239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0882 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0882  pepF/M3 family oligoendopeptidase  100 
 
 
608 aa  1222    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83984  normal  0.332504 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2052  pepF/M3 family oligoendopeptidase  48.64 
 
 
614 aa  537  1e-151  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841739  hitchhiker  0.00000309933 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2730  pepF/M3 family oligoendopeptidase  47.99 
 
 
616 aa  534  1e-150  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797581  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0370  pepF/M3 family oligoendopeptidase  47.2 
 
 
622 aa  526  1e-148  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1225  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  46.6 
 
 
626 aa  525  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100343  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2070  pepF/M3 family oligoendopeptidase  45.84 
 
 
634 aa  521  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.024965  normal  0.33011 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0213  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  47.35 
 
 
616 aa  521  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227297  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3702  oligoendopeptidase F  47.55 
 
 
619 aa  520  1e-146  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3597  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  45.67 
 
 
617 aa  520  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.794644  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2576  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  46.91 
 
 
620 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.855226 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3148  pepF/M3 family oligoendopeptidase  47.19 
 
 
616 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629046 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0076  oligoendopeptidase F  46.62 
 
 
620 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2981  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  46.78 
 
 
625 aa  514  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.947222 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0081  oligoendopeptidase F  46.45 
 
 
620 aa  514  1e-144  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0993  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  47.11 
 
 
625 aa  512  1e-144  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1431  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  46.19 
 
 
610 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.838587  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6862  putative oligoendopeptidase F  46.02 
 
 
664 aa  513  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916639  normal  0.20394 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2877  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  46.35 
 
 
601 aa  509  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0929363  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3296  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  45.5 
 
 
617 aa  511  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1411  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  46.02 
 
 
632 aa  508  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.249086  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2754  pepF/M3 family oligoendopeptidase  46.61 
 
 
625 aa  510  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4260  pepF/M3 family oligoendopeptidase  45.93 
 
 
620 aa  509  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3392  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  45.62 
 
 
607 aa  508  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.935472  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3974  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  44.72 
 
 
626 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.221188  normal  0.896374 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2803  pepF/M3 family oligoendopeptidase  46.61 
 
 
623 aa  504  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121144  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2412  oligoendopeptidase F  47.88 
 
 
606 aa  501  1e-140  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0632065  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2192  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  46.21 
 
 
597 aa  501  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246068  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1075  pepF/M3 family oligoendopeptidase  47.88 
 
 
606 aa  501  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1570  pepF/M3 family oligoendopeptidase  47.55 
 
 
606 aa  500  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.713222  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1482  pepF/M3 family oligoendopeptidase  47.3 
 
 
615 aa  501  1e-140  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2684  pepF/M3 family oligoendopeptidase  45.33 
 
 
627 aa  498  1e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.667149 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1832  pepF/M3 family oligoendopeptidase  46.61 
 
 
620 aa  495  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4665  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  45.18 
 
 
638 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0569  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  44.29 
 
 
606 aa  487  1e-136  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0425519  hitchhiker  0.00000722694 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2603  oligoendopeptidase  45.53 
 
 
611 aa  475  1e-132  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0093862 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0329  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  45.05 
 
 
615 aa  467  9.999999999999999e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0533  pepF/M3 family oligoendopeptidase  39.56 
 
 
589 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18439  normal  0.721981 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2299  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  37.23 
 
 
598 aa  364  3e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2674  oligoendopeptidase F, putative  37.23 
 
 
598 aa  364  3e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1896  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  38.87 
 
 
601 aa  345  2e-93  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0066  rhomboid family protein  34.21 
 
 
573 aa  343  4e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.411672  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4566  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  41.01 
 
 
607 aa  341  2.9999999999999998e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0554379  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1636  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  35.77 
 
 
573 aa  338  9.999999999999999e-92  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0701  putative oligoendopeptidase F  37.11 
 
 
571 aa  338  9.999999999999999e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0719  oligoendopeptidase F, putative  34.27 
 
 
569 aa  332  2e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.954418  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1054  oligoendopeptidase F  32.89 
 
 
573 aa  310  4e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2169  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  36.24 
 
 
601 aa  310  5e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1242  oligoendopeptidase F  31.44 
 
