More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0556 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  473  1e-133  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1684  TetR family transcriptional regulator  48.83 
 
 		 227 aa  224  9e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 228 aa  204  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3099  TetR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.296713  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1704  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 285 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0517004  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0161  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 221 aa  118  6e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1498  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 183 aa  95.5  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.548232  normal  0.295378 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 205 aa  87.4  2e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4438  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 477 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.829211  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4328  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 477 aa  80.9  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0701267  normal  0.0216349 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6386  regulatory protein, TetR  28.57 
 
 		 510 aa  75.9  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4623  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.317667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4168  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 244 aa  68.6  0.00000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0511823  normal  0.17991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6862  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000147849  normal  0.19991 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3685  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  26.34 
 
 		 197 aa  58.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  28.15 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0596  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1139  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6831  TetR family transcriptional regulator  21.56 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1423  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  33.99 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1864  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.370614  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3397  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.15089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3708  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.59565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4350  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 212 aa  54.3  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 199 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2375  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 184 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.90143  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 207 aa  53.1  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2373  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 207 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2089  transcriptional regulator, TetR family  23.39 
 
 		 184 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.850407  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5031  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 258 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201359  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5829  TetR family transcriptional regulator  23.68 
 
 		 258 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 223 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2441  TetR family transcriptional regulator  24.67 
 
 		 205 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.21008  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2057  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0106608  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2858  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 225 aa  52.4  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.211856  hitchhiker  0.00171809 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3662  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 222 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3735  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 222 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  0.477586 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4614  transcriptional regulator, TetR family  25.3 
 
 		 191 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 215 aa  52.4  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  0.0000133916 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3675  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 222 aa  52.4  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 178 aa  52  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 192 aa  52  0.000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2506  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 205 aa  52  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.733789  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 194 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  42 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 181 aa  51.6  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  43.75 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4140  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.355658  normal  0.167189 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5380  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768843  normal  0.61228 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 226 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 178 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1647  transcriptional regulator, TetR family  24.82 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 168 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  31.58 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0959  TetR family transcriptional regulator  23.03 
 
 		 225 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1293  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38620  hypothetical protein  27.98 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1690  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.732657 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1753  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6843  TetR family transcriptional regulator  21.97 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.163651  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 183 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5593  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.531399  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2518  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 209 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1586  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 424 aa  49.7  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>