More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1238 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1238  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
579 aa  1134    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0280549 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0899  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.11 
 
 
562 aa  277  3e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.000736499  normal  0.0870171 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3515  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.67 
 
 
627 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.1939  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0673  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37 
 
 
643 aa  234  3e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.431385 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3045  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.61 
 
 
587 aa  230  6e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1944  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.74 
 
 
607 aa  230  6e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.133284  normal  0.0645132 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0700  PAS sensor protein  35.01 
 
 
648 aa  229  7e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.390085  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0711  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.01 
 
 
646 aa  229  7e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.386988 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2221  Signal transduction histidine kinase  47.45 
 
 
605 aa  229  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.763849  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1427  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.01 
 
 
717 aa  229  1e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0936  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.86 
 
 
617 aa  227  5.0000000000000005e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.422617  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.34 
 
 
484 aa  226  1e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.197112  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2063  multi-sensor signal transduction histidine kinase  49.47 
 
 
610 aa  223  7e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0950  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.55 
 
 
911 aa  218  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.666627 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.86 
 
 
774 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1373  two component sensor kinase  45.6 
 
 
790 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3431  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  49.6 
 
 
844 aa  214  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.737925 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2623  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.65 
 
 
614 aa  214  4.9999999999999996e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.77 
 
 
661 aa  214  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2018  ATP-binding region, ATPase-like  44.88 
 
 
771 aa  213  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88254  normal  0.468508 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 
784 aa  211  2e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.501852  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1847  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.93 
 
 
775 aa  212  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0491237  normal  0.422245 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1626  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.26 
 
 
770 aa  211  2e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.255804  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0956  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  47.37 
 
 
600 aa  210  6e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.818722 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0617  histidine kinase  50.67 
 
 
525 aa  210  7e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.862925  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3213  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  45.14 
 
 
778 aa  208  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.56 
 
 
769 aa  208  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0616  sensory box histidine kinase  46.5 
 
 
783 aa  207  3e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.260748  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1779  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.32 
 
 
612 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.546306  normal  0.0258189 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0615  sensory box histidine kinase  46.5 
 
 
783 aa  207  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0438  putative non-motile and phage-resistance protein  44.58 
 
 
773 aa  207  4e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3436  histidine kinase  46.12 
 
 
771 aa  207  5e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.416045  normal  0.0284383 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0884  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.14 
 
 
513 aa  206  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.683034  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1639  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.56 
 
 
583 aa  206  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.19247  normal  0.411999 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0641  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.3 
 
 
772 aa  205  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0929  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.38 
 
 
769 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0582666 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3094  two-component sensor histidine kinase  45.83 
 
 
774 aa  204  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.81 
 
 
769 aa  204  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.459877  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1010  histidine kinase  44.09 
 
 
503 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.68 
 
 
795 aa  201  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.228463 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.91 
 
 
798 aa  201  3.9999999999999996e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0658643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1778  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.64 
 
 
606 aa  200  6e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.415214  decreased coverage  0.0072817 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1449  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  43.19 
 
 
775 aa  199  9e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00109411  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1200  Signal transduction histidine kinase  42.38 
 
 
779 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0712  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.2 
 
 
605 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0997338  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1935  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.94 
 
 
523 aa  197  5.000000000000001e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.345754 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0477  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.22 
 
 
786 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1884  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.22 
 
 
389 aa  196  8.000000000000001e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.329348  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0543  PAS sensor protein  45.38 
 
 
786 aa  196  1e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0831512  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.42 
 
 
630 aa  196  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.591777 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0514  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.22 
 
 
786 aa  195  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.292682 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0639  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 
456 aa  195  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0577  sensor histidine kinase  43.17 
 
 
609 aa  194  4e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.704828  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0577  sensor histidine kinase  43.17 
 
 
609 aa  194  4e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.64 
 
 
797 aa  193  6e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3152  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.7 
 
 
468 aa  193  6e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.229393  normal  0.25439 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.46 
 
 
1138 aa  192  1e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.619733  normal  0.530694 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0827  two component sensor kinase  35.66 
 
 
1410 aa  192  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  48.51 
 
 
508 aa  191  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0327  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  44.92 
 
 
620 aa  191  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  42.26 
 
 
1046 aa  190  5e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1670  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.26 
 
 
494 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422523 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.93 
 
 
614 aa  189  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 
763 aa  187  3e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5476  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.81 
 
 
782 aa  187  4e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3251  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.31 
 
 
377 aa  187  4e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.360727  normal  0.404582 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0877  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.35 
 
 
548 aa  187  5e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.991624  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3007  two component system histidine kinase  40.31 
 
 
729 aa  187  7e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0422303  hitchhiker  0.00299589 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0413  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.11 
 
 
1276 aa  186  8e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0153135  hitchhiker  0.00020462 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0171  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 
1192 aa  186  9e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3395  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.04 
 
 
530 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.109713  normal  0.424622 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0381  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.11 
 
 
1296 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00957634 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.35 
 
 
1352 aa  186  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2185  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.43 
 
 
531 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  39.39 
 
 
687 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1305  two component sensor kinase  44.02 
 
 
599 aa  184  4.0000000000000006e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.282696  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1606  sensory box histidine kinase  33.86 
 
 
1035 aa  184  5.0000000000000004e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.23328  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.46 
 
 
530 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.227598  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3923  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
1055 aa  182  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0268  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.57 
 
 
764 aa  182  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0862951 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 
371 aa  182  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1549  sensory box histidine kinase  33.6 
 
 
1035 aa  180  4.999999999999999e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1553  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.51 
 
 
505 aa  181  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2064  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.23 
 
 
533 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0167055  normal  0.0634721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3460  putative sensor histidine kinase, putative membrane protein  40.75 
 
 
532 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.305573 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.97 
 
 
502 aa  179  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0215  sensor histidine kinase  38.68 
 
 
470 aa  178  2e-43  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00343195  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2574  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.21 
 
 
512 aa  177  3e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1473  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.16 
 
 
1380 aa  176  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3474  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.91 
 
 
836 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1212  Signal transduction histidine kinase  39.46 
 
 
536 aa  176  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.39876  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1469  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 
536 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.997673  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2369  multi-sensor signal transduction histidine kinase  47.06 
 
 
793 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315374 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2944  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 
573 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1885  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.69 
 
 
792 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0885  sensor histidine kinase  38.52 
 
 
470 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.982785  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4820  histidine kinase  41.39 
 
 
513 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.780698  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.13 
 
 
646 aa  174  5.999999999999999e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2119  multisensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 
582 aa  173  6.999999999999999e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3270  histidine kinase  38.02 
 
 
565 aa  173  7.999999999999999e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>