More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1196 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1196  translation initiation factor IF-3  100 
 
 
173 aa  348  2e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.501518  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0207  translation initiation factor IF-3  71.1 
 
 
173 aa  250  6e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0803  translation initiation factor IF-3  72.51 
 
 
178 aa  249  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4267  translation initiation factor IF-3  70.41 
 
 
178 aa  242  2e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1937  translation initiation factor IF-3  69.82 
 
 
174 aa  242  2e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.413665  normal  0.0464847 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4232  translation initiation factor IF-3  71.18 
 
 
173 aa  241  3e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738998 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0641  translation initiation factor IF-3  69.71 
 
 
175 aa  241  4e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0129727 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0671  translation initiation factor IF-3  68.42 
 
 
192 aa  241  5e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.395911  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3158  translation initiation factor IF-3  71.18 
 
 
173 aa  240  7e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4532  translation initiation factor IF-3  69.82 
 
 
204 aa  240  9e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0069  translation initiation factor IF-3  67.65 
 
 
171 aa  237  6e-62  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.097761 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2109  translation initiation factor IF-3  69.71 
 
 
219 aa  237  8e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  2.73336e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4742  translation initiation factor IF-3  68.82 
 
 
176 aa  235  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.676759  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1612  translation initiation factor IF-3  69.41 
 
 
173 aa  234  3e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1906  translation initiation factor IF-3  69.41 
 
 
173 aa  233  9e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1624  translation initiation factor IF-3  69.41 
 
 
176 aa  233  9e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0101313 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0077  translation initiation factor IF-3  65.29 
 
 
171 aa  231  3e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.646828  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0123  translation initiation factor 3  74.71 
 
 
201 aa  231  3e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.228507  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1341  translation initiation factor IF-3  62.57 
 
 
173 aa  227  5e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2150  translation initiation factor IF-3  63.01 
 
 
173 aa  226  9e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235978  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0041  translation initiation factor IF-3  65.5 
 
 
192 aa  226  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0218  translation initiation factor IF-3  62.07 
 
 
200 aa  222  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0200  translation initiation factor IF-3  70.86 
 
 
151 aa  221  4e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2538  translation initiation factor IF-3  61.85 
 
 
173 aa  219  1e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.838605  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2747  translation initiation factor IF-3  63.25 
 
 
169 aa  217  8e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.128829 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3488  translation initiation factor 3  65.9 
 
 
173 aa  214  3e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1149  translation initiation factor IF-3  59.3 
 
 
202 aa  213  1e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1937  translation initiation factor IF-3  60.57 
 
 
194 aa  212  2e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0510424  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0588  translation initiation factor IF-3  60.57 
 
 
194 aa  212  2e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.954262  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0333  translation initiation factor IF-3  59.77 
 
 
194 aa  211  4e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.392305  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2032  translation initiation factor IF-3  77.86 
 
 
134 aa  209  1e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2117  translation initiation factor IF-3  77.86 
 
 
134 aa  209  1e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0065  translation initiation factor IF-3  70.63 
 
 
145 aa  208  2e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3483  translation initiation factor IF-3  75.57 
 
 
132 aa  208  3e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113137  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0265  translation initiation factor IF-3  59.76 
 
 
173 aa  205  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.910814  normal  0.332641 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3024  translation initiation factor IF-3  59.51 
 
 
173 aa  204  5e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0168  translation initiation factor IF-3  74.81 
 
 
132 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1319  translation initiation factor IF-3  57.71 
 
 
190 aa  201  4e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0341  initiation factor 3  72.52 
 
 
132 aa  197  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2769  translation initiation factor IF-3  56.02 
 
 
178 aa  192  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2642  translation initiation factor IF-3  56.02 
 
 
178 aa  192  2e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0412  translation initiation factor IF-3  64.08 
 
 
144 aa  190  7e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.601649  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1976  translation initiation factor IF-3  54.6 
 
 
173 aa  189  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1763  translation initiation factor 3  65.41 
 
 
137 aa  189  2e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1578  translation initiation factor IF-3  52.76 
 
 
178 aa  187  4e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4144  translation initiation factor IF-3  54.6 
 
 
227 aa  186  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0415962  hitchhiker  0.000102893 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2613  translation initiation factor IF-3  57.41 
 
 
172 aa  184  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0154974  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2676  translation initiation factor 3  66.15 
 
 
137 aa  184  6e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.233816 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1383  translation initiation factor IF-3  52.76 
 
 
187 aa  184  6e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  1.11233e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2242  translation initiation factor IF-3  57.41 
 
 
166 aa  183  9e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  4.66118e-05  hitchhiker  0.00531509 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2804  translation initiation factor IF-3  52.6 
 
