More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0246 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0246  pentapeptide repeat-containing protein  100 
 
 
412 aa  792    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.81066  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  43.6 
 
 
420 aa  263  6e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1211  pentapeptide repeat-containing protein  42.28 
 
 
419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2500  pentapeptide repeat-containing protein  40.85 
 
 
433 aa  250  3e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5254  pentapeptide repeat protein  36.97 
 
 
449 aa  156  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.440739 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1482  pentapeptide repeat-containing protein  37.17 
 
 
392 aa  155  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0501113  normal  0.460509 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  33.82 
 
 
493 aa  135  1.9999999999999998e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  34.23 
 
 
576 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  37.33 
 
 
309 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  31.84 
 
 
862 aa  130  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0710  hypothetical protein  34.34 
 
 
381 aa  126  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.720138  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1231  pentapeptide repeat-containing protein  32.47 
 
 
363 aa  125  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.388459  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0761  pentapeptide repeat-containing protein  32.52 
 
 
1191 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.515894  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2701  pentapeptide repeat protein  30.63 
 
 
401 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3402  pentapeptide repeat protein  30.63 
 
 
401 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4398  pentapeptide repeat-containing protein  33.71 
 
 
521 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0324397  hitchhiker  0.0000237208 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1025  pentapeptide repeat protein  32.77 
 
 
333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00638756 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4721  pentapeptide repeat protein  35.76 
 
 
332 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.388862 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2697  pentapeptide repeat protein  31.32 
 
 
336 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.836174  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2344  pentapeptide repeat protein  36.65 
 
 
311 aa  120  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00177045 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3419  pentapeptide repeat protein  31.32 
 
 
336 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  32.94 
 
 
447 aa  116  7.999999999999999e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1750  pentapeptide repeat protein  28.54 
 
 
440 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2767  pentapeptide repeat protein  31.69 
 
 
408 aa  113  6e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3507  pentapeptide repeat-containing protein  33.02 
 
 
483 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  31.37 
 
 
401 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3276  pentapeptide repeat-containing protein  32.16 
 
 
319 aa  110  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.300085 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0209  pentapeptide repeat-containing protein  30.34 
 
 
446 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  33.85 
 
 
343 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  31.1 
 
 
401 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  33.85 
 
 
343 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  30.83 
 
 
340 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3417  pentapeptide repeat-containing protein  31.63 
 
 
448 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.462451  normal  0.146874 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0256  pentapeptide repeat protein  28.57 
 
 
442 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.306319  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2361  pentapeptide repeat protein  28.95 
 
 
450 aa  105  2e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2951  hypothetical protein  40.72 
 
 
286 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000137449  normal  0.0109171 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2700  pentapeptide repeat-containing protein  32.5 
 
 
517 aa  104  3e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0664303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3628  pentapeptide repeat protein  32.42 
 
 
320 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0225  pentapeptide repeat protein  27.4 
 
 
447 aa  103  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  31.99 
 
 
389 aa  102  1e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1201  pentapeptide repeat-containing protein  34.15 
 
 
515 aa  100  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0514272  normal  0.288763 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  43.15 
 
 
433 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3198  pentapeptide repeat protein  36.82 
 
 
294 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00492163 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  31.39 
 
 
872 aa  100  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1237  pentapeptide repeat-containing protein  31.22 
 
 
438 aa  99.8  7e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.234159 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2216  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 
267 aa  99.8  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000619186  normal  0.061553 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0532  pentapeptide repeat protein  31.95 
 
 
870 aa  99.8  9e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4112  pentapeptide repeat-containing protein  40.61 
 
 
278 aa  99.4  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.46 
 
 
14916 aa  98.6  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2556  pentapeptide repeat protein  32.01 
 
 
776 aa  97.8  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.684592 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5734  pentapeptide repeat protein  39.9 
 
 
266 aa  96.3  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  42.47 
 
 
213 aa  95.9  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2093  pentapeptide repeat-containing protein  29.32 
 
 
351 aa  95.9  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.391868 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  36.25 
 
 
441 aa  95.9  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1241  pentapeptide repeat protein  30.7 
 
 
412 aa  94.4  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0335657 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0392  pentapeptide repeat protein  37.95 
 
 
291 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0383  pentapeptide repeat protein  37.95 
 
 
291 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  38.43 
 
 
214 aa  93.2  7e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  32.92 
 
 
493 aa  93.2  7e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  37.56 
 
 
567 aa  92.8  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  43.2 
 
 
216 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  39.11 
 
 
184 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.339065 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  32.3 
 
 
386 aa  91.3  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3834  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 
264 aa  90.9  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  33.67 
 
 
734 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1224  hypothetical protein  39.56 
 
 
745 aa  90.5  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.605916  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1703  pentapeptide repeat protein  33.11 
 
 
295 aa  89.4  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.279305  normal  0.0241547 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1585  pentapeptide repeat-containing protein  38.33 
 
 
237 aa  89  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000106738  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4910  pentapeptide repeat-containing protein  36.24 
 
 
268 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.186605 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  38.38 
 
 
489 aa  89.4  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3780  pentapeptide repeat protein  30.28 
 
 
866 aa  89.4  1e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1785  pentapeptide repeat-containing protein  39.61 
 
 
250 aa  89.4  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2409  hypothetical protein  38 
 
 
234 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.862876  normal  0.116796 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0301  pentapeptide repeat-containing protein  40.64 
 
 
263 aa  88.2  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0605  pentapeptide repeat-containing protein  32.05 
 
 
727 aa  87  5e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000848072  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3757  pentapeptide repeat protein  36.09 
 
 
233 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.79073 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3704  pentapeptide repeat protein  36.09 
 
 
233 aa  87  6e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4520  pentapeptide repeat protein  33.98 
 
 
273 aa  86.7  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  35.44 
 
 
219 aa  85.9  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1083  pentapeptide repeat-containing protein  21.57 
 
 
607 aa  85.9  0.000000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.581758  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  40.1 
 
 
416 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4191  pentapeptide repeat-containing protein  29.26 
 
 
844 aa  85.1  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3191  pentapeptide repeat protein  40 
 
 
903 aa  85.1  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0671183 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2221  pentapeptide repeat protein  31.54 
 
 
262 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0412036 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  40.3 
 
 
1033 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1582  pentapeptide repeat-containing protein  42.56 
 
 
299 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00696223 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  41.3 
 
 
277 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1486  hypothetical protein  36.79 
 
 
225 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29092  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0533  pentapeptide repeat protein  27.92 
 
 
355 aa  84.7  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2033  pentapeptide repeat-containing protein  32 
 
 
877 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2159  pentapeptide repeat protein  31.54 
 
 
262 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2131  pentapeptide repeat-containing protein  32 
 
 
880 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2867  pentapeptide repeat protein  31.37 
 
 
881 aa  84.3  0.000000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.113451  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0870  pentapeptide repeat-containing protein  23.16 
 
 
635 aa  84  0.000000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0477  pentapeptide repeat protein  33.33 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.598187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3775  pentapeptide repeat-containing protein  36.62 
 
 
227 aa  83.6  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0500199 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0025  pentapeptide repeat-containing protein  26.92 
 
 
348 aa  84  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5145  pentapeptide repeat-containing protein  39.89 
 
 
456 aa  83.6  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  32.09 
 
 
309 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5569  pentapeptide repeat protein  37.25 
 
 
184 aa  83.6  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>