148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0650 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
337 aa  672    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.349018  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.75 
 
 
340 aa  369  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.895804 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.33 
 
 
318 aa  352  5.9999999999999994e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.016337 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.33 
 
 
318 aa  351  1e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1636  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.03 
 
 
324 aa  342  7e-93  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0710053 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2727  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.7 
 
 
340 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430894  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2988  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.34 
 
 
340 aa  328  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.865432  normal  0.0888549 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.76 
 
 
326 aa  325  5e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93932  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4696  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.62 
 
 
326 aa  325  5e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3335  hypothetical protein  54.75 
 
 
318 aa  323  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.78 
 
 
336 aa  321  9.000000000000001e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316364  hitchhiker  0.00353615 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.96 
 
 
327 aa  320  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3144  hypothetical protein  51.2 
 
 
370 aa  316  5e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.428885  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.88 
 
 
325 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.88 
 
 
325 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5493  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.88 
 
 
325 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.299821 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.7 
 
 
352 aa  308  9e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0746307  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1458  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.69 
 
 
326 aa  301  1e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.780601  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0998  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  53.44 
 
 
333 aa  296  5e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2723  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  53.29 
 
 
345 aa  295  8e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2579  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  53.29 
 
 
345 aa  295  8e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62087  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0189  hypothetical protein  53.29 
 
 
332 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0302861  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1362  hypothetical protein  53.29 
 
 
345 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169729  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1558  hypothetical protein  53.29 
 
 
345 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0217  hypothetical protein  53.29 
 
 
345 aa  294  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644245  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.72 
 
 
316 aa  282  5.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  52.92 
 
 
338 aa  268  7e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.678603 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  40.25 
 
 
335 aa  199  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.312033  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  60.62 
 
 
162 aa  182  6e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
287 aa  157  2e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.49 
 
 
312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.41 
 
 
321 aa  109  5e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.57 
 
 
312 aa  108  2e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1987  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31 
 
 
328 aa  99.8  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.17 
 
 
329 aa  96.7  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535465  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3608  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.64 
 
 
306 aa  93.2  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5665  NmrA-like protein/nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.19 
 
 
324 aa  90.5  4e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.783073 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1426  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.63 
 
 
316 aa  89  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 
309 aa  88.6  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.75 
 
 
307 aa  87  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.68 
 
 
321 aa  86.7  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.42 
 
 
332 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.377476  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.63 
 
 
329 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0046  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.56 
 
 
318 aa  84.7  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.582921 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.29 
 
 
329 aa  83.6  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02815  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.9 
 
 
122 aa  82.8  0.000000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.69 
 
 
318 aa  82.4  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.06 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.860754 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2497  putative sugar dehydratase/epimerase  28.57 
 
 
332 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.814546 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.25 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.18 
 
 
315 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.036254  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.89 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354617  normal  0.0815308 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.51 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5344  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 
352 aa  76.3  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3195  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.84 
 
 
311 aa  75.5  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.67739  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.66 
 
 
321 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.57 
 
 
313 aa  73.2  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00141609  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 
304 aa  69.7  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0127633 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4306  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.92 
 
 
308 aa  68.9  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.244764  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.09 
 
 
317 aa  68.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0549387 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.96 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.79 
 
 
308 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504553  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.9 
 
 
319 aa  63.9  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.875328  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.84 
 
 
317 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0894753  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1559  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.48 
 
 
312 aa  63.2  0.000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00329554  normal  0.0368212 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.25 
 
 
307 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.517647  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.76 
 
 
301 aa  62.8  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.16 
 
 
314 aa  60.1  0.00000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1542  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.64 
 
 
300 aa  60.1  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.89 
 
 
307 aa  60.1  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0178809  hitchhiker  0.0040496 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23000  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.52 
 
 
310 aa  59.7  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109037  normal  0.0324264 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2822  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.15 
 
 
314 aa  59.3  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.72 
 
 
304 aa  59.3  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1819  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.14 
 
 
343 aa  56.6  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000110086  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.85 
 
 
276 aa  56.2  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0341156  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11950  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  28.22 
 
 
322 aa  55.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274992  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1255  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.05 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.410518  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.8 
 
 
324 aa  54.7  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.927449  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8881  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.77 
 
 
341 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.282171  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1297  saccharopine dehydrogenase related protein  19.51 
 
 
305 aa  54.3  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.36 
 
 
325 aa  52  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.470047  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  24.47 
 
 
334 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.57 
 
 
319 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.357446  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0206  hypothetical protein  27.61 
 
 
282 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3989  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.11 
 
 
332 aa  50.8  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5980  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.07 
 
 
292 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.853501  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.6 
 
 
312 aa  50.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.716604  normal  0.0199185 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1215  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.57 
 
 
329 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.190053  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5154  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.4 
 
 
274 aa  49.7  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.0433393 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.08 
 
 
304 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2558  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.7 
 
 
335 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.41 
 
 
328 aa  47.8  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0058  dihydrokaempferol 4-reductase  27.15 
 
 
333 aa  48.1  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.04 
 
 
273 aa  48.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.69 
 
 
315 aa  48.5  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0943322  normal  0.641054 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1783  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.85 
 
 
334 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.81312  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.01 
 
 
318 aa  48.5  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1920  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.27 
 
 
346 aa  47.8  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.892292  hitchhiker  0.000398816 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3058  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.36 
 
 
350 aa  46.6  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0220  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.26 
 
 
368 aa  47  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.854455  normal  0.343267 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>