62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0601 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0397  hypothetical protein  100 
 
 
375 aa  779    Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000747895  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0601  hypothetical protein  100 
 
 
375 aa  779    Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252439  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2180  hypothetical protein  27.8 
 
 
422 aa  124  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.912338  normal  0.467765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0057  protein of unknown function DUF262  31.37 
 
 
341 aa  119  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.542599  normal  0.294632 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0643  protein of unknown function DUF262  28.41 
 
 
374 aa  116  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3053  hypothetical protein  27.68 
 
 
386 aa  116  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0782167  normal  0.0469245 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0970  hypothetical protein  27.21 
 
 
377 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0284438  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2955  hypothetical protein  27.96 
 
 
349 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3592  hypothetical protein  28.09 
 
 
402 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.467834  normal  0.0552296 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2583  protein of unknown function DUF262  32.57 
 
 
345 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.521519  normal  0.265896 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28245  predicted protein  29.64 
 
 
470 aa  109  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0794  hypothetical protein  26.3 
 
 
354 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1500  protein of unknown function DUF262  28.2 
 
 
377 aa  108  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604091  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0316  hypothetical protein  31.33 
 
 
399 aa  107  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3506  protein of unknown function DUF262  27.67 
 
 
370 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2610  protein of unknown function DUF262  27.67 
 
 
370 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.639774  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4224  protein of unknown function DUF262  28.52 
 
 
389 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4216  hypothetical protein  27.67 
 
 
390 aa  98.2  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0600221  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0064  hypothetical protein  24.8 
 
 
371 aa  96.3  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1427  protein of unknown function DUF262  28.2 
 
 
399 aa  96.3  8e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0682  hypothetical protein  27.92 
 
 
367 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000252163 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4975  hypothetical protein  29.38 
 
 
394 aa  94.4  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2195  hypothetical protein  29.5 
 
 
391 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.175958  normal  0.0733507 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3409  protein of unknown function DUF262  27.45 
 
 
368 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.115549 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2494  hypothetical protein  28.38 
 
 
375 aa  91.3  3e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0036317  normal  0.931696 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  31.17 
 
 
390 aa  90.5  5e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2372  protein of unknown function DUF262  25.87 
 
 
378 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0134  hypothetical protein  26.56 
 
 
375 aa  89.4  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50837  normal  0.0537097 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0608  hypothetical protein  28.68 
 
 
366 aa  89  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2954  protein of unknown function DUF262  29.88 
 
 
379 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2554  hypothetical protein  27.33 
 
 
368 aa  86.7  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.118621  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3547  hypothetical protein  28.57 
 
 
458 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0722197 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2969  protein of unknown function DUF262  28.29 
 
 
392 aa  85.9  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.901235  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4676  hypothetical protein  27.5 
 
 
369 aa  85.1  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.367432  normal  0.316472 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6233  protein of unknown function DUF262  27.1 
 
 
406 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001832  hypothetical protein  27.82 
 
 
539 aa  83.2  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1156  protein of unknown function DUF262  28.45 
 
 
409 aa  82.8  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1629  hypothetical protein  23.64 
 
 
365 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01779  hypothetical protein  27.78 
 
 
650 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0765  hypothetical protein  25.07 
 
 
617 aa  79.7  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.390072  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1461  hypothetical protein  29.83 
 
 
375 aa  79.7  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.743576  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1797  hypothetical protein  25.45 
 
 
375 aa  79  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0706  hypothetical protein  29.3 
 
 
370 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0278  hypothetical protein  27.65 
 
 
397 aa  77.8  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00101516 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3373  hypothetical protein  29.08 
 
 
353 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1028  hypothetical protein  26.61 
 
 
638 aa  73.9  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4642  hypothetical protein  32.26 
 
 
396 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2977  hypothetical protein  30.92 
 
 
349 aa  66.2  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.197913  normal  0.982246 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2619  protein of unknown function DUF262  30.23 
 
 
343 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5280  protein of unknown function DUF262  27.03 
 
 
353 aa  64.3  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3484  protein of unknown function DUF262  26.15 
 
 
344 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0063  hypothetical protein  25 
 
 
363 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1158  HNH endonuclease  28.21 
 
 
360 aa  60.1  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.161614  normal  0.0199852 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2200  protein of unknown function DUF262  24.18 
 
 
589 aa  57.8  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.294339 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2248  hypothetical protein  25.79 
 
 
343 aa  57  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0486494 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0645  hypothetical protein  27.22 
 
 
330 aa  53.1  0.000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.17227  hitchhiker  0.000000224938 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3517  protein of unknown function DUF262  31.07 
 
 
159 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.161235  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1826  protein of unknown function DUF262  20.1 
 
 
546 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.143895  normal  0.368277 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2351  protein of unknown function DUF262  25 
 
 
221 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.67517  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2300  protein of unknown function DUF262  25 
 
 
221 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3198  hypothetical protein  25.14 
 
 
390 aa  43.1  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4280  hypothetical protein  32.39 
 
 
388 aa  42.7  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>