50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1101 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1101  putative transposase  100 
 
 		 53 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.32913 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1875  Integrase catalytic region  75 
 
 		 355 aa  87  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0702445 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3258  Integrase catalytic region  75 
 
 		 330 aa  86.7  9e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2721  Integrase catalytic region  75 
 
 		 330 aa  86.7  9e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2422  Integrase catalytic region  75 
 
 		 330 aa  86.7  9e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0692  Integrase catalytic region  75 
 
 		 330 aa  86.7  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229145  normal  0.133209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1668  Integrase catalytic region  75 
 
 		 330 aa  86.7  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  76.92 
 
 		 321 aa  86.3  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2291  Integrase catalytic region  75 
 
 		 348 aa  86.7  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.152349 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  75 
 
 		 316 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  75 
 
 		 316 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  75 
 
 		 316 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  75 
 
 		 316 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  75 
 
 		 316 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  75 
 
 		 316 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  75 
 
 		 316 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  75 
 
 		 316 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3472  hypothetical protein  73.58 
 
 		 170 aa  84  7e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.119399 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2839  integrase, catalytic region  75 
 
 		 153 aa  83.6  9e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  73.58 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  73.58 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  73.58 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  73.58 
 
 		 319 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  75 
 
 		 327 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5325  hypothetical protein  71.15 
 
 		 197 aa  80.5  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.969651  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0481  integrase catalytic region  65.38 
 
 		 463 aa  78.2  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0252  transposase (class I)  75 
 
 		 83 aa  74.7  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5447  Integrase catalytic region  68 
 
 		 277 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.681137  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0443  integrase, catalytic region  59.62 
 
 		 83 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.818125 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  78.05 
 
 		 329 aa  68.2  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  78.05 
 
 		 329 aa  68.2  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0838  integrase, catalytic region  78.05 
 
 		 286 aa  67.8  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204021  hitchhiker  0.00436144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2850  integrase, catalytic region  78.05 
 
 		 329 aa  67.8  0.00000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0952  hypothetical protein  60 
 
 		 320 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3767  hypothetical protein  76.92 
 
 		 128 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0176  transposase, putative  52.94 
 
 		 320 aa  65.1  0.0000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0554  hypothetical protein  54 
 
 		 314 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    unclonable  0.000000000279647 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1273  hypothetical protein  54 
 
 		 314 aa  60.8  0.000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0999856 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33450  integrase, catalytic core  48.08 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3372  integrase catalytic region  49.02 
 
 		 321 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0224  integrase catalytic subunit  52 
 
 		 316 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1128  integrase catalytic subunit  47.06 
 
 		 280 aa  52  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1054  integrase catalytic subunit  52 
 
 		 316 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.161609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1353  integrase catalytic subunit  52 
 
 		 316 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.4232  normal  0.0729626 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1767  integrase catalytic subunit  52 
 
 		 316 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.417793 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1780  integrase catalytic subunit  52 
 
 		 316 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0228632  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2400  integrase catalytic subunit  52 
 
 		 316 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.61618  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3549  integrase catalytic region  42.31 
 
 		 216 aa  48.5  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.032093 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0529  integrase, catalytic core  52.63 
 
 		 259 aa  46.2  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1176  hypothetical protein  60.61 
 
 		 284 aa  45.4  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.118975 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>