207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1235 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1235  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
312 aa  640    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0119154 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3659  rhodanese domain-containing protein  67.31 
 
 
322 aa  427  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.245407  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3418  rhodanese domain-containing protein  62.05 
 
 
317 aa  375  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0529326  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4255  rhodanese domain-containing protein  58.5 
 
 
305 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0081  rhodanese family protein  56.86 
 
 
305 aa  363  1e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.919299  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0086  rhodanese family protein  56.86 
 
 
308 aa  363  2e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1677  rhodanese domain-containing protein  58.06 
 
 
311 aa  353  2e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0239386 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0850  rhodanese domain-containing protein  60.48 
 
 
322 aa  349  3e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0011  rhodanese-like protein  58.42 
 
 
301 aa  344  1e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.921465 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3429  rhodanese-like protein  58.59 
 
 
299 aa  343  2e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.59768  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3823  hypothetical protein  54.1 
 
 
314 aa  337  1.9999999999999998e-91  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3401  Rhodanese domain protein  55.12 
 
 
309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0500445 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3699  Rhodanese domain protein  55.37 
 
 
309 aa  333  2e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2319  rhodanese-like protein  54.33 
 
 
323 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000129535  hitchhiker  0.00245583 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1312  hypothetical protein  52.16 
 
 
309 aa  326  3e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.406056 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2937  rhodanese-like protein  55.23 
 
 
316 aa  325  5e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.751975  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3348  rhodanese domain protein  56.48 
 
 
313 aa  325  8.000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.305803  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2782  rhodanese domain-containing protein  55.26 
 
 
315 aa  325  8.000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1091  rhodanese-like domain-containing protein  51.48 
 
 
305 aa  325  9e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.96607  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3407  rhodanese domain-containing protein  49 
 
 
328 aa  322  5e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1939  rhodanese domain-containing protein  53.92 
 
 
316 aa  322  8e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2524  rhodanese domain-containing protein  50.5 
 
 
327 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1781  hypothetical protein  50 
 
 
326 aa  319  5e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1973  rhodanese domain-containing protein  49.01 
 
 
332 aa  318  1e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000137009  normal  0.0153994 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0394  hypothetical protein  49.5 
 
 
337 aa  317  1e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.845819  hitchhiker  0.00000114431 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0370  hypothetical protein  48.84 
 
 
352 aa  317  2e-85  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0411  hypothetical protein  48.84 
 
 
352 aa  316  3e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4798  hypothetical protein  49.67 
 
 
341 aa  314  9.999999999999999e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2825  rhodanese-like protein  54.36 
 
 
305 aa  313  2.9999999999999996e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257252  normal  0.124761 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1961  rhodanese-like protein  53.57 
 
 
319 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2535  rhodanese domain-containing protein  49.83 
 
 
331 aa  313  2.9999999999999996e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.848457  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3012  rhodanese domain-containing protein  50.96 
 
 
339 aa  313  3.9999999999999997e-84  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0964  hypothetical protein  49.67 
 
 
336 aa  311  1e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2366  hypothetical protein  49.83 
 
 
334 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000582492  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1535  hypothetical protein  49.83 
 
 
350 aa  310  2e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.242379  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2481  hypothetical protein  49.83 
 
 
334 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000192331  hitchhiker  0.000621581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2378  hypothetical protein  49.83 
 
 
334 aa  310  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000317317  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0216  hypothetical protein  48.68 
 
 
326 aa  309  2.9999999999999997e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.32074  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1981  hypothetical protein  49.83 
 
 
334 aa  309  4e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000899017  hitchhiker  0.0000000957074 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2130  hypothetical protein  50.17 
 
 
334 aa  309  4e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2261  hypothetical protein  49.17 
 
 
330 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000101343  normal  0.473461 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2660  rhodanese domain-containing protein  51.5 
 
 
326 aa  308  8e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.918905  normal  0.0411957 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1838  hypothetical protein  49.17 
 
 
333 aa  308  9e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.287908  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53180  hypothetical protein  51.83 
 
 
312 aa  308  9e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4661  hypothetical protein  51.83 
 
 
312 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0559413  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4090  hypothetical protein  50.67 
 
 
313 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1760  hypothetical protein  49.17 
 
 
330 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0425355  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2550  rhodanese domain-containing protein  54.93 
 
 
555 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0160345 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0088  hypothetical protein  52.35 
 
 
314 aa  305  9.000000000000001e-82  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2290  hypothetical protein  48.84 
 
