More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1378 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1723  TonB-dependent receptor  46.89 
 
 		 868 aa  745    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00128023  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1378  TonB-dependent receptor  100 
 
 		 872 aa  1769    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.571563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01460  TonB-dependent receptor, putative  47.2 
 
 		 864 aa  722    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2417  TonB-dependent receptor, plug  38.57 
 
 		 823 aa  535  1e-150  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02748  putative TonB-dependent outer membrane receptor  35.33 
 
 		 856 aa  489  1e-137  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3992  TonB-dependent receptor plug  34.99 
 
 		 877 aa  464  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000578647  normal  0.249271 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2896  putative TonB-dependent outer membrane receptor  33.68 
 
 		 867 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000792676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3096  TonB-dependent receptor  34.18 
 
 		 851 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3081  TonB-dependent receptor  33.04 
 
 		 857 aa  433  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3801  TonB-dependent receptor  34.44 
 
 		 800 aa  430  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1028  TonB-dependent receptor  33.33 
 
 		 861 aa  426  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.518933  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0959  TonB-dependent receptor  33.22 
 
 		 858 aa  426  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1061  TonB-dependent receptor  33.23 
 
 		 867 aa  425  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3331  TonB-dependent receptor  33.12 
 
 		 867 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2180  TonB-dependent receptor  33.23 
 
 		 869 aa  419  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.225635  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2931  TonB-dependent receptor  33.22 
 
 		 870 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000063349  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02745  putative TonB-dependent outer membrane receptor  33.03 
 
 		 1015 aa  418  9.999999999999999e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3441  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 		 843 aa  387  1e-106  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00117935  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02222  putative TonB-dependent receptor  32.97 
 
 		 853 aa  363  6e-99  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0442  TonB-dependent receptor  32.28 
 
 		 797 aa  357  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0126161  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0456  TonB-dependent receptor  32.25 
 
 		 797 aa  355  2e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000941597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1344  ferric enterobactin receptor  31.58 
 
 		 788 aa  353  5e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  unclonable  0.00000000120084  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0517  TonB-dependent receptor  30.82 
 
 		 817 aa  353  5e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.069894  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0430  TonB-dependent receptor  31.93 
 
 		 797 aa  353  7e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000261093  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1279  TonB-dependent receptor  31.35 
 
 		 788 aa  349  1e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.0000000456142  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3884  TonB-dependent receptor  31.98 
 
 		 797 aa  349  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000140414  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0415  TonB-dependent receptor  31.69 
 
 		 812 aa  348  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0145049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2718  TonB-dependent receptor  31.24 
 
 		 803 aa  349  2e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000743296 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3540  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 812 aa  347  5e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000560682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3715  TonB-dependent receptor  31.25 
 
 		 812 aa  347  6e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000223353  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2484  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.97 
 
 		 800 aa  346  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.104897  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3139  TonB-dependent receptor  30.92 
 
 		 795 aa  346  1e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0252363  normal  0.788798 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 933 aa  343  9e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1342  ferric enterobactin receptor  30.73 
 
 		 793 aa  336  1e-90  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.127602  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3011  TonB-dependent sideophore receptor, putative  32.09 
 
 		 821 aa  335  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.659574  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1277  TonB-dependent receptor  30.73 
 
 		 793 aa  335  3e-90  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0868326  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1708  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 		 817 aa  334  4e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01941  TonB-dependent outer membrane receptor  31.91 
 
 		 784 aa  333  6e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2657  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 		 811 aa  331  4e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0512157  normal  0.824086 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01939  TonB-dependent outer membrane receptor  31.18 
 
 		 795 aa  329  1.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1412  TonB-dependent receptor  30.72 
 
 		 847 aa  328  3e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2892  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  31.97 
 
 		 815 aa  327  8.000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30590  putative outer membrane receptor protein  30.2 
 
 		 884 aa  325  3e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.507511 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0153  TonB-dependent receptor plug  29.69 
 
 		 918 aa  323  6e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01938  TonB-dependent outer membrane Receptor  30.99 
 
 		 799 aa  323  9.000000000000001e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0932  TonB-dependent receptor, plug  29.27 
 
 		 840 aa  320  7e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3152  TonB-dependent receptor  29.76 
 
 		 811 aa  311  4e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.248093  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2818  TonB-dependent receptor  29.19 
 
