More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1333 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1333  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
201 aa  410  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.103575  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
201 aa  104  9e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
220 aa  92.4  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
198 aa  90.5  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
199 aa  84.3  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  38.17 
 
 
211 aa  77.8  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 
223 aa  77  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
222 aa  75.9  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3781  TetR family transcriptional regulator  30.18 
 
 
214 aa  75.5  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  36.64 
 
 
211 aa  75.5  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  36.64 
 
 
211 aa  75.1  0.0000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 
213 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6941  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 
198 aa  72.8  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2513  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
212 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 
194 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 
198 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 
198 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 
204 aa  68.9  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 
198 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1837  transcriptional regulator EefR  34.13 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000033131 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  34.13 
 
 
188 aa  68.6  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  0.0000000455593 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 
196 aa  68.2  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 
205 aa  68.2  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1334  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.180708  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 
196 aa  64.7  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0995  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 
192 aa  63.5  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 
244 aa  63.2  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  43.06 
 
 
212 aa  61.6  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 
204 aa  61.2  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1135  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 
206 aa  61.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0118  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
247 aa  59.3  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.211628  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 
178 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 
205 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0109  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
247 aa  59.3  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  26.06 
 
 
202 aa  59.7  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
206 aa  58.9  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
199 aa  58.9  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  28.82 
 
 
214 aa  58.2  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4533  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
218 aa  57  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.505005  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  32.98 
 
 
211 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  29.57 
 
 
198 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 
199 aa  56.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 
291 aa  56.2  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 
201 aa  56.2  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4792  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
184 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.165855  normal  0.419651 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 
201 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4394  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 
198 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 
190 aa  55.5  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5076  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
209 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5784  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
209 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.907377 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  31.09 
 
 
201 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 
209 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4103  regulatory protein TetR  37.5 
 
 
220 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.557347 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 
205 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
220 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6768  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 
221 aa  53.9  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  47.17 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
201 aa  53.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4471  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
220 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  24.52 
 
 
216 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1440  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 
213 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0208928 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
203 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  27.42 
 
 
213 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 
198 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 
497 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 
245 aa  52.8  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  23.65 
 
 
210 aa  52.4  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
202 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
202 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  29.13 
 
 
202 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 
210 aa  52.4  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 
209 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  26.73 
 
 
257 aa  52  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  40.35 
 
 
225 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0097  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 
215 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.56928  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
193 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0041  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
175 aa  52  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  27.35 
 
 
199 aa  51.6  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 
234 aa  51.6  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1276  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 
214 aa  51.6  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933053  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
269 aa  51.6  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 
200 aa  51.6  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 
206 aa  51.6  0.000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  30.15 
 
 
335 aa  51.6  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
212 aa  51.2  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
234 aa  51.2  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
190 aa  51.2  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.122558 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 
192 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
190 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  32.17 
 
 
196 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  40.91 
 
 
278 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 
213 aa  50.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  32.17 
 
 
196 aa  50.8  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1503  TetR family transcriptional regulator  24.63 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0825242 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  32.17 
 
 
196 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>