21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1266 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1266  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  202  1e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  decreased coverage  0.00853794  normal  0.0139586 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3800  hypothetical protein  42.72 
 
 
103 aa  93.2  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0402  hypothetical protein  43.69 
 
 
107 aa  92.8  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0459082  normal  0.481089 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0337  hypothetical protein  43.69 
 
 
103 aa  87  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27978  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3683  hypothetical protein  40.78 
 
 
103 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.812045  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0721  hypothetical protein  42.45 
 
 
104 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0708  hypothetical protein  40.57 
 
 
104 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.541154  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3507  hypothetical protein  44.86 
 
 
105 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.681394 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3183  hypothetical protein  44.86 
 
 
105 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3378  hypothetical protein  43.93 
 
 
105 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225345  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4169  hypothetical protein  37.86 
 
 
102 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.416862  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1476  hypothetical protein  40.57 
 
 
104 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.201129  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6327  hypothetical protein  37.86 
 
 
103 aa  76.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.426865  normal  0.218826 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1878  hypothetical protein  37.86 
 
 
102 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3488  hypothetical protein  36.89 
 
 
102 aa  72.8  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372744  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1573  hypothetical protein  40 
 
 
110 aa  67.4  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0499  hypothetical protein  28.87 
 
 
109 aa  55.1  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.270786  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1283  hypothetical protein  32.58 
 
 
106 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5801  hypothetical protein  34.04 
 
 
91 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66890  hypothetical protein  34.04 
 
 
91 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0388  hypothetical protein  26.67 
 
 
91 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.182376 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>