 
333 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2100  hypothetical protein  48.84 
 
 
326 aa  302  5.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3658  hypothetical protein  50 
 
 
317 aa  301  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.451808  normal  0.392635 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1734  rhodanese-like domain protein  50 
 
 
317 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.668839  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1365  hypothetical protein  50.67 
 
 
310 aa  300  2e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.137534  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1758  hypothetical protein  49.66 
 
 
310 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.172624  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2362  Rhodanese domain protein  49.67 
 
 
304 aa  299  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3956  hypothetical protein  50 
 
 
310 aa  299  5e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.765325  normal  0.0181852 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1693  hypothetical protein  50.67 
 
 
312 aa  298  6e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.782277  normal  0.169861 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06657  hypothetical protein  48.03 
 
 
326 aa  297  2e-79  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2412  Rhodanese domain protein  49.67 
 
 
302 aa  296  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.579673  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0682  Rhodanese domain protein  49.48 
 
 
294 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0878  hypothetical protein  47.52 
 
 
332 aa  296  4e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000330025  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01937  hypothetical protein  47.99 
 
 
323 aa  296  4e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00833582  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0115  rhodanese domain-containing protein  50.52 
 
 
306 aa  295  7e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001128  rhodanese domain protein  46.38 
 
 
326 aa  294  1e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000331641  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0147  rhodanese-like protein  61.09 
 
 
242 aa  293  2e-78  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.744417  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1349  hypothetical protein  48.66 
 
 
310 aa  292  6e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0654  rhodanese-like  45.05 
 
 
319 aa  290  2e-77  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.597958  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10921  sulfurtransferase  43.88 
 
 
320 aa  282  4.0000000000000003e-75  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.261279 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14861  sulfurtransferase  44.37 
 
 
319 aa  282  5.000000000000001e-75  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.612505 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1395  rhodanese-like protein  46.28 
 
 
305 aa  281  7.000000000000001e-75  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1635  rhodanese-like protein  47.96 
 
 
327 aa  278  9e-74  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1078  rhodanese-like protein  54.66 
 
 
255 aa  266  5e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0473759  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11851  sulfurtransferase  40.07 
 
 
310 aa  262  4e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.403922  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2196  hypothetical protein  51.15 
 
 
255 aa  256  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.771085  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09971  sulfurtransferase  43.99 
 
 
310 aa  257  2e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2998  rhodanese-like sulfurtransferase  50.2 
 
 
255 aa  253  3e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.317205  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12011  sulfurtransferase  40.07 
 
 
310 aa  247  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.303044  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1135  rhodanese domain-containing protein  45.59 
 
 
275 aa  244  9.999999999999999e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1105  rhodanese-like protein  39.73 
 
 
310 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12001  sulfurtransferase  39.06 
 
 
310 aa  243  3e-63  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.982527  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3915  rhodanese domain-containing protein  50 
 
 
257 aa  242  5e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1892  rhodanese-like protein  44.72 
 
 
269 aa  239  2.9999999999999997e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2969  pseudouridine synthase, RluA family  42.11 
 
 
623 aa  220  1.9999999999999999e-56  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0255  rhodanese domain-containing protein  43.63 
 
 
302 aa  218  1e-55  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.297273  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0896  rhodanese domain-containing protein  41.57 
 
 
275 aa  217  2e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.259251  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2897  hypothetical protein  42.13 
 
 
254 aa  215  7e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0206  rhodanese-like protein  40.3 
 
 
274 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2750  hypothetical protein  42.55 
 
 
254 aa  211  1e-53  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_26565  predicted protein  42.81 
 
 
346 aa  205  1e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.460392  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1914  rhodanese superfamily protein  41 
 
 
299 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0100807  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1354  rhodanese superfamily protein  41 
 
 
299 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.104062  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1042  rhodanese superfamily protein  41 
 
 
299 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.176133  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0826  rhodanese superfamily protein  41 
 
 
299 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.56708  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1196  rhodanese superfamily protein  41 
 
 
299 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.760929  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0325  rhodanese superfamily protein  41 
 
 
299 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.605661  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1204  rhodanese superfamily protein  41 
 
 
299 aa  188  8e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.521116  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3293  rhodanese superfamily protein  38.06 
 
 
287 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2233  rhodanese superfamily protein  40.43 
 
 
284 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2353  rhodanese superfamily protein  40.43 
 
 
284 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0478331  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>