268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1383 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1383  flagellar biosynthesis protein FliR  100 
 
 
251 aa  484  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.588943  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1931  flagellar biosynthetic protein FliR  39.57 
 
 
250 aa  186  2e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.852325  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2574  flagellar biosynthesis protein FliR  43.75 
 
 
253 aa  178  8e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0553295 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5534  flagellar biosynthetic protein FliR  40.42 
 
 
254 aa  175  7e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.084902  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5493  flagellar biosynthesis protein FliR  40.83 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.209401  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2231  flagellar biosynthetic protein FliR  40.77 
 
 
253 aa  171  6.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.621455  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1136  flagellar biosynthesis protein FliR  37.89 
 
 
256 aa  169  6e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5151  flagellar biosynthetic protein FliR  40.53 
 
 
252 aa  161  1e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0301148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1521  flagellar biosynthesis protein FliR  38.86 
 
 
256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0686482  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2827  flagellar biosynthetic protein FliR  41.53 
 
 
258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24941  normal  0.254342 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3773  flagellar biosynthesis protein FliR  40 
 
 
255 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0733885  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1697  flagellar biosynthesis protein FliR  40.65 
 
 
255 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.708349 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1396  flagellar biosynthesis protein FliR  38.86 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.401205  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2604  flagellar biosynthetic protein FliR  41.1 
 
 
258 aa  142  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390214  normal  0.406904 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4407  flagellar biosynthesis protein FliR  39.91 
 
 
255 aa  139  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.605024  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2634  flagellar biosynthetic protein FliR  39.5 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.485257  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2822  flagellar biosynthesis protein FliR  33.64 
 
 
253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.104106  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2394  flagellar biosynthesis protein FliR  31.91 
 
 
255 aa  118  9e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2130  type III secretion system inner membrane R protein  32.39 
 
 
259 aa  116  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4187  flagellar biosynthetic protein FliR  34.33 
 
 
256 aa  112  6e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2980  type III secretion system inner membrane R protein  37.38 
 
 
260 aa  112  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.751206 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1321  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  37.38 
 
 
260 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4136  flagellar biosynthetic protein FliR  31.82 
 
 
260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140259  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0773  flagellar biosynthesis protein FliR  27.16 
 
 
250 aa  108  8.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2954  flagellar biosynthetic protein FliR  33.03 
 
 
259 aa  106  4e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.103295 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0425  flagellar biosynthesis protein FliR  29.36 
 
 
264 aa  105  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2612  type III secretion system inner membrane R protein  33.06 
 
 
258 aa  105  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.151679 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  31.74 
 
 
261 aa  103  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3442  flagellar biosynthetic protein FliR  28.12 
 
 
264 aa  103  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0378  flagellar biosynthesis protein FliR  25.86 
 
 
250 aa  102  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296075  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0702  flagellar biosynthesis protein FliR  28.3 
 
 
255 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.310236  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0346  flagellar biosynthesis protein FliR  25.43 
 
 
250 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233596  normal  0.715402 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0284  flagellar biosynthesis protein FliR  26.94 
 
 
250 aa  101  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.22977  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16700  flagellar biosynthetic protein FliR  24.49 
 
 
259 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.794978  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  30.95 
 
 
261 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4197  flagellar biosynthetic protein FliR  29.82 
 
 
261 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3442  putative flagellar biosynthetic protein FliR  31.67 
 
 
253 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0271  flagellar biosynthesis protein FliR  32.08 
 
 
248 aa  99  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130948  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1159  flagellar biosynthesis protein FliR  29.46 
 
 
265 aa  97.4  2e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0763  flagellar biosynthetic protein FliR  31.63 
 
 
258 aa  96.7  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3095  flagellar biosynthesis protein FliR  26.2 
 
 
264 aa  96.3  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  31.19 
 
 
260 aa  96.3  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1119  flagellar biosynthesis protein FliR  28.17 
 
