.200446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1872  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.84 
 
 		 506 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2125  PepSY-associated TM helix domain protein  27.84 
 
 		 536 aa  111  4.0000000000000004e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.911845  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02200  hypothetical protein  27.48 
 
 		 540 aa  107  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1718  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.11 
 
 		 506 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1507  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.4 
 
 		 525 aa  104  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.174501  normal  0.519514 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3563  hypothetical protein  25.3 
 
 		 527 aa  103  8e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0272  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.8 
 
 		 575 aa  102  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2808  PepSY-associated TM helix domain protein  26.61 
 
 		 519 aa  101  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2052  PepSY-associated TM helix domain protein  27.07 
 
 		 540 aa  97.8  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3376  PepSY-associated TM helix  28.38 
 
 		 503 aa  97.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.200366  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4991  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  28.38 
 
 		 503 aa  97.1  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.506943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3524  PepSY-associated TM helix  26.4 
 
 		 542 aa  96.7  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.617806  normal  0.525721 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4600  PepSY-associated TM helix domain protein  26.9 
 
 		 538 aa  95.9  1e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.406271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2856  PepSY-associated TM helix  25.06 
 
 		 539 aa  94.7  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.174371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53880  hypothetical protein  26.88 
 
 		 506 aa  94  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0679  hypothetical protein  28.25 
 
 		 503 aa  92.8  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5296  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.37 
 
 		 503 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.108916 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0204  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.01 
 
 		 533 aa  92.8  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1822  PepSY-associated TM helix family protein  27.02 
 
 		 504 aa  91.7  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4717  hypothetical protein  26.98 
 
 		 506 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4487  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.86 
 
 		 530 aa  89  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.568718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1252  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.66 
 
 		 518 aa  89  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4119  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.86 
 
 		 530 aa  89  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.442292  normal  0.809833 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1181  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.51 
 
 		 376 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36970  PepSY-associated TM helix domain protein  31.07 
 
 		 553 aa  80.5  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.138246  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0263  putative iron-regulated membrane protein  23.78 
 
 		 543 aa  80.5  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.730066  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  27.97 
 
 		 539 aa  80.1  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2015  PepSY-associated TM helix domain protein  26.72 
 
 		 627 aa  80.1  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.170125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1955  peptidase  26.39 
 
 		 407 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.464627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0109  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.63 
 
 		 534 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0927  aspartate kinase  22.43 
 
 		 529 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4431  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.63 
 
 		 534 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.828268  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2145  iron-regulated membrane protein, putative  26.26 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.970349  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1444  PepSY-associated TM helix  22.98 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.156778  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0854  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.98 
 
 		 526 aa  76.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4592  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.08 
 
 		 525 aa  76.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1239  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.12 
 
 		 570 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0137948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2157  putative iron-regulated membrane protein  25.07 
 
 		 504 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.921249  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2315  PepSY-associated TM helix  26.65 
 
 		 555 aa  76.3  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.650173  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0885  hypothetical protein  25.07 
 
 		 504 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0795  hypothetical protein  25.07 
 
 		 504 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0495  PepSY-associated TM helix domain protein  23.59 
 
 		 546 aa  75.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0449132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2094  peptidase  27.47 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.379833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1972  peptidase  26.25 
 
 		 397 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0508979 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1313  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.19 
 
 		 575 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.753678  normal  0.331666 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1236  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  26.09 
 
 		 575 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.755831  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4469  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.8 
 
 		 525 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4610  PepSY-associated TM helix domain protein  23.08 
 
 		 641 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1280  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.19 
 
 		 575 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3077  PepSY-associated TM helix domain protein  22.78 
 
 		 565 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516012 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2238  PepSY-associated TM helix domain protein  25.26 
 
 		 380 aa  73.9  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.682505 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3578  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.28 
 
 		 539 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2119  peptidase  23.87 
 
 		 397 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0434473 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0447  response regulator receiver protein  23.69 
 
 		 539 aa  72  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3797  hypothetical protein  25 
 
 		 397 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134487  normal  0.472768 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2589  PepSY-associated TM helix domain protein  29.25 
 
 		 476 aa  71.6  0.00000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2728  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.16 
 
 		 554 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0586  membrane protein  23.45 
 
 		 459 aa  71.2  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.561423 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33600  hypothetical protein  24.3 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000203719  normal  0.0451253 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1324  hypothetical protein  22.8 
 
 		 545 aa  70.5  0.00000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0524866 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4291  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  29.48 
 
 		 529 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1370  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.07 
 
 		 562 aa  70.9  0.00000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0583943  normal  0.13833 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3395  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.3 
 
 		 540 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1218  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.86 
 
 		 560 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25320  membrane protein  24.09 
 
 		 524 aa  70.1  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0147  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.22 
 
 		 507 aa  70.1  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950175  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0451  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.28 
 
 		 539 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1147  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.62 
 
 		 560 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.366711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1148  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  22.86 
 
 		 560 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1251  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.39 
 
 		 369 aa  69.7  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3407  hypothetical protein  25 
 
 		 559 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1211  hypothetical protein  22.22 
 
 		 521 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2342  putative iron-regulated membrane protein  23.78 
 
 		 550 aa  69.3  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.888846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2799  cellulose binding, type IV  21.52 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00104157  hitchhiker  0.0000107193 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1222  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  21.16 
 
 		 547 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3721  PepSY-associated TM helix  27.2 
 
 		 519 aa  68.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2356  PepSY-associated TM helix  25.43 
 
 		 574 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.59419  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3280  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  25.88 
 
 		 571 aa  67.8  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.442593  normal  0.404376 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5756  Propeptide PepSY amd peptidase M4  23.82 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3413  putative iron-regulated membrane protein  27.62 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.715022 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0449  hypothetical protein  22.03 
 
 		 539 aa  67  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1106  PepSY-associated TM helix  22.05 
 
 		 542 aa  66.6  0.0000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.772791  normal  0.374743 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1143  PepSY-associated TM helix  23.76 
 
 		 377 aa  66.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.193504  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3308  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  23.94 
 
 		 541 aa  66.6  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000521327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2856  hypothetical protein  23.16 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4666  Propeptide PepSY amd peptidase M4  24.03 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5344  PepSY-associated TM helix domain protein  22.81 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2666  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  23.82 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0181017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7063  putative uncharacterized iron-regulated membrane protein  22.49 
 
 		 410 aa  63.9  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1673  peptidase  22.83 
 
 		 398 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2065  PepSY-associated TM helix domain-containing protein  24.86 
 
 		 386 aa  63.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000240307 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3410  hypothetical protein  24.36 
 
 		 519 aa  62.8  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.755341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2169  PepSY-associated TM helix domain protein  23.83 
 
 		 534 aa  62.4  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.461921  hitchhiker  0.00144666 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>