More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0865 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0865  OmpA/MotB domain-containing protein  100 
 
 
409 aa  822    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.285654 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4662  OmpA/MotB domain-containing protein  62.71 
 
 
401 aa  408  1.0000000000000001e-112  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.287057  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1860  OmpA/MotB domain-containing protein  37.96 
 
 
359 aa  159  1e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0437  OmpA family protein  30.37 
 
 
340 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0802247  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0174  OmpA/MotB domain-containing protein  32.47 
 
 
361 aa  108  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1649  OmpA/MotB domain protein  31.18 
 
 
380 aa  100  4e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0173  OmpA/MotB domain-containing protein  31.69 
 
 
364 aa  99  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1578  OmpA/MotB  29.49 
 
 
363 aa  97.4  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.00000000110923  unclonable  0.000000219993 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1988  OmpA/MotB  31.17 
 
 
373 aa  95.1  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.000257198  normal  0.0360376 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2051  OmpA/MotB domain-containing protein  49.02 
 
 
277 aa  92  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0438316  hitchhiker  0.0000220927 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3134  OmpA/MotB  30.64 
 
 
357 aa  87.4  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.08024  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0404  OmpA/MotB domain protein  27.27 
 
 
378 aa  87.4  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.735071 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3597  OmpA/MotB  40.16 
 
 
193 aa  84  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3328  OmpA/MotB  41.23 
 
 
273 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1423  OmpA/MotB domain-containing protein  36.3 
 
 
244 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0509995  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  36.09 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2705  OmpA/MotB domain-containing protein  27.62 
 
 
324 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4671  OmpA/MotB domain protein  39.83 
 
 
205 aa  77.8  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2085  OmpA/MotB domain protein  39.25 
 
 
204 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.370022 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0908  OmpA/MotB family outer membrane protein  40.74 
 
 
172 aa  76.6  0.0000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.975322  normal  0.906995 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1819  outer membrane protein A  30.87 
 
 
367 aa  75.9  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00533384  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3719  OmpA/MotB domain-containing protein  39.25 
 
 
207 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.497311  normal  0.271162 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  39.22 
 
 
266 aa  75.1  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4294  OmpA/MotB domain-containing protein  36.22 
 
 
239 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0720  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36.36 
 
 
658 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000202106  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2359  peptidoglycan-associated lipoprotein  32.21 
 
 
170 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1992  OmpA/MotB  36.45 
 
 
195 aa  74.3  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.779383  normal  0.501686 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3514  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.72 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000685011  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4718  OmpA/MotB domain-containing protein  39.22 
 
 
219 aa  73.6  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.790715 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1220  OmpA/MotB  42.59 
 
 
231 aa  73.9  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1854  OmpA/MotB  38.78 
 
 
177 aa  73.2  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1509  OmpA/MotB  39.81 
 
 
172 aa  73.2  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.152591  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1122  OmpA/MotB domain protein  37.5 
 
 
264 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0205488  hitchhiker  0.00000560377 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5888  peptidoglycan-associated lipoprotein  36.63 
 
 
163 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.471283  normal  0.347557 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4460  peptidoglycan-associated lipoprotein  37.6 
 
 
168 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3949  OmpA/MotB  36.63 
 
 
163 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.595149  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4417  OmpA/MotB domain-containing protein  36.63 
 
 
163 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.157406  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2463  OmpA/MotB domain-containing protein  38.24 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.249955 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4309  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.64 
 
 
163 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0691285  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1397  OmpA/MotB domain protein  38.24 
 
 
218 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2093  OmpA/MotB  37.25 
 
 
177 aa  71.2  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.366821  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1985  OmpA/MotB  37.86 
 
 
180 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.188603  normal  0.337771 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3849  OmpA/MotB domain-containing protein  35.64 
 
 
163 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4513  OmpA domain-containing protein  31.17 
 
 
341 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.17802  normal  0.652887 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01565  outer membrane protein P6  38.1 
 
 
148 aa  70.9  0.00000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2974  peptidoglycan-associated lipoprotein  39.39 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.113547  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1545  OmpA/MotB family outer membrane protein  35.64 
 
