239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0510 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0510  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
316 aa  628  1e-179  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2727  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.62 
 
 
340 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.430894  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2988  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.62 
 
 
340 aa  339  4e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.865432  normal  0.0888549 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3203  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.81 
 
 
318 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3529  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.17 
 
 
318 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.016337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5995  NAD-dependent epimerase/dehydratase  57.19 
 
 
352 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0746307  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3335  hypothetical protein  56.05 
 
 
318 aa  320  1.9999999999999998e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.4 
 
 
340 aa  298  8e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.895804 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3144  hypothetical protein  50.81 
 
 
370 aa  294  2e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.428885  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0922  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.69 
 
 
327 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2723  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  54.05 
 
 
345 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2579  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  54.05 
 
 
345 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.62087  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0189  hypothetical protein  54.05 
 
 
332 aa  281  9e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0302861  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0998  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  54.36 
 
 
333 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1362  hypothetical protein  54.05 
 
 
345 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169729  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1558  hypothetical protein  54.05 
 
 
345 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0217  hypothetical protein  54.05 
 
 
345 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.644245  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5771  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.39 
 
 
338 aa  278  6e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.783154  normal  0.678603 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5493  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
325 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.299821 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3578  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
325 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4789  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50 
 
 
325 aa  275  7e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4696  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.41 
 
 
326 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.990453 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.68 
 
 
336 aa  270  2e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.316364  hitchhiker  0.00353615 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4174  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.26 
 
 
326 aa  269  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93932  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0650  NAD-dependent epimerase/dehydratase  48.46 
 
 
337 aa  266  4e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.349018  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1458  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.72 
 
 
326 aa  260  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.780601  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1636  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47 
 
 
324 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0710053 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3492  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.27 
 
 
335 aa  182  7e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.312033  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02816  NAD-dependent epimerase/dehydratase  55.13 
 
 
162 aa  149  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0126  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.08 
 
 
287 aa  138  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.86 
 
 
312 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2286  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.04 
 
 
321 aa  114  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5665  NmrA-like protein/nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.39 
 
 
324 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.783073 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1987  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 
328 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2329  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.82 
 
 
318 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51179  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02815  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.47 
 
 
122 aa  98.6  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3201  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.64 
 
 
309 aa  96.3  6e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3981  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.71 
 
 
317 aa  93.6  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0549387 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3451  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.21 
 
 
313 aa  91.3  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00141609  hitchhiker  0.00437395 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2321  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.94 
 
 
312 aa  90.5  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4419  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.8 
 
 
321 aa  89.7  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0046  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 
318 aa  89.7  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.582921 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2314  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.2 
 
 
307 aa  88.6  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0353  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.3 
 
 
344 aa  88.6  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.860754 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3608  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.25 
 
 
306 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2857  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
304 aa  87.8  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0027  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.03 
 
 
329 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535465  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2497  putative sugar dehydratase/epimerase  28.4 
 
 
332 aa  86.3  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.96633  normal  0.814546 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.09 
 
 
317 aa  85.9  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0894753  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4354  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.3 
 
 
321 aa  84.7  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5344  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.98 
 
 
352 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.72 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184838  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1740  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.35 
 
 
332 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.377476  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28 
 
 
326 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.354617  normal  0.0815308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6997  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.97 
 
 
304 aa  83.2  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0030  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.24 
 
 
329 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5717  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.3 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0127633 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.24 
 
 
329 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3615  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.63 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.036254  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.99 
 
 
319 aa  77  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.875328  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001158  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.61 
 
 
314 aa  75.9  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1426  NAD-dependent epimerase/dehydratase  23.9 
 
 
316 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2822  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.39 
 
 
314 aa  74.3  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1542  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.17 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4635  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.78 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0341156  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4766  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.87 
 
 
308 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.504553  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.86 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1559  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.42 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00329554  normal  0.0368212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1823  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.39 
 
 
301 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3195  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.63 
 
 
311 aa  69.7  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.67739  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1297  saccharopine dehydrogenase related protein  20.51 
 
 
305 aa  68.6  0.0000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.94 
 
 
309 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.39 
 
 
316 aa  67  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.765071  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0868  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.9 
 
 
311 aa  62.4  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3104  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.9 
 
 
311 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2079  NmrA family protein  27.71 
 
 
605 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.01 
 
 
312 aa  61.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.716604  normal  0.0199185 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2548  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.86 
 
 
357 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.211068 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1701  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.55 
 
 
307 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.517647  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1255  NAD-dependent epimerase/dehydratase:3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  27.91 
 
 
325 aa  59.7  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.410518  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02116  NAD dependent epimerase/dehydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G00180)  26.28 
 
 
316 aa  58.9  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.218731  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2985  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.23 
 
 
324 aa  58.9  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.927449  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0837  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.95 
 
 
311 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2297  NAD-dependent epimerase/dehydratase  22.93 
 
 
310 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1143  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.02 
 
 
325 aa  55.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.470047  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4379  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.59 
 
 
274 aa  55.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.601592  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2851  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.14 
 
 
311 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.37 
 
 
320 aa  53.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0775  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.33 
 
 
223 aa  53.5  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.207414  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1529  NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30  44.16 
 
 
500 aa  52.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.935253 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1484  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.05 
 
 
319 aa  52.8  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.357446  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0485  Ketopantoate reductase ApbA/PanE domain protein  27.54 
 
 
281 aa  52.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0209  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.62 
 
 
307 aa  52.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0178809  hitchhiker  0.0040496 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1920  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  36 
 
 
328 aa  51.6  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23000  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  29.06 
 
 
310 aa  51.6  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.109037  normal  0.0324264 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.56 
 
 
270 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.82 
 
 
326 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.126896 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0817  NmrA family protein  42.11 
 
 
289 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2058  NmrA family protein  39.51 
 
 
506 aa  50.4  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.584993  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1322  NmrA family protein  28.57 
 
 
513 aa  50.8  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.180223  normal  0.0774954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>