 
248 aa  95.1  9e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294704  normal  0.892593 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2924  flagellar biosynthetic protein FliR  32.75 
 
 
259 aa  94.7  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  29.66 
 
 
264 aa  94.7  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3288  flagellar biosynthetic protein FliR  25 
 
 
265 aa  92.8  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0050  type III secretion system inner membrane R protein  28.96 
 
 
249 aa  92  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3906  flagellar biosynthetic protein FliR  28.77 
 
 
261 aa  92  8e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00325261 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  28.44 
 
 
261 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  30.73 
 
 
262 aa  90.9  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  28.31 
 
 
258 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  27.39 
 
 
260 aa  89.7  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  31.94 
 
 
261 aa  89.7  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0586  flagellar biosynthetic protein FliR  25.1 
 
 
260 aa  89.7  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3822  flagellar biosynthetic protein FliR  28.77 
 
 
261 aa  89.4  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  28.82 
 
 
261 aa  89  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  30.34 
 
 
253 aa  89.4  6e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1411  flagellar biosynthetic protein FliR  25.1 
 
 
257 aa  88.2  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.844633  normal  0.465726 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  28.77 
 
 
258 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3589  flagellar biosynthesis protein FliR  30.4 
 
 
251 aa  86.3  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.528433  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1640  flagellar biosynthetic protein FliR  29.13 
 
 
253 aa  86.3  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3986  flagellar biosynthetic protein FliR  28.14 
 
 
259 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  28.97 
 
 
258 aa  85.5  7e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  27.65 
 
 
258 aa  85.1  9e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  27.65 
 
 
258 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  28.5 
 
 
256 aa  84  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0562  flagellar biosynthetic protein FliR  30.59 
 
 
240 aa  84  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.949104  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2031  type III secretion system inner membrane R protein  29.81 
 
 
255 aa  83.6  0.000000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  30.99 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1632  flagellar biosynthetic protein FliR  25.45 
 
 
257 aa  83.2  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  28.78 
 
 
261 aa  82.8  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  30.99 
 
 
256 aa  82.8  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2155  flagellar biosynthetic protein FliR  26.01 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.71741  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0788  flagellar biosynthesis protein FliR  32.1 
 
 
255 aa  82.4  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000389137  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  26.75 
 
 
265 aa  82  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  30.26 
 
 
267 aa  82  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4353  flagellar biosynthesis protein FliR  28.44 
 
 
258 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4185  flagellar biosynthesis protein FliR  31.03 
 
 
255 aa  81.6  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3483  flagellar biosynthetic protein FliR  31.2 
 
 
259 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4180  flagellar biosynthetic protein FliR  30.84 
 
 
264 aa  81.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0547  flagellar biosynthesis protein FliR  23.79 
 
 
253 aa  81.3  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00458922  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1131  flagellar biosynthesis protein FliR  29.07 
 
 
255 aa  80.5  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.715022  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0214  flagellar biosynthesis pathway, component FliR  26.81 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.72461  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1028  flagellar biosynthetic protein FliR  30.99 
 
 
253 aa  80.9  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  28.31 
 
 
265 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3666  flagellar biosynthetic protein FliR  29.91 
 
 
259 aa  80.1  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  29.63 
 
 
258 aa  80.1  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0483  flagellar biosynthesis protein FliR  21.96 
 
 
261 aa  79.7  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0146503  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  28.33 
 
 
265 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  28.31 
 
 
265 aa  79  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  28.31 
 
 
265 aa  79  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  28.31 
 
 
265 aa  79  0.00000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1164  flagellar biosynthetic protein FliR  24.46 
 
 
258 aa  79  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0378  flagellar biosynthetic protein FliR  25 
 
 
261 aa  78.6  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  27.91 
 
 
260 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  27.91 
 
 
260 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  27.91 
 
 
260 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0577  flagellar biosynthesis protein  29.52 
 
 
256 aa  78.6  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778054  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  27.98 
 
 
267 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  27.85 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>