 
163 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.342429  normal  0.720458 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0785  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  35.29 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000639422  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  34.85 
 
 
237 aa  70.1  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0114  outer membrane protein A  26.76 
 
 
342 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.394411  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0908  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  35.29 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00670429  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3541  OmpA/MotB  38.06 
 
 
193 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.09094e-16  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0876  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  35.29 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0023901  normal  0.278188 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0845  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  35.29 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00372041  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0812  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  35.29 
 
 
174 aa  70.1  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.059882  normal  0.756228 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2901  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.19 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000125837  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1720  OmpA/MotB domain protein  40.17 
 
 
232 aa  70.1  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.969233  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1157  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.19 
 
 
168 aa  69.7  0.00000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1901  OmpA/MotB domain protein  44.94 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000028398  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2049  OmpA domain-containing protein  37.86 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3405  OmpA domain-containing protein  37.14 
 
 
181 aa  69.7  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.725588 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0736  peptidoglycan-associated lipoprotein precursor  35.64 
 
 
172 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.947366 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1406  OmpA/MotB domain protein  36.11 
 
 
194 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.975063 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0137  OmpA/MotB domain protein  42.45 
 
 
560 aa  69.3  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  37.25 
 
 
219 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0342  thrombospondin type 3 repeat-containing OmpA/MotB protein  40.19 
 
 
447 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000185785  hitchhiker  3.89536e-20 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1689  OmpA family protein  34.71 
 
 
352 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.000000000195152  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1395  OmpA/MotB  32.38 
 
 
178 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000229219  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3118  OmpA/MotB domain-containing protein  32.31 
 
 
242 aa  69.3  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0113937 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00701  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  34.31 
 
 
173 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000036029  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2894  peptidoglycan-associated lipoprotein  34.31 
 
 
173 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.67676e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0694  immunoreactive 42 kDa antigen PG33  41.51 
 
 
380 aa  68.2  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    unclonable  0.0000000023367 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00690  hypothetical protein  34.31 
 
 
173 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000599147  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0844  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  34.31 
 
 
173 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000018572  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1398  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.27 
 
 
168 aa  68.6  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000375397  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2237  putative signal peptide protein  37.5 
 
 
219 aa  68.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.237192  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0795  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  34.31 
 
 
173 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.12965e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1239  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  34.31 
 
 
173 aa  68.6  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216334  normal  0.113587 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1980  peptidoglycan-associated lipoprotein  35.92 
 
 
180 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2867  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.27 
 
 
168 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.859200000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0770  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  34.31 
 
 
173 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156204  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0663  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  34.31 
 
 
173 aa  68.6  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000160388  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2955  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  36.27 
 
 
168 aa  68.2  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000883314  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2914  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  34.31 
 
 
173 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000121586  normal  0.464909 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1724  TonB box domain-containing protein  35.92 
 
 
180 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.036293 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0764  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  34.31 
 
 
173 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000105937  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0739  outer membrane fibronectin-binding protein  38.24 
 
 
337 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.306148  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  29.17 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0263  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein (outer membrane protein P6)  35.19 
 
 
135 aa  68.2  0.0000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000850084  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1584  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.98 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.904402  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3086  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  33.33 
 
 
169 aa  67.4  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000103923  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41570  major porin and structural outer membrane porin OprF precursor  30.06 
 
 
350 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000484221  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3529  outer membrane protein OprF precursor  30.06 
 
 
350 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1250  peptidoglycan-associated outer membrane lipoprotein  33.33 
 
 
169 aa  67.4  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000441417  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1572  OmpA/MotB  37.25 
 
 
212 aa  67.8  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1796  OmpA/MotB  36.27 
 
 
214 aa  67.8  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0221039  unclonable  0.00000303101 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1803  OmpA/MotB domain protein  32.26 
 
 
195 aa  67.4  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.188621  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3151  OmpA/MotB domain-containing protein  30.41 
 
 
243 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.857054  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1158  OmpA/MotB domain-containing protein  37.5 
 
 
239 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.112434  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0464  OmpA/MotB  42.22 
 
 
217 aa  67.4  0.0000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>