 
180 aa  182  2e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2400  translation initiation factor IF-3  52.47 
 
 
164 aa  182  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00646191  normal  0.390668 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1090  hypothetical protein  49.69 
 
 
179 aa  182  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  1.29093e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0364  translation initiation factor 3  52.07 
 
 
182 aa  181  4e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  2.97976e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01384  translation initiation factor IF-3  55.77 
 
 
159 aa  181  4e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1032  translation initiation factor IF-3  52.63 
 
 
238 aa  181  4e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82167  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2218  translation initiation factor IF-3  54.6 
 
 
182 aa  181  5e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  2.64089e-06  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0488  translation initiation factor IF-3  54.97 
 
 
184 aa  181  6e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.270402  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1713  translation initiation factor IF-3  53.64 
 
 
156 aa  181  7e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.225755  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1736  translation initiation factor IF-3  53.64 
 
 
156 aa  181  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1538  translation initiation factor IF-3  53.64 
 
 
156 aa  181  7e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2594  translation initiation factor IF-3  53.64 
 
 
156 aa  181  7e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1891  translation initiation factor IF-3  53.64 
 
 
156 aa  181  7e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.210834  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1095  translation initiation factor IF-3  53.64 
 
 
156 aa  181  7e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.171775  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0964  translation initiation factor IF-3  53.64 
 
 
156 aa  180  8e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.698743  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0201  translation initiation factor IF-3  53.64 
 
 
156 aa  180  8e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00116998  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1434  translation initiation factor IF-3  52.05 
 
 
225 aa  180  9e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0842222  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0534  translation initiation factor IF-3  55.63 
 
 
165 aa  180  1e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  7.58155e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1800  translation initiation factor 3  54.94 
 
 
163 aa  179  1e-44  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00939294  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2042  translation initiation factor IF-3  53.37 
 
 
199 aa  179  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0708817  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05720  translation initiation factor 3  50.92 
 
 
207 aa  179  2e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  1.88671e-05  normal  0.0169059 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0471  translation initiation factor IF-3  54.88 
 
 
171 aa  179  2e-44  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.973019  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0830  translation initiation factor IF-3  53.7 
 
 
169 aa  179  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.124767  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0044  translation initiation factor IF-3  50.62 
 
 
173 aa  178  3e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1008  translation initiation factor 3  57.62 
 
 
155 aa  178  4e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0442083  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3480  translation initiation factor IF-3  53.7 
 
 
183 aa  177  6e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0422454  normal  0.0155112 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0215  translation initiation factor IF-3  53.09 
 
 
198 aa  177  6e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.62616e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3224  translation initiation factor IF-3  53.7 
 
 
183 aa  177  6e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.51494 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1968  translation initiation factor IF-3  53.7 
 
 
183 aa  177  6e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00361564  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2466  translation initiation factor IF-3  53.7 
 
 
177 aa  177  7e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00240261  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1557  translation initiation factor IF-3  52.32 
 
 
156 aa  177  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1778  translation initiation factor IF-3  52.32 
 
 
156 aa  176  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.843423 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2459  translation initiation factor 3  53.7 
 
 
243 aa  176  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3163  translation initiation factor IF-3  53.29 
 
 
252 aa  176  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0170352  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0994  translation initiation factor IF-3  52.32 
 
 
156 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1476  translation initiation factor IF-3  52.32 
 
 
156 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348442  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4616  translation initiation factor 3  52.32 
 
 
156 aa  176  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00507113  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6087  Translation initiation factor 3 (IF-3)-like protein  50.6 
 
 
222 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897729  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15200  translation initiation factor 3  51.53 
 
 
197 aa  176  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  2.8162e-05  normal  0.0802518 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1360  translation initiation factor IF-3  52.32 
 
 
156 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.485624  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1161  translation initiation factor 3  53.64 
 
 
154 aa  175  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.930143 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1453  translation initiation factor IF-3  52.32 
 
 
156 aa  176  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0525841  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1400  translation initiation factor IF-3  52.32 
 
 
156 aa  176  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0821028  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2908  translation initiation factor IF-3  52.69 
 
 
185 aa  175  3e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1372  translation initiation factor 3  52.98 
 
 
156 aa  175  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0696405  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5473  translation initiation factor IF-3  50.6 
 
 
204 aa  174  4e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1233  translation initiation factor IF-3  52.15 
 
 
198 aa  174  4e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  1.35112e-07  normal  0.0984034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4639  translation initiation factor IF-3  49.11 
 
 
219 aa  175  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  4.86529e-06  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1924  translation initiation factor IF-3  56.71 
 
 
180 aa  174  6e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  6.76935e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01676  hypothetical protein  56.71 
 
 
180 aa  174  6e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0101258  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>