More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0789 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0789  50S ribosomal protein L10  100 
 
 		 172 aa  340  4e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2727  ribosomal protein L10  60.12 
 
 		 172 aa  203  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12165  normal  0.845294 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2697  50S ribosomal protein L10P  53.49 
 
 		 172 aa  183  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.561782  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3477  50S ribosomal protein L10  52.91 
 
 		 171 aa  180  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.232416  hitchhiker  0.0000717521 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1954  50S ribosomal protein L10  54.07 
 
 		 174 aa  179  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262202  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1822  50S ribosomal protein L10  52.91 
 
 		 172 aa  177  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1345  50S ribosomal protein L10  53.49 
 
 		 172 aa  177  4.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0320244  normal  0.100348 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1701  50S ribosomal protein L10  52.84 
 
 		 171 aa  177  5.999999999999999e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.302531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1420  50S ribosomal protein L10  51.74 
 
 		 172 aa  177  9e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.291032 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1322  50S ribosomal protein L10  51.74 
 
 		 172 aa  175  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.850894  normal  0.161771 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3362  50S ribosomal protein L10  52.91 
 
 		 172 aa  173  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256068  normal  0.223881 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1821  50S ribosomal protein L10  50.58 
 
 		 172 aa  173  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0871653  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4497  50S ribosomal protein L10  52.33 
 
 		 172 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0976  50S ribosomal protein L10  51.16 
 
 		 195 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0194348 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2958  50S ribosomal protein L10  52.91 
 
 		 172 aa  171  5.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0648852 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0029  50S ribosomal protein L10  57.56 
 
 		 170 aa  171  5.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.167833  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1945  50S ribosomal protein L10  47.09 
 
 		 172 aa  169  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.137242  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1207  50S ribosomal protein L10  47.09 
 
 		 194 aa  167  6e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.347273  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3841  50S ribosomal protein L10  49.42 
 
 		 172 aa  167  8e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0158219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1898  50S ribosomal protein L10  51.5 
 
 		 175 aa  166  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0362  50S ribosomal protein L10  50.9 
 
 		 175 aa  165  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.656463 
 
 
-
 
NC_004310  BR1246  50S ribosomal protein L10  46.51 
 
 		 172 aa  165  2.9999999999999998e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.208748  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0569  50S ribosomal protein L10  46.51 
 
 		 172 aa  164  6.9999999999999995e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000818206  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3689  50S ribosomal protein L10  48.84 
 
 		 172 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1348  50S ribosomal protein L10  48.84 
 
 		 172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1529  50S ribosomal protein L10  48.84 
 
 		 172 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.908936  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3197  50S ribosomal protein L10  48.26 
 
 		 172 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.383116 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3866  ribosomal protein L10  54.34 
 
 		 171 aa  161  5.0000000000000005e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0292685 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5083  50S ribosomal protein L10  47.67 
 
 		 172 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614366  normal  0.894165 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4015  50S ribosomal protein L10  51.74 
 
 		 172 aa  159  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.866731  normal  0.631329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4384  50S ribosomal protein L10  51.74 
 
 		 172 aa  159  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.313613 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2283  50S ribosomal protein L10  47.67 
 
 		 172 aa  158  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0400383  normal  0.2116 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3460  50S ribosomal protein L10  47.67 
 
 		 172 aa  157  8e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1804  50S ribosomal protein L10P  45.56 
 
 		 171 aa  147  5e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.160084 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0232  50S ribosomal protein L10  41.42 
 
 		 172 aa  142  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0685965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  42.42 
 
 		 172 aa  138  3e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0745  50S ribosomal protein L10  43.02 
 
 		 171 aa  138  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00501407 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2544  50S ribosomal protein L10  42.44 
 
 		 171 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1701  50S ribosomal protein L10  41.86 
 
 		 171 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.653585  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0337  50S ribosomal protein L10  41.86 
 
 		 171 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.635722  normal  0.581622 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0351  50S ribosomal protein L10  41.86 
 
 		 171 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.703447 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0265  50S ribosomal protein L10  41.42 
 
 		 172 aa  123  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0566  50S ribosomal protein L10  42.69 
 
 		 170 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1059  50S ribosomal protein L10  38.01 
 
