More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0570 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  100 
 
 		 438 aa  900    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0589  beta-lactamase  66.67 
 
 		 438 aa  614  1e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  39.15 
 
 		 424 aa  251  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  36.6 
 
 		 433 aa  246  6.999999999999999e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  37.75 
 
 		 414 aa  242  7.999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  38.68 
 
 		 426 aa  236  4e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  36.66 
 
 		 406 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  33.72 
 
 		 424 aa  226  8e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  34.91 
 
 		 447 aa  219  7e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  37.28 
 
 		 408 aa  219  7.999999999999999e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  35.12 
 
 		 454 aa  219  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  33.49 
 
 		 424 aa  218  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  37.19 
 
 		 427 aa  218  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  36.21 
 
 		 399 aa  216  7e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  34.44 
 
 		 399 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  34.17 
 
 		 420 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  33.19 
 
 		 445 aa  213  4.9999999999999996e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  34.69 
 
 		 453 aa  212  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  33.26 
 
 		 424 aa  211  1e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  33.88 
 
 		 440 aa  212  1e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  33.92 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  34.56 
 
 		 405 aa  210  4e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  33.65 
 
 		 411 aa  210  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  33.49 
 
 		 420 aa  209  7e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  34.1 
 
 		 402 aa  209  7e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  34.9 
 
 		 405 aa  209  1e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  34.18 
 
 		 438 aa  207  2e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  32.36 
 
 		 422 aa  207  3e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  33.33 
 
 		 411 aa  207  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  32.51 
 
 		 411 aa  200  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  34.79 
 
 		 405 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  32.68 
 
 		 419 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  33.26 
 
 		 418 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  34.35 
 
 		 414 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  32.24 
 
 		 408 aa  196  9e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  33.56 
 
 		 430 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  33.88 
 
 		 420 aa  196  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  34.79 
 
 		 452 aa  195  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  32.45 
 
 		 415 aa  193  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  32.36 
 
 		 407 aa  192  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  35 
 
 		 420 aa  192  9e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  35 
 
 		 420 aa  192  9e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0814  beta-lactamase  32.31 
 
 		 422 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  33.33 
 
 		 417 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6918  putative penicillin binding protein  32.99 
 
 		 422 aa  190  4e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  33.16 
 
 		 409 aa  190  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  34.01 
 
 		 423 aa  189  8e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  32.13 
 
 		 431 aa  189  9e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  33.82 
 
 		 414 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  33.08 
 
 		 407 aa  186  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  31.96 
 
 		 407 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  32.29 
 
 		 407 aa  184  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8863  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding protein  31.99 
 
 		 468 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  31.29 
 
 		 427 aa  182  1e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  31.88 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11398  hypothetical protein  35.11 
 
 		 401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  31.25 
 
 		 407 aa  180  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  32.38 
 
 		 426 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0454  beta-lactamase  33 
 
 		 409 aa  179  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  32.36 
 
 		 395 aa  179  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  30.23 
 
 		 613 aa  176  6e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  32.3 
 
 		 435 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  34.26 
 
 		 401 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  34.63 
 
 		 401 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  32.7 
 
 		 436 aa  172  9e-42  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  30.14 
 
 		 418 aa  172  1e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  30.63 
 
 		 395 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  32.74 
 
 		 440 aa  168  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3562  beta-lactamase  32 
 
 		 394 aa  167  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  33.68 
 
 		 401 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  33.68 
 
 		 401 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  33.42 
 
 		 401 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0253  beta-lactamase  30.08 
 
 		 395 aa  164  3e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0019  beta-lactamase  30 
 
 		 416 aa  163  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  32.14 
 
 		 410 aa  162  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6425  beta-lactamase  28.42 
 
 		 437 aa  162  1e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  32.24 
 
 		 444 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  31.92 
 
 		 430 aa  161  3e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0582  beta-lactamase  28.21 
 
 		 431 aa  159  6e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  31.14 
 
 		 425 aa  160  6e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  31.01 
 
 		 400 aa  159  7e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2750  beta-lactamase  33.86 
 
 		 437 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0463  beta-lactamase  29.84 
 
 		 395 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1611  beta-lactamase  30.27 
 
 		 411 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0035  putative beta-lactamase  29.79 
 
 		 397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.172625  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  29.67 
 
 		 391 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0961  twin-arginine translocation pathway signal  31.94 
 
 		 431 aa  146  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205968  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2265  twin-arginine translocation pathway signal  29.89 
 
 		 428 aa  145  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6049  Beta-lactamase  30.83 
 
 		 419 aa  143  8e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  28.64 
 
 		 412 aa  141  3e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2338  beta-lactamase  30.03 
 
 		 406 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461598  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  31.03 
 
 		 409 aa  140  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4066  beta-lactamase  28.21 
 
 		 385 aa  139  8.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.43014 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2251  beta-lactamase  28.43 
 
 		 432 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  27.45 
 
 		 382 aa  137  4e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  28.99 
 
 		 397 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2556  beta-lactamase  34.3 
 
 		 395 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4045  beta-lactamase  29.73 
 
 		 393 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2676  Beta-lactamase  29.93 
 
 		 393 aa  133  6.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688851  normal  0.936004 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2777  beta-lactamase  32.75 
 
 		 389 aa  132  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>