More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0744 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0744  CheW protein  100 
 
 
155 aa  305  1.0000000000000001e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0637  CheW protein  48.89 
 
 
150 aa  139  9.999999999999999e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.424922  normal  0.132097 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0280  CheW protein  42.95 
 
 
155 aa  123  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.128089  normal  0.922662 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  42.28 
 
 
155 aa  121  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0236  putative CheW protein  43.23 
 
 
158 aa  120  7e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.270011 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1445  CheW protein  45.07 
 
 
161 aa  120  8e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2836  CheW protein  40.41 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0103385 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  41.61 
 
 
155 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2575  CheW protein  40.41 
 
 
156 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.256512  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2435  putative chemotaxis scaffold protein, CheW1  44.14 
 
 
152 aa  116  9e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.608913  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1099  putative CheW protein  44.14 
 
 
152 aa  116  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2050  putative CheW protein  39.73 
 
 
154 aa  115  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.143061  normal  0.348957 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3624  CheW protein  45 
 
 
159 aa  115  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0874566 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2709  putative CheW protein  44.37 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4076  chemotaxis protein  40.27 
 
 
155 aa  113  7.999999999999999e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2861  chemotaxis protein  38.1 
 
 
154 aa  111  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.952149  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1795  putative CheW protein  45.19 
 
 
152 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2892  putative CheW protein  38.73 
 
 
159 aa  108  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.953703 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3631  CheW protein  36.49 
 
 
158 aa  104  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.287941 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4092  chemotaxis protein  38.13 
 
 
159 aa  104  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.410589  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3920  CheW protein  36.49 
 
 
158 aa  104  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2840  CheW protein  39.71 
 
 
155 aa  103  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.437722  normal  0.122347 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5555  chemotaxis protein  36.67 
 
 
157 aa  100  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  37.18 
 
 
163 aa  100  8e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  31.17 
 
 
165 aa  99.8  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  30.52 
 
 
170 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  30.52 
 
 
164 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  30.52 
 
 
164 aa  99.4  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  31.08 
 
 
170 aa  98.6  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  31.08 
 
 
170 aa  98.6  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  40 
 
 
160 aa  97.1  8e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.08 
 
 
170 aa  96.7  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  30.41 
 
 
170 aa  95.5  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  32 
 
 
165 aa  92.8  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  36.71 
 
 
164 aa  91.7  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  33.77 
 
 
165 aa  91.3  4e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  33.77 
 
 
165 aa  91.3  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  37.41 
 
 
164 aa  91.7  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.81 
 
 
164 aa  90.9  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  31.21 
 
 
160 aa  90.9  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  36.42 
 
 
185 aa  90.9  6e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  34.81 
 
 
164 aa  90.9  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  34.81 
 
 
164 aa  90.9  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  34.81 
 
 
164 aa  90.9  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  34.81 
 
 
164 aa  90.5  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  35.71 
 
 
183 aa  90.5  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  36.96 
 
 
165 aa  90.1  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  34.81 
 
 
164 aa  89.4  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  34.81 
 
 
164 aa  89.4  1e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  34.81 
 
 
164 aa  89.4  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  32.87 
 
 
161 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2144  chemotaxis protein cheW  35.82 
 
 
175 aa  90.1  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  34.81 
 
 
164 aa  89.4  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2609  chemotaxis protein  33.58 
 
 
157 aa  89.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112886  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3205  CheW protein  35.92 
 
 
162 aa  89.7  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.200572  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  36.13 
 
 
163 aa  89.7  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.46 
 
 
174 aa  89.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  36.36 
 
 
187 aa  89.4  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  36.76 
 
 
163 aa  88.6  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  35.81 
 
 
205 aa  88.6  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  33.81 
 
 
158 aa  88.2  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1560  putative CheW protein  35.07 
 
 
146 aa  88.6  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.918027  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  35.66 
 
 
161 aa  88.6  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  34.18 
 
 
164 aa  88.6  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  35.26 
 
 
164 aa  88.6  3e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  34.04 
 
 
162 aa  88.2  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0784  CheW-like protein  34.44 
 
 
179 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.883745 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2154  putative CheW protein  31.88 
 
 
139 aa  87.8  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4187  CheW protein  31.82 
 
 
171 aa  87.8  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.370753  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  34.75 
 
 
163 aa  87.8  5e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  34.69 
 
 
163 aa  87.8  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  35.25 
 
 
164 aa  87.4  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  33.55 
 
 
159 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  35.25 
 
 
164 aa  87.4  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  30.34 
 
 
174 aa  87.4  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  33.55 
 
 
159 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3496  biotin synthase  35.51 
 
 
179 aa  87.4  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.296204  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  33.56 
 
 
164 aa  87  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0165  CheW protein  34.53 
 
 
183 aa  87  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  31.34 
 
 
165 aa  87  8e-17  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  34.04 
 
 
161 aa  87  9e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  31.91 
 
 
164 aa  87  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  30.82 
 
 
161 aa  86.3  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  36.36 
 
 
163 aa  87  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  35.46 
 
 
167 aa  86.3  1e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  34.29 
 
 
165 aa  85.5  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  29.79 
 
 
174 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  36.44 
 
 
158 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  27.63 
 
 
177 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0206  CheW domain protein  31.91 
 
 
164 aa  85.9  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00161643  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  27.63 
 
 
171 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  38.31 
 
 
164 aa  85.5  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  27.45 
 
 
171 aa  85.9  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  27.63 
 
 
177 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  33.33 
 
 
159 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  37.04 
 
 
147 aa  85.5  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  38.74 
 
 
163 aa  84.7  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  30.46 
 
 
163 aa  84.7  4e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  30.5 
 
 
159 aa  84.7  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  38.89 
 
 
158 aa  84.7  5e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>