53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0988 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0988  hypothetical protein  100 
 
 		 373 aa  708    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.4586  normal  0.292703 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1749  hypothetical protein  67.9 
 
 		 248 aa  106  8e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.116456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0140  hypothetical protein  55.68 
 
 		 144 aa  103  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.699616  normal  0.0783474 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0916  hypothetical protein  33.97 
 
 		 431 aa  93.2  6e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0648  hypothetical protein  54.65 
 
 		 250 aa  92.4  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.381753  normal  0.239777 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0953  hypothetical protein  35.83 
 
 		 437 aa  92  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0203333  normal  0.0141438 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1016  hypothetical protein  64.71 
 
 		 143 aa  91.3  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.595754  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4750  hypothetical protein  39.15 
 
 		 347 aa  85.9  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.139905  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3953  hypothetical protein  64.41 
 
 		 294 aa  84.7  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129497  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3814  hypothetical protein  66.1 
 
 		 252 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.180597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2500  hypothetical protein  66.1 
 
 		 219 aa  84.3  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.121247 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3522  hypothetical protein  66.1 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00855265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2621  hypothetical protein  62.71 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.335901 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0892  hypothetical protein  36.44 
 
 		 425 aa  83.6  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.70017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1038  hypothetical protein  60.94 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0341013  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2997  hypothetical protein  56.34 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.247811  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0752  hypothetical protein  58.9 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0183997  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1798  hypothetical protein  64.91 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.184582  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0095  hypothetical protein  63.49 
 
 		 241 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.201224 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0071  hypothetical protein  66.1 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.878621  normal  0.643653 
 
 
-
 
NC_004310  BR1865  hypothetical protein  57.81 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0375  hypothetical protein  63.49 
 
 		 231 aa  80.9  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.579408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0510  hypothetical protein  63.49 
 
 		 272 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.471576  normal  0.0447134 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0824  hypothetical protein  55.7 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.926799 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0468  hypothetical protein  63.49 
 
 		 240 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22456  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0612  hypothetical protein  61.9 
 
 		 231 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0968098  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0139  hypothetical protein  37.91 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0903001  normal  0.118863 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7607  hypothetical protein  66.1 
 
 		 284 aa  80.1  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00689527  normal  0.216662 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1808  hypothetical protein  50.59 
 
 		 224 aa  79  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.292683 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1908  hypothetical protein  53.75 
 
 		 345 aa  78.6  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.344277 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0943  hypothetical protein  60 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0114  hypothetical protein  36 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1731  hypothetical protein  50.59 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0545738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6078  hypothetical protein  66.07 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1115  hypothetical protein  66.07 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0428943 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1550  hypothetical protein  66.07 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0360168  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0247  hypothetical protein  56.14 
 
 		 216 aa  74.7  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0896  hypothetical protein  62.5 
 
 		 262 aa  73.9  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.0019435  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4170  RNA-binding S4 domain protein  59.42 
 
 		 674 aa  62  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2712  hypothetical protein  50.77 
 
 		 273 aa  60.5  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2528  hypothetical protein  60.47 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0286  hypothetical protein  58.14 
 
 		 340 aa  55.5  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3861  RNA-binding S4 domain-containing protein  56.52 
 
 		 669 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.227341 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3676  translation initiation factor IF-2  39.6 
 
 		 971 aa  50.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156109  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1356  RNA-binding S4 domain protein  47.47 
 
 		 736 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.284872  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1420  hypothetical protein  56.9 
 
 		 346 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0186857  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0590  DEAD/DEAH box helicase-like  36.84 
 
 		 710 aa  47  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331406 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0907  pseudouridine synthase Rsu  50.62 
 
 		 743 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3171  pseudouridine synthase, Rsu  45.86 
 
 		 687 aa  45.8  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.601748  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1221  hypothetical protein  25 
 
 		 623 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0477  RNA-binding S4 domain protein  39.33 
 
 		 689 aa  43.9  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.53583  normal  0.544761 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1701  putative pseudouridine synthase, Rsu  67.57 
 
 		 690 aa  43.5  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3714  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.81 
 
 		 634 aa  42.7  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00250632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>