 		 174 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0531801  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3337  50S ribosomal protein L10  38.92 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000271161 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0924  50S ribosomal protein L10  38.92 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0317  50S ribosomal protein L10  36.69 
 
 		 173 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.146286  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0488  50S ribosomal protein L10  36.69 
 
 		 173 aa  107  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.169718  hitchhiker  0.00000169108 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  39.47 
 
 		 176 aa  105  3e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0671  50S ribosomal protein L10  40.12 
 
 		 174 aa  105  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1927  ribosomal protein L10  38.15 
 
 		 176 aa  105  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0948645  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  36.59 
 
 		 175 aa  105  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  36.36 
 
 		 172 aa  104  7e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  34.94 
 
 		 174 aa  103  8e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0270  50S ribosomal protein L10  37.57 
 
 		 174 aa  103  9e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.247547  hitchhiker  0.00145059 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  35 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  38.41 
 
 		 170 aa  103  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4318  50S ribosomal protein L10  36.14 
 
 		 187 aa  102  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.561909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  40.38 
 
 		 174 aa  102  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0617  50S ribosomal protein L10  37.87 
 
 		 174 aa  101  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000383704 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2223  50S ribosomal protein L10  34.94 
 
 		 174 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00194446 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  37.72 
 
 		 173 aa  100  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2865  50S ribosomal protein L10  37.72 
 
 		 174 aa  99.4  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161934  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3347  50S ribosomal protein L10  39.16 
 
 		 167 aa  98.6  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.862427  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  33.53 
 
 		 178 aa  99  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  35.2 
 
 		 179 aa  98.2  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0586  50S ribosomal protein L10  42.04 
 
 		 177 aa  98.6  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1106  ribosomal protein L10  37.14 
 
 		 176 aa  98.6  4e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0567771  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  35.2 
 
 		 179 aa  98.2  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3642  50S ribosomal protein L10  39.87 
 
 		 183 aa  97.8  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.279713 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1956  ribosomal protein L10  31.93 
 
 		 174 aa  97.4  9e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3328  50S ribosomal protein L10  34.94 
 
 		 186 aa  97.4  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.211537 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2361  50S ribosomal protein L10  34.94 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10664  50S ribosomal protein L10  38.51 
 
 		 178 aa  97.1  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.50048e-25  normal  0.41253 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  39.18 
 
 		 174 aa  96.7  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0692  50S ribosomal protein L10  36.53 
 
 		 172 aa  96.3  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112903  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1590  50S ribosomal protein L10  35.54 
 
 		 174 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2273  50S ribosomal protein L10  34.94 
 
 		 174 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  37.91 
 
 		 166 aa  96.3  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3453  50S ribosomal protein L10  34.18 
 
 		 174 aa  95.1  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0925685  normal  0.446601 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0757  50S ribosomal protein L10  31.68 
 
 		 174 aa  95.1  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3336  50S ribosomal protein L10  37.75 
 
 		 173 aa  95.1  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  34.73 
 
 		 179 aa  95.1  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  40 
 
 		 166 aa  94.7  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  33.77 
 
 		 165 aa  94.7  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2469  50S ribosomal protein L10  36.75 
 
 		 175 aa  94.4  7e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.851244  normal  0.156602 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3935  50S ribosomal protein L10  39.51 
 
 		 181 aa  94.4  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.193843  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0385  50S ribosomal protein L10  35.23 
 
 		 177 aa  94  9e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0360  50S ribosomal protein L10  35.23 
 
 		 177 aa  94  9e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  33.77 
 
 		 166 aa  94  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2783  50S ribosomal protein L10  38.19 
 
 		 172 aa  94  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00189787  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  33.77 
 
 		 166 aa  94  9e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3594  50S ribosomal protein L10  39.1 
 
 		 178 aa  93.6  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1547  50S ribosomal protein L10  38.56 
 
 		 173 aa  93.6  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.834427 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  38.6 
 
 		 203 aa  92.4  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  33.12 
 
 		 165 aa  93.2  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  37.65 
 
 		 174 aa  93.2  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4444  50S ribosomal protein L10  37.97 
 
 		 176 aa  92  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.651473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  38.01 
 
 		 184 aa  92  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0297  50S ribosomal protein L10  38.95 
 
 		 172 aa  91.7  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>