 		 853 aa  310  5e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141379  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2289  outer membrane protein  29.55 
 
 		 870 aa  309  1.0000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000176254  unclonable  0.000000033388 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2507  TonB-dependent receptor  32.18 
 
 		 842 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2342  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 		 795 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.198134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  30.53 
 
 		 924 aa  304  6.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0935  TonB-dependent receptor, plug  28.6 
 
 		 961 aa  304  6.000000000000001e-81  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2509  TonB-dependent receptor  31.03 
 
 		 803 aa  304  6.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0337373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0702  TonB-dependent receptor  29.2 
 
 		 948 aa  303  1e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.861146  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 874 aa  303  1e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3218  putative TonB-dependent receptor for Fe  30.51 
 
 		 848 aa  300  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3580  TonB-dependent receptor  29.07 
 
 		 835 aa  296  9e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04865  TonB-dependent outer membrane Receptor  29.93 
 
 		 811 aa  295  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0399  putative TonB-dependent siderophore receptor  30.41 
 
 		 818 aa  294  5e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37490  putative TonB-dependent receptor  29.54 
 
 		 883 aa  293  7e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0134389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2621  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 871 aa  289  1e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3349  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 815 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.51089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2466  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 887 aa  284  5.000000000000001e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2607  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.73 
 
 		 832 aa  284  6.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0816697  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 947 aa  283  1e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2934  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 987 aa  267  5e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21630  TonB-dependent siderophore receptor  28.22 
 
 		 833 aa  264  4e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.176382  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2290  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  36.8 
 
 		 800 aa  261  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000569019 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1586  TonB-dependent receptor plug  28.78 
 
 		 816 aa  258  4e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1693  TonB-dependent receptor  32.41 
 
 		 858 aa  248  3e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0349  TonB-dependent receptor  28.59 
 
 		 850 aa  248  4.9999999999999997e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7322  TonB-dependent receptor  27.81 
 
 		 804 aa  243  9e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2592  TonB-dependent receptor plug  25.88 
 
 		 885 aa  242  2e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.228044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1934  TonB-dependent receptor plug  27.9 
 
 		 813 aa  241  5.999999999999999e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.860003 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2031  TonB-dependent receptor  25.95 
 
 		 849 aa  241  5.999999999999999e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2586  TonB-dependent receptor plug  28.13 
 
 		 924 aa  233  9e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.427488  normal  0.0373084 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1490  TonB-dependent receptor, plug  28.02 
 
 		 948 aa  233  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0915  TonB-dependent receptor plug  24.66 
 
 		 842 aa  223  9.999999999999999e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0358402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2276  TonB-dependent receptor plug  26.34 
 
 		 873 aa  219  2e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2160  TonB-dependent receptor, plug  35.32 
 
 		 797 aa  218  5e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00475664  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2260  TonB-dependent receptor  26.64 
 
 		 852 aa  205  3e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2318  TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 879 aa  193  1e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.488825 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0393  putative TonB-dependent siderophore receptor  34.31 
 
 		 847 aa  179  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2074  TonB-dependent receptor  24.17 
 
 		 836 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1940  TonB-dependent receptor  22.78 
 
 		 838 aa  105  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0622221  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2565  TonB-dependent receptor  21.91 
 
 		 843 aa  105  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0458531 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3438  TonB-dependent receptor  21.93 
 
 		 904 aa  104  6e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3254  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 950 aa  102  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.647514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3184  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 861 aa  101  6e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.162767  hitchhiker  0.00577733 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0855  TonB-dependent receptor  21.78 
 
 		 904 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0782  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 861 aa  100  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.089219  normal  0.0917766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0754  TonB-dependent receptor  28.36 
 
 		 861 aa  100  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.95641  normal  0.139424 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1838  TonB-dependent receptor, putative  24.43 
 
 		 839 aa  99.8  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000660835  normal  0.0669762 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3509  TonB-dependent receptor  21.8 
 
 		 904 aa  99  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2036  TonB-dependent receptor  22.29 
 
 		 841 aa  98.2  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.519963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3632  TonB-dependent receptor  21.43 
 
 		 904 aa  97.8  8e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0138  TonB-dependent receptor:TonB-dependent receptor  26.11 
 
 		 904 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.764609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01107  TonB-dependent receptor  25.9 
 
 		 871 aa  96.3  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0244435  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0268  TonB system transport protein, putative  26.11 
 
 		 877 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>