 
573 aa  309  1.0000000000000001e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.906065  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1117  oligoendopeptidase F  31.77 
 
 
572 aa  309  1.0000000000000001e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0623  oligoendopeptidase F  31.44 
 
 
573 aa  307  4.0000000000000004e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1105  peptidase  33.77 
 
 
566 aa  303  9e-81  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34179  predicted protein  35.78 
 
 
577 aa  296  7e-79  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.137613  normal  0.109742 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1993  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  33 
 
 
592 aa  290  5.0000000000000004e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000167694  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1382  pepF/M3 family oligoendopeptidase  33.61 
 
 
589 aa  286  9e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000209164  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1295  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  34.58 
 
 
612 aa  283  8.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104369  hitchhiker  0.000569902 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2055  pepF/M3 family oligoendopeptidase  34 
 
 
591 aa  278  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00862679  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2988  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  31.59 
 
 
588 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.68469e-23 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1295  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  32.4 
 
 
588 aa  266  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778267  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1873  oligoendopeptidase F  35.02 
 
 
596 aa  258  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.201769  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0884  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  31.17 
 
 
578 aa  245  1.9999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000022902  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2068  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  31.05 
 
 
603 aa  236  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1694  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  28.72 
 
 
584 aa  231  3e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1177  pepF/M3 family oligoendopeptidase  28.5 
 
 
590 aa  226  9e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3298  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.68 
 
 
582 aa  198  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2647  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  31.99 
 
 
584 aa  197  5.000000000000001e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00961781  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1211  oligoendopeptidase pepF/M3 family  31.6 
 
 
587 aa  196  1e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000802852  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003689  oligoendopeptidase F  27.78 
 
 
598 aa  191  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2001  oligoendopeptidase F, putative  28.48 
 
 
597 aa  189  1e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0875927  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1212  pepF/M3 family oligoendopeptidase  28.17 
 
 
586 aa  189  2e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0407734  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1167  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  27.57 
 
 
593 aa  183  6e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02130  oligopeptidase  27.29 
 
 
599 aa  182  1e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1817  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  25.88 
 
 
597 aa  174  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2626  oligoendopeptidase F  28.76 
 
 
618 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1998  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.73 
 
 
603 aa  173  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0738  oligoendopeptidase F  26.72 
 
 
609 aa  171  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1729  oligopeptidase F  28.89 
 
 
593 aa  169  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0341754  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3273  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.03 
 
 
603 aa  169  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.474589 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4682  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  27.67 
 
 
606 aa  167  6.9999999999999995e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0130  Oligopeptidase F  26.04 
 
 
593 aa  164  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1422  oligoendopeptidase F  24.96 
 
 
596 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0811423  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1255  oligoendopeptidase F  25.29 
 
 
600 aa  163  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012526 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1169  oligoendopeptidase F  29.72 
 
 
644 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.325773 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2002  oligoendopeptidase F  26.06 
 
 
594 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000655164  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0099  oligoendopeptidase F  26.97 
 
 
619 aa  157  5.0000000000000005e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.893555  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08170  Oligoendopeptidase F  24.67 
 
 
598 aa  156  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1902  oligoendopeptidase F  32.16 
 
 
649 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6864  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  30.63 
 
 
612 aa  155  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176327 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1823  oligoendopeptidase F  31.89 
 
 
654 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2055  oligopeptidase F  28.22 
 
 
646 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.443818  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1955  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  31.66 
 
 
607 aa  150  5e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3699  oligoendopeptidase F  27.53 
 
 
597 aa  150  9e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0856  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  28.6 
 
 
598 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1706  oligoendopeptidase F  23.76 
 
 
599 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.615745  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0490  oligoendopeptidase F  26.87 
 
 
603 aa  146  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1439  oligoendopeptidase F  23.57 
 
 
599 aa  144  6e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0281  oligoendopeptidase F  26.98 
 
 
600 aa  142  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.651782  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1160  oligopeptidase F  26.26 
 
 
603 aa  142  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.167862  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1539  oligoendopeptidase F  24.75 
 
 
622 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2755  oligoendopeptidase F  24.33 
 
 
606 aa  140  6e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000210431  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0805  group B oligopeptidase PepB  24.95 
 
 
601 aa  140  7.999999999999999e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.036965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>